RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000120689.7

Nek1-202, Transcript of Serine/threonine-protein kinase Nek1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nek1, Length 5,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek1-202ENSMUST00000120689 Rhox8Q6VSS7 320 aa26.12■■□□□ 1.77
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Nek1-202ENSMUST00000120689 Cngb1E1AZ71 1325 aa24.19■■□□□ 1.46
Nek1-202ENSMUST00000120689 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Nek1-202ENSMUST00000120689 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Nek1-202ENSMUST00000120689 Wdr66E9Q743 1299 aa23.53■■□□□ 1.36
Nek1-202ENSMUST00000120689 Zeb1Q64318 1117 aa23.26■■□□□ 1.31
Nek1-202ENSMUST00000120689 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa23.24■■□□□ 1.31
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Nek1-202ENSMUST00000120689 CenpbP27790 599 aa23.05■■□□□ 1.28
Nek1-202ENSMUST00000120689 Amer1Q7TS75 1132 aa22.88■■□□□ 1.25
Nek1-202ENSMUST00000120689 Trim41Q5NCC3 630 aa22.82■■□□□ 1.24
Nek1-202ENSMUST00000120689 Ube2uB1AUC4 352 aa22.82■■□□□ 1.24
Nek1-202ENSMUST00000120689 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Nek1-202ENSMUST00000120689 Gab3Q8BSM5 595 aa22.71■■□□□ 1.23
Nek1-202ENSMUST00000120689 NefmP08553 848 aa22.52■■□□□ 1.2
Nek1-202ENSMUST00000120689 Npm2Q80W85 207 aa22.52■■□□□ 1.2
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Nek1-202ENSMUST00000120689 Myt1Q8CFC2 1127 aa22.45■■□□□ 1.18
Nek1-202ENSMUST00000120689 Myt1lP97500 1187 aa22.32■■□□□ 1.16
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Nek1-202ENSMUST00000120689 Pcgf6Q99NA9 353 aa22.16■■□□□ 1.14
Nek1-202ENSMUST00000120689 Slc24a1Q91WD8 1130 aa22.11■■□□□ 1.13
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Nek1-202ENSMUST00000120689 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa22.08■■□□□ 1.12
Nek1-202ENSMUST00000120689 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa22.07■■□□□ 1.12
Nek1-202ENSMUST00000120689 Tnnt3Q9QZ47 272 aa21.96■■□□□ 1.11
Nek1-202ENSMUST00000120689 4933416C03RikQ3V063 378 aa21.95■■□□□ 1.1
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Nek1-202ENSMUST00000120689 HrcG5E8J6 738 aa21.81■■□□□ 1.08
Nek1-202ENSMUST00000120689 Rtl5Q5DTT4 599 aa21.67■■□□□ 1.06
Nek1-202ENSMUST00000120689 NrdcQ8BHG1 1161 aa21.66■■□□□ 1.06
Nek1-202ENSMUST00000120689 Il27Q8K3I6 234 aa21.64■■□□□ 1.05
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Nek1-202ENSMUST00000120689 Rtl1Q7M732 1744 aa21.63■■□□□ 1.05
Nek1-202ENSMUST00000120689 NeflP08551 543 aa21.6■■□□□ 1.05
Nek1-202ENSMUST00000120689 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
Nek1-202ENSMUST00000120689 Abcc9P70170 1546 aa21.6■■□□□ 1.05
Nek1-202ENSMUST00000120689 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Nek1-202ENSMUST00000120689 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
Nek1-202ENSMUST00000120689 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
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Nek1-202ENSMUST00000120689 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa21.42■■□□□ 1.02
Nek1-202ENSMUST00000120689 TonslQ6NZL6 1363 aa21.34■■□□□ 1.01
Nek1-202ENSMUST00000120689 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa21.32■■□□□ 1
Nek1-202ENSMUST00000120689 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
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Nek1-202ENSMUST00000120689 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa21.24■□□□□ 0.99
Nek1-202ENSMUST00000120689 Anp32aO35381 247 aa21.22■□□□□ 0.99
Nek1-202ENSMUST00000120689 Abcc8B2RUS7 1588 aa21.12■□□□□ 0.97
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Nek1-202ENSMUST00000120689 Sall2Q9QX96 1004 aa20.67■□□□□ 0.9
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Nek1-202ENSMUST00000120689 ArxO35085 564 aa20.47■□□□□ 0.87
Nek1-202ENSMUST00000120689 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa20.47■□□□□ 0.87
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Nek1-202ENSMUST00000120689 Nlrp6Q91WS2 869 aa20.45■□□□□ 0.86
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Nek1-202ENSMUST00000120689 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Nek1-202ENSMUST00000120689 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Nek1-202ENSMUST00000120689 CatipB9EKE5 520 aa20.32■□□□□ 0.84
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Nek1-202ENSMUST00000120689 Gm13697A2AK42 830 aa20.24■□□□□ 0.83
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Nek1-202ENSMUST00000120689 Erich6D3Z6S9 713 aa20.19■□□□□ 0.82
Nek1-202ENSMUST00000120689 Ccer2J3QPU5 274 aa20.18■□□□□ 0.82
Nek1-202ENSMUST00000120689 Lmod3E9QA62 571 aa20.16■□□□□ 0.82
Nek1-202ENSMUST00000120689 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Nek1-202ENSMUST00000120689 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa20.14■□□□□ 0.82
Nek1-202ENSMUST00000120689 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa20.13■□□□□ 0.81
Nek1-202ENSMUST00000120689 Fam71e1A1L3C1 212 aa20.12■□□□□ 0.81
Nek1-202ENSMUST00000120689 NacadQ5SWP3 1504 aa20.11■□□□□ 0.81
Nek1-202ENSMUST00000120689 Mrs2Q5NCE8 434 aa20.09■□□□□ 0.81
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