RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000175146.1

Snord53-201, mousemouse

BASIC

Gene Snord53, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snord53-201ENSMUST00000175146 NischQ80TM9 1593 aa5.15□□□□□ -1.59
Snord53-201ENSMUST00000175146 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa5.01□□□□□ -1.61
Snord53-201ENSMUST00000175146 Abcc9P70170 1546 aa4.93□□□□□ -1.62
Snord53-201ENSMUST00000175146 Rhox8Q6VSS7 320 aa4.92□□□□□ -1.62
Snord53-201ENSMUST00000175146 Abcc8B2RUS7 1588 aa4.85□□□□□ -1.63
Snord53-201ENSMUST00000175146 Rtl1Q7M732 1744 aa4.77□□□□□ -1.65
Snord53-201ENSMUST00000175146 Ccdc180J3QNE4 1664 aa4.68□□□□□ -1.66
Snord53-201ENSMUST00000175146 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa4.54□□□□□ -1.68
Snord53-201ENSMUST00000175146 Dcaf1Q80TR8 1506 aa4.53□□□□□ -1.68
Snord53-201ENSMUST00000175146 HrcG5E8J6 738 aa4.51□□□□□ -1.69
Snord53-201ENSMUST00000175146 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa4.5□□□□□ -1.69
Snord53-201ENSMUST00000175146 Trim41Q5NCC3 630 aa4.49□□□□□ -1.69
Snord53-201ENSMUST00000175146 ScribQ80U72 1612 aa4.48□□□□□ -1.69
Snord53-201ENSMUST00000175146 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa4.47□□□□□ -1.69
Snord53-201ENSMUST00000175146 NacadQ5SWP3 1504 aa4.46□□□□□ -1.7
Snord53-201ENSMUST00000175146 Baz1aO88379 1555 aa4.44□□□□□ -1.7
Snord53-201ENSMUST00000175146 Kdm5dQ62240 1548 aa4.43□□□□□ -1.7
Snord53-201ENSMUST00000175146 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
Snord53-201ENSMUST00000175146 Crybg2B7ZCC2 1516 aa4.4□□□□□ -1.71
Snord53-201ENSMUST00000175146 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
Snord53-201ENSMUST00000175146 Cngb1E1AZ71 1325 aa4.36□□□□□ -1.71
Snord53-201ENSMUST00000175146 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
Snord53-201ENSMUST00000175146 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
Snord53-201ENSMUST00000175146 Sycp2Q9CUU3 1500 aa4.33□□□□□ -1.72
Snord53-201ENSMUST00000175146 Smarca2Q6DIC0 1577 aa4.31□□□□□ -1.72
Snord53-201ENSMUST00000175146 Gab3Q8BSM5 595 aa4.3□□□□□ -1.72
Snord53-201ENSMUST00000175146 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
Snord53-201ENSMUST00000175146 Cep164Q5DU05 1446 aa4.27□□□□□ -1.73
Snord53-201ENSMUST00000175146 Chic1Q8CBW7 227 aa4.26□□□□□ -1.73
Snord53-201ENSMUST00000175146 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa4.23□□□□□ -1.73
Snord53-201ENSMUST00000175146 Golga3P55937 1487 aa4.23□□□□□ -1.73
Snord53-201ENSMUST00000175146 BicraF8VPZ9 1578 aa4.2□□□□□ -1.74
Snord53-201ENSMUST00000175146 Synj1Q8CHC4 1574 aa4.2□□□□□ -1.74
Snord53-201ENSMUST00000175146 NefmP08553 848 aa4.19□□□□□ -1.74
Snord53-201ENSMUST00000175146 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
Snord53-201ENSMUST00000175146 Npm2Q80W85 207 aa4.18□□□□□ -1.74
Snord53-201ENSMUST00000175146 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa4.17□□□□□ -1.74
Snord53-201ENSMUST00000175146 Myt1lP97500 1187 aa4.17□□□□□ -1.74
Snord53-201ENSMUST00000175146 Pcgf6Q99NA9 353 aa4.17□□□□□ -1.74
Snord53-201ENSMUST00000175146 CftrP26361 1476 aa4.17□□□□□ -1.74
Snord53-201ENSMUST00000175146 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa4.17□□□□□ -1.74
Snord53-201ENSMUST00000175146 Mier1Q5UAK0 511 aa4.16□□□□□ -1.74
Snord53-201ENSMUST00000175146 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
Snord53-201ENSMUST00000175146 UbtfP25976 765 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
Snord53-201ENSMUST00000175146 Top2bQ64511 1612 aa4.13□□□□□ -1.75
Snord53-201ENSMUST00000175146 Zeb1Q64318 1117 aa4.13□□□□□ -1.75
Snord53-201ENSMUST00000175146 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa4.12□□□□□ -1.75
