RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000204268.2

Prrt3-203, Transcript of Proline-rich transmembrane protein 3, mouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prrt3, Length 3,741 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Rhox8	Q6VSS7	320 aa		23.71	■■□□□ 1.39
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Nisch	Q80TM9	1593 aa		22.86	■■□□□ 1.25
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ehmt2	Q9Z148	1263 aa	Known RBP	22.29	■■□□□ 1.16
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Rpgrip1	Q9EPQ2	1331 aa		21.93	■■□□□ 1.1
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Abcc9	P70170	1546 aa		21.77	■■□□□ 1.08
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ccdc136	Q3TVA9	1136 aa		21.74	■■□□□ 1.07
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Acin1	Q9JIX8	1338 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ccdc180	J3QNE4	1664 aa		21.32	■■□□□ 1
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Abcc8	B2RUS7	1588 aa		21.27	■■□□□ 1
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Trim41	Q5NCC3	630 aa		21.17	■□□□□ 0.98
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Rtl1	Q7M732	1744 aa		21.13	■□□□□ 0.97
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Pcgf6	Q99NA9	353 aa		21	■□□□□ 0.95
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Gab3	Q8BSM5	595 aa		20.98	■□□□□ 0.95
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Gm35339	A0A140LHH9	1649 aa		20.97	■□□□□ 0.95
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Zeb1	Q64318	1117 aa		20.93	■□□□□ 0.94
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Hrc	G5E8J6	738 aa		20.92	■□□□□ 0.94
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cngb1	E1AZ71	1325 aa		20.85	■□□□□ 0.93
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Supt5h	O55201	1082 aa	Known RBP	20.66	■□□□□ 0.9
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Wdr66	E9Q743	1299 aa		20.48	■□□□□ 0.87
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Esf1	Q3V1V3	845 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Zcchc6	Q5BLK4	1491 aa	Known RBP	20.35	■□□□□ 0.85
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Dcaf1	Q80TR8	1506 aa		20.3	■□□□□ 0.84
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ubtf	P25976	765 aa	Known RBP	20.26	■□□□□ 0.83
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Las1l	A2BE28	776 aa	Known RBP	20.22	■□□□□ 0.83
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Myt1l	P97500	1187 aa		20.21	■□□□□ 0.83
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ppargc1b	Q8VHJ7	1014 aa		20.21	■□□□□ 0.83
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Nefm	P08553	848 aa		20.19	■□□□□ 0.82
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Neurod1	Q60867	357 aa		20.16	■□□□□ 0.82
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Mier1	Q5UAK0	511 aa		20.14	■□□□□ 0.81
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Chic1	Q8CBW7	227 aa		20.11	■□□□□ 0.81
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Rb1cc1	Q9ESK9	1588 aa		20.06	■□□□□ 0.8
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Npm2	Q80W85	207 aa		19.96	■□□□□ 0.79
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Sall2	Q9QX96	1004 aa		19.96	■□□□□ 0.79
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cep164	Q5DU05	1446 aa		19.9	■□□□□ 0.78
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cdk11b	P24788	784 aa	Known RBP	19.77	■□□□□ 0.76
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Nop58	Q6DFW4	536 aa	Known RBP	19.74	■□□□□ 0.75
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Csrnp3	P59055	597 aa		19.68	■□□□□ 0.74
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Baz1a	O88379	1555 aa		19.66	■□□□□ 0.74
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Gm38655	A0A286YDK6	273 aa		19.62	■□□□□ 0.73
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Rsf1	E9PWW9	1441 aa	Known RBP	19.59	■□□□□ 0.73
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cenpb	P27790	599 aa		19.56	■□□□□ 0.72
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Aebp2	Q9Z248	504 aa	Known RBP	19.56	■□□□□ 0.72
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ap3b1	Q9Z1T1	1105 aa		19.54	■□□□□ 0.72
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Plekhg3	Q4VAC9	1341 aa		19.53	■□□□□ 0.72
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Kdm5d	Q62240	1548 aa		19.51	■□□□□ 0.71
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Tonsl	Q6NZL6	1363 aa		19.5	■□□□□ 0.71
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Il27	Q8K3I6	234 aa		19.48	■□□□□ 0.71
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Anks4b	Q8K3X6	423 aa		19.48	■□□□□ 0.71
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	1700123L14Rik	Q3V2K7	440 aa		19.44	■□□□□ 0.7
