RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NischQ80TM9 1593 aa32.23■■■□□ 2.75
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa29.84■■■□□ 2.37
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rhox8Q6VSS7 320 aa29.79■■■□□ 2.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rtl1Q7M732 1744 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc180J3QNE4 1664 aa28.92■■■□□ 2.22
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ScribQ80U72 1612 aa28.82■■■□□ 2.2
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dcaf1Q80TR8 1506 aa28.35■■■□□ 2.13
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa28.21■■■□□ 2.11
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kdm5dQ62240 1548 aa28.21■■■□□ 2.11
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NacadQ5SWP3 1504 aa27.91■■■□□ 2.06
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Baz1aO88379 1555 aa27.81■■■□□ 2.04
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sycp2Q9CUU3 1500 aa27.36■■□□□ 1.97
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Crybg2B7ZCC2 1516 aa27.21■■□□□ 1.95
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Smarca2Q6DIC0 1577 aa27.17■■□□□ 1.94
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa26.99■■□□□ 1.91
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CenpbP27790 599 aa26.85■■□□□ 1.89
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa26.82■■□□□ 1.88
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Anks4bQ8K3X6 423 aa26.65■■□□□ 1.86
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Csrnp3P59055 597 aa26.64■■□□□ 1.86
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cngb1E1AZ71 1325 aa26.49■■□□□ 1.83
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zeb1Q64318 1117 aa26.47■■□□□ 1.83
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Synj1Q8CHC4 1574 aa26.43■■□□□ 1.82
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sall2Q9QX96 1004 aa26.38■■□□□ 1.81
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Aplp2Q06335 707 aa26.36■■□□□ 1.81
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Chic1Q8CBW7 227 aa26.33■■□□□ 1.81
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CftrP26361 1476 aa26.27■■□□□ 1.8
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cep164Q5DU05 1446 aa26.27■■□□□ 1.8
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Golga3P55937 1487 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa26.16■■□□□ 1.78
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gab3Q8BSM5 595 aa26.1■■□□□ 1.77
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Bcl11aQ9QYE3 773 aa26.1■■□□□ 1.77
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa26.01■■□□□ 1.75
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Top2bQ64511 1612 aa25.86■■□□□ 1.73
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa25.81■■□□□ 1.72
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm38655A0A286YDK6 273 aa25.79■■□□□ 1.72
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa25.74■■□□□ 1.71
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ClspnQ80YR7 1315 aa25.56■■□□□ 1.68
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam71e1A1L3C1 212 aa25.5■■□□□ 1.67
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fmn1Q05860 1466 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PrkcshO08795 521 aa25.42■■□□□ 1.66
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Frmpd1A2AKB4 1549 aa25.4■■□□□ 1.66
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Wdr62Q3U3T8 1523 aa25.32■■□□□ 1.64
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa25.29■■□□□ 1.64
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa25.27■■□□□ 1.64
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa25.21■■□□□ 1.63
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Myt1lP97500 1187 aa25.2■■□□□ 1.63
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa25.17■■□□□ 1.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ercc6F8VPZ5 1481 aa25.16■■□□□ 1.62
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Il27Q8K3I6 234 aa25.15■■□□□ 1.62
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cep162Q6ZQ06 1403 aa25.13■■□□□ 1.61
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kif15Q6P9L6 1387 aa25.1■■□□□ 1.61
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tnnt3Q9QZ47 272 aa25.01■■□□□ 1.6
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Camsap1A2AHC3 1581 aa24.82■■□□□ 1.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Anp32aO35381 247 aa24.82■■□□□ 1.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rtl5Q5DTT4 599 aa24.82■■□□□ 1.56
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Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Clip1Q922J3 1391 aa24.73■■□□□ 1.55
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