RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363507.1

SNORD56.3-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.3-201ENST00000363507 NISCHQ9Y2I1 1504 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa5.56□□□□□ -1.52
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
SNORD56.3-201ENST00000363507 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa5.53□□□□□ -1.52
SNORD56.3-201ENST00000363507 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SNORD56.3-201ENST00000363507 HRCP23327 699 aa5.45□□□□□ -1.54
SNORD56.3-201ENST00000363507 MYO15BQ96JP2 1530 aa5.43□□□□□ -1.54
SNORD56.3-201ENST00000363507 CHIC1Q5VXU3 224 aa5.4□□□□□ -1.54
SNORD56.3-201ENST00000363507 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa5.38□□□□□ -1.55
SNORD56.3-201ENST00000363507 PCGF6Q9BYE7 350 aa5.32□□□□□ -1.56
SNORD56.3-201ENST00000363507 ABCC9O60706 1549 aa5.27□□□□□ -1.57
SNORD56.3-201ENST00000363507 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SNORD56.3-201ENST00000363507 DCAF8L2P0C7V8 631 aa5.24□□□□□ -1.57
SNORD56.3-201ENST00000363507 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SNORD56.3-201ENST00000363507 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa5.2□□□□□ -1.58
SNORD56.3-201ENST00000363507 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SNORD56.3-201ENST00000363507 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa5.17□□□□□ -1.58
SNORD56.3-201ENST00000363507 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
SNORD56.3-201ENST00000363507 SCRIBQ14160 1630 aa5.15□□□□□ -1.59
SNORD56.3-201ENST00000363507 TRIM41Q8WV44 630 aa5.11□□□□□ -1.59
SNORD56.3-201ENST00000363507 NACADO15069 1562 aa5.08□□□□□ -1.6
SNORD56.3-201ENST00000363507 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.3-201ENST00000363507 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SNORD56.3-201ENST00000363507 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SNORD56.3-201ENST00000363507 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SNORD56.3-201ENST00000363507 MROH2BQ7Z745 1585 aa5.04□□□□□ -1.6
SNORD56.3-201ENST00000363507 WIZO95785 1651 aa5.03□□□□□ -1.6
SNORD56.3-201ENST00000363507 CECR2Q9BXF3 1484 aa5.02□□□□□ -1.61
SNORD56.3-201ENST00000363507 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
SNORD56.3-201ENST00000363507 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SNORD56.3-201ENST00000363507 MYT1Q01538 1121 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNORD56.3-201ENST00000363507 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
SNORD56.3-201ENST00000363507 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SNORD56.3-201ENST00000363507 EEA1Q15075 1411 aa4.97□□□□□ -1.61
SNORD56.3-201ENST00000363507 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
SNORD56.3-201ENST00000363507 CEP162Q5TB80 1403 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD56.3-201ENST00000363507 TNIKQ9UKE5 1360 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD56.3-201ENST00000363507 SMARCA4P51532 1647 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD56.3-201ENST00000363507 NEUROD1Q13562 356 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD56.3-201ENST00000363507 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNORD56.3-201ENST00000363507 EHMT2Q96KQ7 1210 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD56.3-201ENST00000363507 SMARCA2P51531 1590 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD56.3-201ENST00000363507 ABCC8Q09428 1581 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCDC88BA6NC98 1476 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD56.3-201ENST00000363507 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa4.92□□□□□ -1.62
SNORD56.3-201ENST00000363507 GOLGA3Q08378 1498 aa4.92□□□□□ -1.62
SNORD56.3-201ENST00000363507 KIF21BO75037 1637 aa4.9□□□□□ -1.62
SNORD56.3-201ENST00000363507 UNC13AQ9UPW8 1703 aa4.9□□□□□ -1.62
SNORD56.3-201ENST00000363507 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SNORD56.3-201ENST00000363507 SOGA1O94964 1423 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.3-201ENST00000363507 CSRNP3Q8WYN3 585 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.3-201ENST00000363507 CEP164Q9UPV0 1460 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.3-201ENST00000363507 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD56.3-201ENST00000363507 PEG3Q9GZU2 1588 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD56.3-201ENST00000363507 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD56.3-201ENST00000363507 UBTFP17480 764 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SNORD56.3-201ENST00000363507 CLSPNQ9HAW4 1339 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD56.3-201ENST00000363507 VPS8Q8N3P4 1428 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD56.3-201ENST00000363507 SYNJ1O43426 1573 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD56.3-201ENST00000363507 CLIP1P30622 1438 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD56.3-201ENST00000363507 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SNORD56.3-201ENST00000363507 MIER1Q8N108 512 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD56.3-201ENST00000363507 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SNORD56.3-201ENST00000363507 BICRAQ9NZM4 1560 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD56.3-201ENST00000363507 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SNORD56.3-201ENST00000363507 ERICH3Q5RHP9 1530 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD56.3-201ENST00000363507 TOP2BQ02880 1626 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD56.3-201ENST00000363507 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD56.3-201ENST00000363507 APLP2Q06481 763 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD56.3-201ENST00000363507 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD56.3-201ENST00000363507 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SNORD56.3-201ENST00000363507 CUX2O14529 1486 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD56.3-201ENST00000363507 ARAP1Q96P48 1450 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD56.3-201ENST00000363507 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD56.3-201ENST00000363507 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD56.3-201ENST00000363507 PRXQ9BXM0 1461 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD56.3-201ENST00000363507 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SNORD56.3-201ENST00000363507 MAP3K1Q13233 1512 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD56.3-201ENST00000363507 CCNB3Q8WWL7 1395 aa4.71□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 PRDM2Q13029 1718 aa4.71□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 HMGXB3Q12766 1538 aa4.71□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 KIF27Q86VH2 1401 aa4.71□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 CUX1P39880 1505 aa4.7□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 MAPKBP1O60336 1514 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 TIAM1Q13009 1591 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 CFAP43Q8NDM7 1665 aa4.68□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa4.68□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 ANP32EQ9BTT0 268 aa4.67□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa4.66□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 SETD5Q9C0A6 1442 aa4.66□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 NCAPD3P42695 1498 aa4.66□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 CFTRP13569 1480 aa4.65□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa4.65□□□□□ -1.66
SNORD56.3-201ENST00000363507 WDR97A6NE52 1622 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms