RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000168206.7

Nisch-213, Transcript of Nischarin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 4,990 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-213ENSMUST00000168206 NischQ80TM9 1593 aa23.3■■□□□ 1.32
Nisch-213ENSMUST00000168206 Rhox8Q6VSS7 320 aa23.19■■□□□ 1.3
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Nisch-213ENSMUST00000168206 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa22.03■■□□□ 1.12
Nisch-213ENSMUST00000168206 Abcc8B2RUS7 1588 aa21.84■■□□□ 1.09
Nisch-213ENSMUST00000168206 Trim41Q5NCC3 630 aa21■□□□□ 0.95
Nisch-213ENSMUST00000168206 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa20.93■□□□□ 0.94
Nisch-213ENSMUST00000168206 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Nisch-213ENSMUST00000168206 Rtl1Q7M732 1744 aa20.76■□□□□ 0.91
Nisch-213ENSMUST00000168206 NacadQ5SWP3 1504 aa20.66■□□□□ 0.9
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Nisch-213ENSMUST00000168206 Dcaf1Q80TR8 1506 aa20.47■□□□□ 0.87
Nisch-213ENSMUST00000168206 Ccdc180J3QNE4 1664 aa20.44■□□□□ 0.86
Nisch-213ENSMUST00000168206 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa20.42■□□□□ 0.86
Nisch-213ENSMUST00000168206 Kdm5dQ62240 1548 aa20.21■□□□□ 0.83
Nisch-213ENSMUST00000168206 Baz1aO88379 1555 aa20.13■□□□□ 0.81
Nisch-213ENSMUST00000168206 Npm2Q80W85 207 aa20.03■□□□□ 0.8
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Nisch-213ENSMUST00000168206 Zeb1Q64318 1117 aa20.01■□□□□ 0.79
Nisch-213ENSMUST00000168206 ScribQ80U72 1612 aa19.94■□□□□ 0.78
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Nisch-213ENSMUST00000168206 Sycp2Q9CUU3 1500 aa19.86■□□□□ 0.77
Nisch-213ENSMUST00000168206 Crybg2B7ZCC2 1516 aa19.8■□□□□ 0.76
Nisch-213ENSMUST00000168206 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
Nisch-213ENSMUST00000168206 Il27Q8K3I6 234 aa19.67■□□□□ 0.74
Nisch-213ENSMUST00000168206 Myt1lP97500 1187 aa19.62■□□□□ 0.73
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Nisch-213ENSMUST00000168206 Ercc6F8VPZ5 1481 aa19.59■□□□□ 0.73
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Nisch-213ENSMUST00000168206 Golga3P55937 1487 aa19.24■□□□□ 0.67
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Nisch-213ENSMUST00000168206 Cep164Q5DU05 1446 aa19.17■□□□□ 0.66
Nisch-213ENSMUST00000168206 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
Nisch-213ENSMUST00000168206 Kif15Q6P9L6 1387 aa19.1■□□□□ 0.65
Nisch-213ENSMUST00000168206 NefmP08553 848 aa19.06■□□□□ 0.64
Nisch-213ENSMUST00000168206 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
Nisch-213ENSMUST00000168206 Ccdc18Q640L5 1455 aa19.05■□□□□ 0.64
Nisch-213ENSMUST00000168206 CftrP26361 1476 aa19.01■□□□□ 0.63
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Nisch-213ENSMUST00000168206 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa18.95■□□□□ 0.62
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Nisch-213ENSMUST00000168206 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa18.9■□□□□ 0.62
Nisch-213ENSMUST00000168206 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa18.85■□□□□ 0.61
Nisch-213ENSMUST00000168206 Fmn1Q05860 1466 aa18.85■□□□□ 0.61
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Nisch-213ENSMUST00000168206 Clip1Q922J3 1391 aa18.65■□□□□ 0.58
Nisch-213ENSMUST00000168206 Cux2P70298 1426 aa18.63■□□□□ 0.57
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Nisch-213ENSMUST00000168206 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
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Nisch-213ENSMUST00000168206 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa18.44■□□□□ 0.54
Nisch-213ENSMUST00000168206 Setd5Q5XJV7 1441 aa18.43■□□□□ 0.54
Nisch-213ENSMUST00000168206 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa18.42■□□□□ 0.54
Nisch-213ENSMUST00000168206 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Nisch-213ENSMUST00000168206 Baz1bQ9Z277 1479 aa18.41■□□□□ 0.54
Nisch-213ENSMUST00000168206 Frmpd1A2AKB4 1549 aa18.4■□□□□ 0.54
Nisch-213ENSMUST00000168206 Eea1Q8BL66 1411 aa18.39■□□□□ 0.53
Nisch-213ENSMUST00000168206 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
Nisch-213ENSMUST00000168206 Wdr62Q3U3T8 1523 aa18.37■□□□□ 0.53
Nisch-213ENSMUST00000168206 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa18.35■□□□□ 0.53
Nisch-213ENSMUST00000168206 Ccer2J3QPU5 274 aa18.29■□□□□ 0.52
Nisch-213ENSMUST00000168206 Cep162Q6ZQ06 1403 aa18.28■□□□□ 0.52
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Nisch-213ENSMUST00000168206 BlmO88700 1416 aa18.27■□□□□ 0.52
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Nisch-213ENSMUST00000168206 CenpbP27790 599 aa18.25■□□□□ 0.51
Nisch-213ENSMUST00000168206 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa18.24■□□□□ 0.51
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Nisch-213ENSMUST00000168206 Carmil1Q6EDY6 1374 aa18.2■□□□□ 0.5
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Nisch-213ENSMUST00000168206 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa18.17■□□□□ 0.5
Nisch-213ENSMUST00000168206 TonslQ6NZL6 1363 aa18.16■□□□□ 0.5
Nisch-213ENSMUST00000168206 Rpap1Q80TE0 1409 aa18.14■□□□□ 0.5
Nisch-213ENSMUST00000168206 Slc24a1Q91WD8 1130 aa18.12■□□□□ 0.49
Nisch-213ENSMUST00000168206 Clstn2Q9ER65 966 aa18.12■□□□□ 0.49
Nisch-213ENSMUST00000168206 NrdcQ8BHG1 1161 aa18.11■□□□□ 0.49
Nisch-213ENSMUST00000168206 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
Nisch-213ENSMUST00000168206 NrkQ9R0G8 1455 aa18.08■□□□□ 0.48
Nisch-213ENSMUST00000168206 Top2bQ64511 1612 aa18.08■□□□□ 0.48
Nisch-213ENSMUST00000168206 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa18.07■□□□□ 0.48
Nisch-213ENSMUST00000168206 Lamc3Q9R0B6 1581 aa18.07■□□□□ 0.48
Nisch-213ENSMUST00000168206 Tnnt3Q9QZ47 272 aa18.07■□□□□ 0.48
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