RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439246.5

ITGA9-AS1-206, ITGA9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA9-AS1, Length 3,139 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ITGA9-AS1-206ENST00000439246 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.24□□□□□ -0.13
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ITGA9-AS1-206ENST00000439246 CLIP1P30622 1438 aa14.22□□□□□ -0.13
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ITGA9-AS1-206ENST00000439246 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.18□□□□□ -0.14
ITGA9-AS1-206ENST00000439246 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
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ITGA9-AS1-206ENST00000439246 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.09□□□□□ -0.15
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