RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000062069.5

Ptgs1-201, Transcript of Prostaglandin G/H synthase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptgs1, Length 2,867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 NischQ80TM9 1593 aa28.99■■■□□ 2.23
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa28.2■■■□□ 2.1
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Abcc9P70170 1546 aa28.12■■■□□ 2.09
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Abcc8B2RUS7 1588 aa27.41■■□□□ 1.98
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Rhox8Q6VSS7 320 aa27.39■■□□□ 1.98
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Rtl1Q7M732 1744 aa26.98■■□□□ 1.91
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ccdc180J3QNE4 1664 aa26.61■■□□□ 1.85
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa25.78■■□□□ 1.72
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Dcaf1Q80TR8 1506 aa25.55■■□□□ 1.68
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa25.43■■□□□ 1.66
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 ScribQ80U72 1612 aa25.39■■□□□ 1.66
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 HrcG5E8J6 738 aa25.38■■□□□ 1.65
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa25.37■■□□□ 1.65
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Baz1aO88379 1555 aa25.11■■□□□ 1.61
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Kdm5dQ62240 1548 aa25.03■■□□□ 1.6
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Trim41Q5NCC3 630 aa24.9■■□□□ 1.58
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 NacadQ5SWP3 1504 aa24.76■■□□□ 1.55
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Smarca2Q6DIC0 1577 aa24.56■■□□□ 1.52
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Cep164Q5DU05 1446 aa24.53■■□□□ 1.52
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Crybg2B7ZCC2 1516 aa24.5■■□□□ 1.51
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Pcgf6Q99NA9 353 aa24.48■■□□□ 1.51
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Cngb1E1AZ71 1325 aa24.23■■□□□ 1.47
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Sycp2Q9CUU3 1500 aa24.21■■□□□ 1.47
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Chic1Q8CBW7 227 aa24.17■■□□□ 1.46
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Gab3Q8BSM5 595 aa24.13■■□□□ 1.45
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa23.97■■□□□ 1.43
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa23.94■■□□□ 1.42
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Golga3P55937 1487 aa23.91■■□□□ 1.42
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Synj1Q8CHC4 1574 aa23.82■■□□□ 1.4
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Zeb1Q64318 1117 aa23.74■■□□□ 1.39
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Mier1Q5UAK0 511 aa23.72■■□□□ 1.39
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 NefmP08553 848 aa23.71■■□□□ 1.39
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 BicraF8VPZ9 1578 aa23.64■■□□□ 1.37
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 CftrP26361 1476 aa23.63■■□□□ 1.37
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Top2bQ64511 1612 aa23.53■■□□□ 1.36
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Neurod1Q60867 357 aa23.5■■□□□ 1.35
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa23.44■■□□□ 1.34
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Sall2Q9QX96 1004 aa23.38■■□□□ 1.33
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa23.36■■□□□ 1.33
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 UbtfP25976 765 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa23.27■■□□□ 1.32
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Fmn1Q05860 1466 aa23.2■■□□□ 1.3
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Myt1lP97500 1187 aa23.19■■□□□ 1.3
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Cep162Q6ZQ06 1403 aa23.12■■□□□ 1.29
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Wdr66E9Q743 1299 aa23.1■■□□□ 1.29
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Npm2Q80W85 207 aa23.03■■□□□ 1.28
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Anks4bQ8K3X6 423 aa22.92■■□□□ 1.26
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa22.91■■□□□ 1.26
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Clip1Q922J3 1391 aa22.89■■□□□ 1.25
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 ClspnQ80YR7 1315 aa22.89■■□□□ 1.25
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa22.87■■□□□ 1.25
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 TonslQ6NZL6 1363 aa22.83■■□□□ 1.25
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa22.83■■□□□ 1.24
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Csrnp3P59055 597 aa22.73■■□□□ 1.23
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa22.68■■□□□ 1.22
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa22.65■■□□□ 1.22
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 TnnQ80Z71 1560 aa22.64■■□□□ 1.22
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Arhgap35Q91YM2 1499 aa22.62■■□□□ 1.21
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 PtprkP35822 1457 aa22.57■■□□□ 1.2
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa22.56■■□□□ 1.2
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Eea1Q8BL66 1411 aa22.55■■□□□ 1.2
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Il27Q8K3I6 234 aa22.54■■□□□ 1.2
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Arap1Q4LDD4 1452 aa22.52■■□□□ 1.2
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 NrkQ9R0G8 1455 aa22.5■■□□□ 1.19
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Setd5Q5XJV7 1441 aa22.45■■□□□ 1.19
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Eid3Q3V124 375 aa22.44■■□□□ 1.18
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Frmpd1A2AKB4 1549 aa22.43■■□□□ 1.18
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa22.42■■□□□ 1.18
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Kif15Q6P9L6 1387 aa22.4■■□□□ 1.18
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Lamc3Q9R0B6 1581 aa22.39■■□□□ 1.17
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Ccdc18Q640L5 1455 aa22.39■■□□□ 1.17
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Shroom4Q1W617 1475 aa22.38■■□□□ 1.17
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Wdr62Q3U3T8 1523 aa22.37■■□□□ 1.17
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Aplp2Q06335 707 aa22.36■■□□□ 1.17
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Kdm5bQ80Y84 1544 aa22.34■■□□□ 1.17
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Map3k1P53349 1493 aa22.32■■□□□ 1.16
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Camsap1A2AHC3 1581 aa22.29■■□□□ 1.16
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Tiam1Q60610 1591 aa22.27■■□□□ 1.15
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 BlmO88700 1416 aa22.24■■□□□ 1.15
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Baz1bQ9Z277 1479 aa22.22■■□□□ 1.15
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Naip1Q9QWK5 1403 aa22.2■■□□□ 1.15
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa22.19■■□□□ 1.14
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Grin2bQ01097 1482 aa22.19■■□□□ 1.14
Ptgs1-201ENSMUST00000062069 Gm38655A0A286YDK6 273 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.2 ms