Snord53-201ENSMUST00000175146 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
Snord53-201ENSMUST00000175146 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
Snord53-201ENSMUST00000175146 Fmn1Q05860 1466 aa4.11□□□□□ -1.75
Snord53-201ENSMUST00000175146 Il27Q8K3I6 234 aa4.1□□□□□ -1.75
Snord53-201ENSMUST00000175146 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
Snord53-201ENSMUST00000175146 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
Snord53-201ENSMUST00000175146 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa4.09□□□□□ -1.75
Snord53-201ENSMUST00000175146 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa4.07□□□□□ -1.76
Snord53-201ENSMUST00000175146 Clip1Q922J3 1391 aa4.07□□□□□ -1.76
Snord53-201ENSMUST00000175146 Cep162Q6ZQ06 1403 aa4.06□□□□□ -1.76
Snord53-201ENSMUST00000175146 Wdr66E9Q743 1299 aa4.06□□□□□ -1.76
Snord53-201ENSMUST00000175146 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
Snord53-201ENSMUST00000175146 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
Snord53-201ENSMUST00000175146 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa4.04□□□□□ -1.76
Snord53-201ENSMUST00000175146 Ubl4bQ9CQ84 188 aa4.04□□□□□ -1.76
Snord53-201ENSMUST00000175146 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa4.04□□□□□ -1.76
Snord53-201ENSMUST00000175146 Ercc6F8VPZ5 1481 aa4.04□□□□□ -1.76
Snord53-201ENSMUST00000175146 TonslQ6NZL6 1363 aa4.02□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 Kif15Q6P9L6 1387 aa4.02□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 Frmpd1A2AKB4 1549 aa4.01□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 Ccdc18Q640L5 1455 aa4.01□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 Sall2Q9QX96 1004 aa4.01□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 Lamc3Q9R0B6 1581 aa3.99□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 Setd5Q5XJV7 1441 aa3.99□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 Eea1Q8BL66 1411 aa3.99□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 Wdr62Q3U3T8 1523 aa3.99□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 Unc13aQ4KUS2 1712 aa3.98□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 TnnQ80Z71 1560 aa3.98□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 ClspnQ80YR7 1315 aa3.97□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 BlmO88700 1416 aa3.97□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 Ube2uB1AUC4 352 aa3.97□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 Arhgap35Q91YM2 1499 aa3.97□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 NrkQ9R0G8 1455 aa3.97□□□□□ -1.77
Snord53-201ENSMUST00000175146 Lmod2Q3UHZ5 550 aa3.96□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Shroom4Q1W617 1475 aa3.96□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 PtprkP35822 1457 aa3.95□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Ccer2J3QPU5 274 aa3.95□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Neurod1Q60867 357 aa3.95□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Cux2P70298 1426 aa3.95□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Camsap1A2AHC3 1581 aa3.94□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Anks4bQ8K3X6 423 aa3.94□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa3.94□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa3.94□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Grin2bQ01097 1482 aa3.93□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Baz1bQ9Z277 1479 aa3.93□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Efcab5A0JP43 1406 aa3.93□□□□□ -1.78
Snord53-201ENSMUST00000175146 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.3 ms