RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000116412.7

Ctu2-201, Transcript of Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctu2, Length 3,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2-201ENSMUST00000116412 NischQ80TM9 1593 aa26.52■■□□□ 1.84
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Abcc9P70170 1546 aa25.63■■□□□ 1.69
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Rhox8Q6VSS7 320 aa25.51■■□□□ 1.67
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa25.5■■□□□ 1.67
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Abcc8B2RUS7 1588 aa25.03■■□□□ 1.6
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Rtl1Q7M732 1744 aa24.36■■□□□ 1.49
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24.14■■□□□ 1.46
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa23.58■■□□□ 1.37
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa23.48■■□□□ 1.35
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa23.25■■□□□ 1.31
Ctu2-201ENSMUST00000116412 HrcG5E8J6 738 aa23.22■■□□□ 1.31
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Dcaf1Q80TR8 1506 aa23.22■■□□□ 1.31
Ctu2-201ENSMUST00000116412 ScribQ80U72 1612 aa23.16■■□□□ 1.3
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Trim41Q5NCC3 630 aa23.02■■□□□ 1.28
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Baz1aO88379 1555 aa22.93■■□□□ 1.26
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Kdm5dQ62240 1548 aa22.92■■□□□ 1.26
Ctu2-201ENSMUST00000116412 NacadQ5SWP3 1504 aa22.71■■□□□ 1.23
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Cngb1E1AZ71 1325 aa22.55■■□□□ 1.2
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Gab3Q8BSM5 595 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Cep164Q5DU05 1446 aa22.42■■□□□ 1.18
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Smarca2Q6DIC0 1577 aa22.36■■□□□ 1.17
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Pcgf6Q99NA9 353 aa22.34■■□□□ 1.17
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Crybg2B7ZCC2 1516 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Chic1Q8CBW7 227 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Sycp2Q9CUU3 1500 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa21.99■■□□□ 1.11
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Zeb1Q64318 1117 aa21.95■■□□□ 1.1
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa21.94■■□□□ 1.1
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Golga3P55937 1487 aa21.92■■□□□ 1.1
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Mier1Q5UAK0 511 aa21.8■■□□□ 1.08
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Synj1Q8CHC4 1574 aa21.77■■□□□ 1.08
Ctu2-201ENSMUST00000116412 NefmP08553 848 aa21.76■■□□□ 1.07
Ctu2-201ENSMUST00000116412 CftrP26361 1476 aa21.66■■□□□ 1.06
Ctu2-201ENSMUST00000116412 UbtfP25976 765 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Myt1lP97500 1187 aa21.62■■□□□ 1.05
Ctu2-201ENSMUST00000116412 BicraF8VPZ9 1578 aa21.59■■□□□ 1.05
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Npm2Q80W85 207 aa21.48■■□□□ 1.03
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Neurod1Q60867 357 aa21.42■■□□□ 1.02
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Sall2Q9QX96 1004 aa21.4■■□□□ 1.02
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Wdr66E9Q743 1299 aa21.4■■□□□ 1.02
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa21.37■■□□□ 1.01
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Top2bQ64511 1612 aa21.35■■□□□ 1.01
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa21.28■■□□□ 1
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Fmn1Q05860 1466 aa21.25■□□□□ 0.99
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa21.23■□□□□ 0.99
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Cep162Q6ZQ06 1403 aa21.19■□□□□ 0.98
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa21.19■□□□□ 0.98
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa21.15■□□□□ 0.98
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Clip1Q922J3 1391 aa21.1■□□□□ 0.97
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Il27Q8K3I6 234 aa21.1■□□□□ 0.97
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Ctu2-201ENSMUST00000116412 TonslQ6NZL6 1363 aa21.01■□□□□ 0.95
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa21■□□□□ 0.95
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa21■□□□□ 0.95
Ctu2-201ENSMUST00000116412 ClspnQ80YR7 1315 aa20.96■□□□□ 0.95
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Anks4bQ8K3X6 423 aa20.85■□□□□ 0.93
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Eid3Q3V124 375 aa20.79■□□□□ 0.92
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Csrnp3P59055 597 aa20.76■□□□□ 0.91
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Kif15Q6P9L6 1387 aa20.75■□□□□ 0.91
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Eea1Q8BL66 1411 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Setd5Q5XJV7 1441 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctu2-201ENSMUST00000116412 PtprkP35822 1457 aa20.69■□□□□ 0.9
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Arhgap35Q91YM2 1499 aa20.69■□□□□ 0.9
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa20.63■□□□□ 0.89
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Frmpd1A2AKB4 1549 aa20.6■□□□□ 0.89
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Arap1Q4LDD4 1452 aa20.59■□□□□ 0.89
Ctu2-201ENSMUST00000116412 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa20.59■□□□□ 0.89
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Lmod2Q3UHZ5 550 aa20.57■□□□□ 0.88
Ctu2-201ENSMUST00000116412 TnnQ80Z71 1560 aa20.55■□□□□ 0.88
Ctu2-201ENSMUST00000116412 BlmO88700 1416 aa20.55■□□□□ 0.88
Ctu2-201ENSMUST00000116412 NrkQ9R0G8 1455 aa20.53■□□□□ 0.88
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ercc6F8VPZ5 1481 aa20.5■□□□□ 0.87
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Shroom4Q1W617 1475 aa20.49■□□□□ 0.87
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Wdr62Q3U3T8 1523 aa20.49■□□□□ 0.87
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ccdc18Q640L5 1455 aa20.48■□□□□ 0.87
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa20.45■□□□□ 0.86
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa20.44■□□□□ 0.86
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Lamc3Q9R0B6 1581 aa20.44■□□□□ 0.86
Ctu2-201ENSMUST00000116412 NclP09405 707 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Baz1bQ9Z277 1479 aa20.41■□□□□ 0.86
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Gm38655A0A286YDK6 273 aa20.4■□□□□ 0.86
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Camsap1A2AHC3 1581 aa20.38■□□□□ 0.85
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ube2uB1AUC4 352 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.9 ms