RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111427.8

Pou2f1-205, Transcript of POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene Pou2f1, Length 13,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Rtl1Q7M732 1744 aa11,03□□□□□ -0,64
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa10,74□□□□□ -0,69
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Ccdc180J3QNE4 1664 aa10,37□□□□□ -0,75
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP10,14□□□□□ -0,79
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Cngb1E1AZ71 1325 aa10,12□□□□□ -0,79
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Rhox8Q6VSS7 320 aa9,85□□□□□ -0,83
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Myt1Q8CFC2 1127 aa9,84□□□□□ -0,83
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP9,77□□□□□ -0,84
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 NischQ80TM9 1593 aa9,77□□□□□ -0,85
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa9,49□□□□□ -0,89
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP9,48□□□□□ -0,89
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 CenpbP27790 599 aa9,41□□□□□ -0,9
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Stra8P70278 393 aa9,34□□□□□ -0,91
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 NefmP08553 848 aa9,28□□□□□ -0,92
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Wdr66E9Q743 1299 aa9,26□□□□□ -0,93
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Abcc9P70170 1546 aa9,26□□□□□ -0,93
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Rtl5Q5DTT4 599 aa9,23□□□□□ -0,93
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Amer1Q7TS75 1132 aa9,18□□□□□ -0,94
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Tnnt3Q9QZ47 272 aa9,12□□□□□ -0,95
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 HrcG5E8J6 738 aa9,09□□□□□ -0,95
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Dcaf1Q80TR8 1506 aa9,08□□□□□ -0,96
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Pcgf6Q99NA9 353 aa9,04□□□□□ -0,96
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Trim41Q5NCC3 630 aa9,03□□□□□ -0,96
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Zeb1Q64318 1117 aa9,02□□□□□ -0,97
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Neurod1Q60867 357 aa8,96□□□□□ -0,98
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP8,95□□□□□ -0,98
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP8,94□□□□□ -0,98
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP8,91□□□□□ -0,98
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa8,89□□□□□ -0,99
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP8,85□□□□□ -0,99
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa8,79□□□□□ -1
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Abcc8B2RUS7 1588 aa8,79□□□□□ -1
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP8,78□□□□□ -1
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Aplp2Q06335 707 aa8,75□□□□□ -1,01
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa8,72□□□□□ -1,01
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Anks4bQ8K3X6 423 aa8,72□□□□□ -1,01
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 NeflP08551 543 aa8,71□□□□□ -1,01
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 ClspnQ80YR7 1315 aa8,71□□□□□ -1,02
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Anp32aO35381 247 aa8,7□□□□□ -1,02
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Cep164Q5DU05 1446 aa8,7□□□□□ -1,02
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP8,66□□□□□ -1,02
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP8,62□□□□□ -1,03
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP8,62□□□□□ -1,03
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 4933416C03RikQ3V063 378 aa8,62□□□□□ -1,03
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 TonslQ6NZL6 1363 aa8,62□□□□□ -1,03
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Npm2Q80W85 207 aa8,58□□□□□ -1,04
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Ube2uB1AUC4 352 aa8,56□□□□□ -1,04
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 NrdcQ8BHG1 1161 aa8,56□□□□□ -1,04
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Baz1aO88379 1555 aa8,56□□□□□ -1,04
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa8,55□□□□□ -1,04
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Myt1lP97500 1187 aa8,53□□□□□ -1,04
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP8,51□□□□□ -1,05
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP8,51□□□□□ -1,05
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 UbtfP25976 765 aaKnown RBP8,5□□□□□ -1,05
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP8,48□□□□□ -1,05
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Gab3Q8BSM5 595 aa8,47□□□□□ -1,05
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 NclP09405 707 aaKnown RBP8,44□□□□□ -1,06
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP8,4□□□□□ -1,06
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Mier1Q5UAK0 511 aa8,38□□□□□ -1,07
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP8,38□□□□□ -1,07
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Csrnp3P59055 597 aa8,37□□□□□ -1,07
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Ccdc27Q3V036 639 aa8,35□□□□□ -1,07
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Ccer2J3QPU5 274 aa8,34□□□□□ -1,07
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 DaxxO35613 739 aa8,33□□□□□ -1,08
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa8,33□□□□□ -1,08
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Bcl11aQ9QYE3 773 aa8,31□□□□□ -1,08
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Smarca2Q6DIC0 1577 aa8,31□□□□□ -1,08
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Slc24a1Q91WD8 1130 aa8,31□□□□□ -1,08
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa8,3□□□□□ -1,08
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP8,29□□□□□ -1,08
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa8,29□□□□□ -1,08
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Calr4Q3TQS0 420 aa8,28□□□□□ -1,08
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Eea1Q8BL66 1411 aa8,27□□□□□ -1,09
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP8,26□□□□□ -1,09
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa8,26□□□□□ -1,09
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Crybg2B7ZCC2 1516 aa8,25□□□□□ -1,09
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 NacadQ5SWP3 1504 aa8,24□□□□□ -1,09
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa8,23□□□□□ -1,09
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Irx3P81067 507 aa8,22□□□□□ -1,09
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Htatsf1Q8BGC0 757 aa8,22□□□□□ -1,09
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Adam1bQ8R534 806 aa8,21□□□□□ -1,1
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Ak9G3UYQ4 1894 aa8,21□□□□□ -1,1
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Sall2Q9QX96 1004 aa8,19□□□□□ -1,1
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP8,18□□□□□ -1,1
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP8,18□□□□□ -1,1
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Trim44Q9QXA7 346 aa8,17□□□□□ -1,1
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Fam71e1A1L3C1 212 aa8,15□□□□□ -1,11
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP8,15□□□□□ -1,11
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Golga3P55937 1487 aa8,15□□□□□ -1,11
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 AU015836B2RUM3 263 aa8,14□□□□□ -1,11
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Mia2Q91ZV0 1396 aa8,13□□□□□ -1,11
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Unc13aQ4KUS2 1712 aa8,12□□□□□ -1,11
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa8,12□□□□□ -1,11
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Clip1Q922J3 1391 aa8,12□□□□□ -1,11
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Kif21aQ9QXL2 1672 aa8,12□□□□□ -1,11
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Ppm1gQ61074 542 aa8,11□□□□□ -1,11
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Kdm5dQ62240 1548 aa8,1□□□□□ -1,11
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Ccdc18Q640L5 1455 aa8,09□□□□□ -1,11
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Cux1P53564 1515 aa8,08□□□□□ -1,12
Pou2f1-205ENSMUST00000111427 Tnnt2P50752 301 aa8,06□□□□□ -1,12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20,4 ms