RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000162004.7

Hps1-208, Transcript of Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hps1, Length 2,847 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1-208ENSMUST00000162004 NischQ80TM9 1593 aa25.85■■□□□ 1.73
Hps1-208ENSMUST00000162004 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa25.51■■□□□ 1.67
Hps1-208ENSMUST00000162004 Abcc9P70170 1546 aa25.11■■□□□ 1.61
Hps1-208ENSMUST00000162004 Abcc8B2RUS7 1588 aa24.59■■□□□ 1.53
Hps1-208ENSMUST00000162004 Rhox8Q6VSS7 320 aa23.78■■□□□ 1.4
Hps1-208ENSMUST00000162004 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa23.48■■□□□ 1.35
Hps1-208ENSMUST00000162004 Rtl1Q7M732 1744 aa23.45■■□□□ 1.35
Hps1-208ENSMUST00000162004 Ccdc180J3QNE4 1664 aa23■■□□□ 1.27
Hps1-208ENSMUST00000162004 Dcaf1Q80TR8 1506 aa22.96■■□□□ 1.27
Hps1-208ENSMUST00000162004 ScribQ80U72 1612 aa22.95■■□□□ 1.27
Hps1-208ENSMUST00000162004 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa22.65■■□□□ 1.22
Hps1-208ENSMUST00000162004 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Hps1-208ENSMUST00000162004 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Hps1-208ENSMUST00000162004 Kdm5dQ62240 1548 aa22.52■■□□□ 1.19
Hps1-208ENSMUST00000162004 Baz1aO88379 1555 aa22.39■■□□□ 1.17
Hps1-208ENSMUST00000162004 NacadQ5SWP3 1504 aa22.37■■□□□ 1.17
Hps1-208ENSMUST00000162004 Pcgf6Q99NA9 353 aa22.2■■□□□ 1.14
Hps1-208ENSMUST00000162004 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa22.05■■□□□ 1.12
Hps1-208ENSMUST00000162004 Crybg2B7ZCC2 1516 aa22.03■■□□□ 1.12
Hps1-208ENSMUST00000162004 HrcG5E8J6 738 aa21.9■■□□□ 1.1
Hps1-208ENSMUST00000162004 Sycp2Q9CUU3 1500 aa21.88■■□□□ 1.09
Hps1-208ENSMUST00000162004 Smarca2Q6DIC0 1577 aa21.87■■□□□ 1.09
Hps1-208ENSMUST00000162004 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
Hps1-208ENSMUST00000162004 Trim41Q5NCC3 630 aa21.66■■□□□ 1.06
Hps1-208ENSMUST00000162004 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
Hps1-208ENSMUST00000162004 Neurod1Q60867 357 aa21.4■■□□□ 1.02
Hps1-208ENSMUST00000162004 BicraF8VPZ9 1578 aa21.39■■□□□ 1.01
Hps1-208ENSMUST00000162004 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
Hps1-208ENSMUST00000162004 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa21.33■■□□□ 1.01
Hps1-208ENSMUST00000162004 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
Hps1-208ENSMUST00000162004 Cep164Q5DU05 1446 aa21.29■■□□□ 1
Hps1-208ENSMUST00000162004 Synj1Q8CHC4 1574 aa21.16■□□□□ 0.98
Hps1-208ENSMUST00000162004 Cngb1E1AZ71 1325 aa21.12■□□□□ 0.97
Hps1-208ENSMUST00000162004 Golga3P55937 1487 aa21.09■□□□□ 0.97
Hps1-208ENSMUST00000162004 CftrP26361 1476 aa21.05■□□□□ 0.96
Hps1-208ENSMUST00000162004 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
Hps1-208ENSMUST00000162004 Chic1Q8CBW7 227 aa20.98■□□□□ 0.95
Hps1-208ENSMUST00000162004 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa20.96■□□□□ 0.95
Hps1-208ENSMUST00000162004 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Hps1-208ENSMUST00000162004 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa20.92■□□□□ 0.94
Hps1-208ENSMUST00000162004 Myt1Q8CFC2 1127 aa20.91■□□□□ 0.94
Hps1-208ENSMUST00000162004 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa20.91■□□□□ 0.94
Hps1-208ENSMUST00000162004 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Hps1-208ENSMUST00000162004 Top2bQ64511 1612 aa20.86■□□□□ 0.93
Hps1-208ENSMUST00000162004 Anks4bQ8K3X6 423 aa20.86■□□□□ 0.93
Hps1-208ENSMUST00000162004 NefmP08553 848 aa20.79■□□□□ 0.92
Hps1-208ENSMUST00000162004 Zeb1Q64318 1117 aa20.78■□□□□ 0.92
Hps1-208ENSMUST00000162004 Gab3Q8BSM5 595 aa20.77■□□□□ 0.92
