RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027512.12

Atg16l1-201, Transcript of Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Atg16l1, Length 3,130 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 NischQ80TM9 1593 aa25.73■■□□□ 1.71
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa24.91■■□□□ 1.58
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Rhox8Q6VSS7 320 aa24.5■■□□□ 1.51
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Abcc8B2RUS7 1588 aa24.3■■□□□ 1.48
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Rtl1Q7M732 1744 aa23.95■■□□□ 1.42
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Ccdc180J3QNE4 1664 aa23.68■■□□□ 1.38
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 ScribQ80U72 1612 aa22.64■■□□□ 1.21
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 HrcG5E8J6 738 aa22.61■■□□□ 1.21
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Dcaf1Q80TR8 1506 aa22.58■■□□□ 1.21
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa22.58■■□□□ 1.2
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Baz1aO88379 1555 aa22.27■■□□□ 1.16
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Kdm5dQ62240 1548 aa22.22■■□□□ 1.15
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 NacadQ5SWP3 1504 aa21.91■■□□□ 1.1
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Smarca2Q6DIC0 1577 aa21.79■■□□□ 1.08
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Crybg2B7ZCC2 1516 aa21.66■■□□□ 1.06
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Cngb1E1AZ71 1325 aa21.66■■□□□ 1.06
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Golga3P55937 1487 aa21.26■□□□□ 0.99
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 NefmP08553 848 aa21.19■□□□□ 0.98
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Neurod1Q60867 357 aa21.17■□□□□ 0.98
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Synj1Q8CHC4 1574 aa21.16■□□□□ 0.98
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 BicraF8VPZ9 1578 aa21.14■□□□□ 0.97
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Sall2Q9QX96 1004 aa21.01■□□□□ 0.95
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 CftrP26361 1476 aa20.98■□□□□ 0.95
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa20.78■□□□□ 0.92
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa20.77■□□□□ 0.92
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Npm2Q80W85 207 aa20.57■□□□□ 0.88
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Anks4bQ8K3X6 423 aa20.56■□□□□ 0.88
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Il27Q8K3I6 234 aa20.55■□□□□ 0.88
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa20.42■□□□□ 0.86
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Gm38655A0A286YDK6 273 aa20.07■□□□□ 0.8
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Aplp2Q06335 707 aa20.07■□□□□ 0.8
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa20.01■□□□□ 0.79
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa19.94■□□□□ 0.78
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Ercc6F8VPZ5 1481 aa19.94■□□□□ 0.78
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 CenpbP27790 599 aa19.93■□□□□ 0.78
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 BlmO88700 1416 aa19.84■□□□□ 0.77
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Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
Atg16l1-201ENSMUST00000027512 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
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