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Clspn	Q80YR7	1315 aa		19.42	■□□□□ 0.7
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Brd4	Q9ESU6	1400 aa	Known RBP	19.42	■□□□□ 0.7
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ube2u	B1AUC4	352 aa		19.41	■□□□□ 0.7
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Eid3	Q3V124	375 aa		19.39	■□□□□ 0.69
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Nacad	Q5SWP3	1504 aa		19.38	■□□□□ 0.69
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ccdc88b	Q4QRL3	1481 aa		19.38	■□□□□ 0.69
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Mapk8ip2	Q9ERE9	830 aa		19.37	■□□□□ 0.69
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Scrib	Q80U72	1612 aa		19.36	■□□□□ 0.69
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Slc24a1	Q91WD8	1130 aa		19.32	■□□□□ 0.68
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Fam50a	Q9WV03	339 aa	Known RBP	19.25	■□□□□ 0.67
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Golga3	P55937	1487 aa		19.23	■□□□□ 0.67
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ncl	P09405	707 aa	Known RBP	19.16	■□□□□ 0.66
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Clip1	Q922J3	1391 aa		19.14	■□□□□ 0.66
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Aplp2	Q06335	707 aa		19.07	■□□□□ 0.64
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Lmod2	Q3UHZ5	550 aa		19.07	■□□□□ 0.64
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cecr2	E9Q2Z1	1453 aa		19.05	■□□□□ 0.64
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Smarca2	Q6DIC0	1577 aa		19.04	■□□□□ 0.64
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Tnnt3	Q9QZ47	272 aa		18.96	■□□□□ 0.63
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Stra8	P70278	393 aa		18.92	■□□□□ 0.62
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Eif5b	Q05D44	1216 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Safb	D3YXK2	937 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.62
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Myt1	Q8CFC2	1127 aa		18.86	■□□□□ 0.61
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Hnrnpul2	Q00PI9	745 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.61
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Crybg2	B7ZCC2	1516 aa		18.82	■□□□□ 0.6
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Sycp2	Q9CUU3	1500 aa		18.81	■□□□□ 0.6
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Synj1	Q8CHC4	1574 aa		18.79	■□□□□ 0.6
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Fam71e1	A1L3C1	212 aa		18.77	■□□□□ 0.59
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cep162	Q6ZQ06	1403 aa		18.76	■□□□□ 0.59
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Pelp1	Q9DBD5	1123 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cftr	P26361	1476 aa		18.73	■□□□□ 0.59
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ttbk1	Q6PCN3	1308 aa		18.69	■□□□□ 0.58
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Setd5	Q5XJV7	1441 aa		18.68	■□□□□ 0.58
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Blm	O88700	1416 aa		18.66	■□□□□ 0.58
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Rapgef2	Q8CHG7	1496 aa		18.66	■□□□□ 0.58
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Anp32a	O35381	247 aa		18.62	■□□□□ 0.57
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Nrdc	Q8BHG1	1161 aa		18.59	■□□□□ 0.57
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Chic2	Q9D9G3	165 aa		18.57	■□□□□ 0.56
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Calr4	Q3TQS0	420 aa		18.56	■□□□□ 0.56
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Eea1	Q8BL66	1411 aa		18.53	■□□□□ 0.56
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Npm1	Q61937	292 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Diexf	Q8BTT6	772 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Fmn1	Q05860	1466 aa		18.52	■□□□□ 0.55
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Hspa5	P20029	655 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ppp4r2	Q0VGB7	417 aa		18.46	■□□□□ 0.55
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	P3h3	Q8CG70	732 aa		18.44	■□□□□ 0.54
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Sin3a	Q60520	1274 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Kif15	Q6P9L6	1387 aa		18.4	■□□□□ 0.54
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Zbtb4	Q5F293	982 aa		18.39	■□□□□ 0.54
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Mrs2	Q5NCE8	434 aa		18.39	■□□□□ 0.54
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Zbtb7c	Q8VCZ7	619 aa		18.37	■□□□□ 0.53
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cc2d2a	Q8CFW7	1633 aa		18.36	■□□□□ 0.53

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 271.7 ms