RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029271.4

Trpc3-201, Transcript of Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trpc3, Length 3,694 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Rhox8Q6VSS7 320 aa27.65■■■□□ 2.02
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
Trpc3-201ENSMUST00000029271 NischQ80TM9 1593 aa26.26■■□□□ 1.79
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa25.62■■□□□ 1.69
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa25.37■■□□□ 1.65
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Abcc9P70170 1546 aa24.96■■□□□ 1.59
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Pcgf6Q99NA9 353 aa24.77■■□□□ 1.56
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Zeb1Q64318 1117 aa24.7■■□□□ 1.54
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24.68■■□□□ 1.54
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Trim41Q5NCC3 630 aa24.65■■□□□ 1.54
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Gab3Q8BSM5 595 aa24.57■■□□□ 1.52
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Rtl1Q7M732 1744 aa24.37■■□□□ 1.49
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Abcc8B2RUS7 1588 aa24.36■■□□□ 1.49
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Cngb1E1AZ71 1325 aa24.3■■□□□ 1.48
Trpc3-201ENSMUST00000029271 HrcG5E8J6 738 aa24.2■■□□□ 1.46
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Wdr66E9Q743 1299 aa24.12■■□□□ 1.45
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.96■■□□□ 1.43
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Neurod1Q60867 357 aa23.85■■□□□ 1.41
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa23.85■■□□□ 1.41
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
Trpc3-201ENSMUST00000029271 UbtfP25976 765 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Myt1lP97500 1187 aa23.62■■□□□ 1.37
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Dcaf1Q80TR8 1506 aa23.57■■□□□ 1.36
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Mier1Q5UAK0 511 aa23.57■■□□□ 1.36
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
Trpc3-201ENSMUST00000029271 NefmP08553 848 aa23.53■■□□□ 1.36
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Sall2Q9QX96 1004 aa23.48■■□□□ 1.35
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Chic1Q8CBW7 227 aa23.4■■□□□ 1.34
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Gm38655A0A286YDK6 273 aa23.37■■□□□ 1.33
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Csrnp3P59055 597 aa23.31■■□□□ 1.32
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Npm2Q80W85 207 aa23.21■■□□□ 1.31
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa23.07■■□□□ 1.28
Trpc3-201ENSMUST00000029271 CenpbP27790 599 aa23.06■■□□□ 1.28
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Cep164Q5DU05 1446 aa23.04■■□□□ 1.28
Trpc3-201ENSMUST00000029271 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa23.02■■□□□ 1.28
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22.89■■□□□ 1.26
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Anks4bQ8K3X6 423 aa22.87■■□□□ 1.25
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa22.86■■□□□ 1.25
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa22.84■■□□□ 1.25
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Slc24a1Q91WD8 1130 aa22.81■■□□□ 1.24
Trpc3-201ENSMUST00000029271 TonslQ6NZL6 1363 aa22.78■■□□□ 1.24
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Eid3Q3V124 375 aa22.77■■□□□ 1.24
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ube2uB1AUC4 352 aa22.72■■□□□ 1.23
Trpc3-201ENSMUST00000029271 ClspnQ80YR7 1315 aa22.71■■□□□ 1.23
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Il27Q8K3I6 234 aa22.67■■□□□ 1.22
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Baz1aO88379 1555 aa22.55■■□□□ 1.2
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa22.47■■□□□ 1.19
Trpc3-201ENSMUST00000029271 NclP09405 707 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Aplp2Q06335 707 aa22.41■■□□□ 1.18
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Kdm5dQ62240 1548 aa22.37■■□□□ 1.17
Trpc3-201ENSMUST00000029271 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa22.32■■□□□ 1.16
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22.26■■□□□ 1.15
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Clip1Q922J3 1391 aa22.22■■□□□ 1.15
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Fam71e1A1L3C1 212 aa22.21■■□□□ 1.15
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Golga3P55937 1487 aa22.17■■□□□ 1.14
Trpc3-201ENSMUST00000029271 ScribQ80U72 1612 aa22.16■■□□□ 1.14
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Tnnt3Q9QZ47 272 aa22.15■■□□□ 1.14
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Myt1Q8CFC2 1127 aa22.15■■□□□ 1.14
Trpc3-201ENSMUST00000029271 NacadQ5SWP3 1504 aa22.12■■□□□ 1.13
Trpc3-201ENSMUST00000029271 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Stra8P70278 393 aa22.05■■□□□ 1.12
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa21.96■■□□□ 1.11
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Anp32aO35381 247 aa21.87■■□□□ 1.09
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Smarca2Q6DIC0 1577 aa21.85■■□□□ 1.09
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Calr4Q3TQS0 420 aa21.79■■□□□ 1.08
Trpc3-201ENSMUST00000029271 P3h3Q8CG70 732 aa21.75■■□□□ 1.07
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa21.74■■□□□ 1.07
Trpc3-201ENSMUST00000029271 NrdcQ8BHG1 1161 aa21.74■■□□□ 1.07
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Amer1Q7TS75 1132 aa21.69■■□□□ 1.06
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Cep162Q6ZQ06 1403 aa21.69■■□□□ 1.06
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Chic2Q9D9G3 165 aa21.68■■□□□ 1.06
Trpc3-201ENSMUST00000029271 BlmO88700 1416 aa21.66■■□□□ 1.06
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Bcl11aQ9QYE3 773 aa21.66■■□□□ 1.06
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Zbtb4Q5F293 982 aa21.65■■□□□ 1.06
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Synj1Q8CHC4 1574 aa21.64■■□□□ 1.05
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Setd5Q5XJV7 1441 aa21.64■■□□□ 1.05
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa21.62■■□□□ 1.05
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Mrs2Q5NCE8 434 aa21.55■■□□□ 1.04
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa21.53■■□□□ 1.04
Trpc3-201ENSMUST00000029271 CftrP26361 1476 aa21.52■■□□□ 1.04
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Sycp2Q9CUU3 1500 aa21.48■■□□□ 1.03
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa21.48■■□□□ 1.03
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Slc4a3P16283 1227 aa21.46■■□□□ 1.03
Trpc3-201ENSMUST00000029271 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.5 ms