Hps1-208ENSMUST00000162004 CenpbP27790 599 aa20.75■□□□□ 0.91
Hps1-208ENSMUST00000162004 Sall2Q9QX96 1004 aa20.7■□□□□ 0.9
Hps1-208ENSMUST00000162004 Csrnp3P59055 597 aa20.69■□□□□ 0.9
Hps1-208ENSMUST00000162004 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa20.64■□□□□ 0.9
Hps1-208ENSMUST00000162004 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa20.64■□□□□ 0.89
Hps1-208ENSMUST00000162004 Aplp2Q06335 707 aa20.58■□□□□ 0.89
Hps1-208ENSMUST00000162004 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Hps1-208ENSMUST00000162004 Fmn1Q05860 1466 aa20.56■□□□□ 0.88
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Hps1-208ENSMUST00000162004 Mier1Q5UAK0 511 aa20.48■□□□□ 0.87
Hps1-208ENSMUST00000162004 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Hps1-208ENSMUST00000162004 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa20.4■□□□□ 0.86
Hps1-208ENSMUST00000162004 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Hps1-208ENSMUST00000162004 TnnQ80Z71 1560 aa20.25■□□□□ 0.83
Hps1-208ENSMUST00000162004 Wdr62Q3U3T8 1523 aa20.24■□□□□ 0.83
Hps1-208ENSMUST00000162004 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Hps1-208ENSMUST00000162004 Frmpd1A2AKB4 1549 aa20.24■□□□□ 0.83
Hps1-208ENSMUST00000162004 Cep162Q6ZQ06 1403 aa20.22■□□□□ 0.83
Hps1-208ENSMUST00000162004 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Hps1-208ENSMUST00000162004 ClspnQ80YR7 1315 aa20.17■□□□□ 0.82
Hps1-208ENSMUST00000162004 Wdr66E9Q743 1299 aa20.15■□□□□ 0.82
Hps1-208ENSMUST00000162004 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Hps1-208ENSMUST00000162004 Ercc6F8VPZ5 1481 aa20.12■□□□□ 0.81
Hps1-208ENSMUST00000162004 Lamc3Q9R0B6 1581 aa20.1■□□□□ 0.81
Hps1-208ENSMUST00000162004 Npm2Q80W85 207 aa20.1■□□□□ 0.81
Hps1-208ENSMUST00000162004 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
Hps1-208ENSMUST00000162004 Myt1lP97500 1187 aa20.07■□□□□ 0.8
Hps1-208ENSMUST00000162004 Unc13aQ4KUS2 1712 aa20.02■□□□□ 0.8
Hps1-208ENSMUST00000162004 Bcl11aQ9QYE3 773 aa20■□□□□ 0.79
Hps1-208ENSMUST00000162004 Kif15Q6P9L6 1387 aa20■□□□□ 0.79
Hps1-208ENSMUST00000162004 Gm38655A0A286YDK6 273 aa19.97■□□□□ 0.79
Hps1-208ENSMUST00000162004 UbtfP25976 765 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
Hps1-208ENSMUST00000162004 NrkQ9R0G8 1455 aa19.93■□□□□ 0.78
Hps1-208ENSMUST00000162004 Camsap1A2AHC3 1581 aa19.92■□□□□ 0.78
Hps1-208ENSMUST00000162004 PtprkP35822 1457 aa19.91■□□□□ 0.78
Hps1-208ENSMUST00000162004 Arhgap35Q91YM2 1499 aa19.91■□□□□ 0.78
Hps1-208ENSMUST00000162004 Clip1Q922J3 1391 aa19.9■□□□□ 0.78
Hps1-208ENSMUST00000162004 Il27Q8K3I6 234 aa19.87■□□□□ 0.77
Hps1-208ENSMUST00000162004 Shroom4Q1W617 1475 aa19.86■□□□□ 0.77
Hps1-208ENSMUST00000162004 Ccdc18Q640L5 1455 aa19.83■□□□□ 0.76
Hps1-208ENSMUST00000162004 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
Hps1-208ENSMUST00000162004 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
Hps1-208ENSMUST00000162004 Fam71e1A1L3C1 212 aa19.8■□□□□ 0.76
Hps1-208ENSMUST00000162004 Map3k1P53349 1493 aa19.77■□□□□ 0.76
Hps1-208ENSMUST00000162004 Grin2bQ01097 1482 aa19.77■□□□□ 0.76
Hps1-208ENSMUST00000162004 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa19.75■□□□□ 0.75
Hps1-208ENSMUST00000162004 TonslQ6NZL6 1363 aa19.74■□□□□ 0.75
Hps1-208ENSMUST00000162004 Eea1Q8BL66 1411 aa19.73■□□□□ 0.75
Hps1-208ENSMUST00000162004 Tnnt3Q9QZ47 272 aa19.73■□□□□ 0.75
Hps1-208ENSMUST00000162004 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa19.72■□□□□ 0.75
Hps1-208ENSMUST00000162004 Arap1Q4LDD4 1452 aa19.68■□□□□ 0.74
Hps1-208ENSMUST00000162004 Cux2P70298 1426 aa19.67■□□□□ 0.74
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