RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044857.3

Trappc5-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc5, Length 2,546 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5-201ENSMUST00000044857 NischQ80TM9 1593 aa29.46■■■□□ 2.31
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Trappc5-201ENSMUST00000044857 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa25.77■■□□□ 1.72
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Trappc5-201ENSMUST00000044857 CftrP26361 1476 aa23.97■■□□□ 1.43
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Trappc5-201ENSMUST00000044857 Mier1Q5UAK0 511 aa23.87■■□□□ 1.41
Trappc5-201ENSMUST00000044857 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa23.85■■□□□ 1.41
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Trappc5-201ENSMUST00000044857 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Trappc5-201ENSMUST00000044857 Top2bQ64511 1612 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc5-201ENSMUST00000044857 Gm38655A0A286YDK6 273 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc5-201ENSMUST00000044857 Unc13aQ4KUS2 1712 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc5-201ENSMUST00000044857 ClspnQ80YR7 1315 aa23.38■■□□□ 1.33
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Trappc5-201ENSMUST00000044857 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa23.36■■□□□ 1.33
Trappc5-201ENSMUST00000044857 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa23.33■■□□□ 1.33
Trappc5-201ENSMUST00000044857 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.26■■□□□ 1.31
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Trappc5-201ENSMUST00000044857 Bcl11aQ9QYE3 773 aa23.17■■□□□ 1.3
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Trappc5-201ENSMUST00000044857 Kif15Q6P9L6 1387 aa23.08■■□□□ 1.29
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Trappc5-201ENSMUST00000044857 Fam71e1A1L3C1 212 aa23.05■■□□□ 1.28
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Trappc5-201ENSMUST00000044857 Tnnt3Q9QZ47 272 aa22.78■■□□□ 1.24
Trappc5-201ENSMUST00000044857 Camsap1A2AHC3 1581 aa22.76■■□□□ 1.23
Trappc5-201ENSMUST00000044857 Mrc2Q64449 1479 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc5-201ENSMUST00000044857 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Trappc5-201ENSMUST00000044857 Ccdc18Q640L5 1455 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc5-201ENSMUST00000044857 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa22.59■■□□□ 1.21
Trappc5-201ENSMUST00000044857 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa22.58■■□□□ 1.2
Trappc5-201ENSMUST00000044857 PtprkP35822 1457 aa22.57■■□□□ 1.2
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Trappc5-201ENSMUST00000044857 Anp32aO35381 247 aa22.53■■□□□ 1.2
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