RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023363.6

Rrn3-201, Transcript of RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rrn3, Length 3,597 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa17.55■□□□□ 0.4
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Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa15.02□□□□□ -0.01
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Golga3P55937 1487 aa15□□□□□ -0.01
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa14.95□□□□□ -0.02
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Rrn3-201ENSMUST00000023363 Synj1Q8CHC4 1574 aa14.89□□□□□ -0.03
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Wdr66E9Q743 1299 aa14.85□□□□□ -0.03
Rrn3-201ENSMUST00000023363 NefmP08553 848 aa14.84□□□□□ -0.03
Rrn3-201ENSMUST00000023363 CftrP26361 1476 aa14.82□□□□□ -0.04
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa14.82□□□□□ -0.04
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Rrn3-201ENSMUST00000023363 Fmn1Q05860 1466 aa14.55□□□□□ -0.08
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa14.54□□□□□ -0.08
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Rrn3-201ENSMUST00000023363 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa14.52□□□□□ -0.08
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Sall2Q9QX96 1004 aa14.52□□□□□ -0.09
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Neurod1Q60867 357 aa14.49□□□□□ -0.09
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cep162Q6ZQ06 1403 aa14.47□□□□□ -0.09
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa14.47□□□□□ -0.09
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Rrn3-201ENSMUST00000023363 Kif15Q6P9L6 1387 aa14.42□□□□□ -0.1
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Clip1Q922J3 1391 aa14.4□□□□□ -0.1
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Rrn3-201ENSMUST00000023363 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa14.39□□□□□ -0.11
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Rrn3-201ENSMUST00000023363 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
Rrn3-201ENSMUST00000023363 TonslQ6NZL6 1363 aa14.3□□□□□ -0.12
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Rrn3-201ENSMUST00000023363 Slc24a1Q91WD8 1130 aa14.27□□□□□ -0.13
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Rrn3-201ENSMUST00000023363 Chic2Q9D9G3 165 aa14.22□□□□□ -0.13
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa14.21□□□□□ -0.13
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Rrn3-201ENSMUST00000023363 Anks4bQ8K3X6 423 aa14.18□□□□□ -0.14
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Rrn3-201ENSMUST00000023363 Arhgap35Q91YM2 1499 aa14.14□□□□□ -0.15
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Rrn3-201ENSMUST00000023363 PtprkP35822 1457 aa14.11□□□□□ -0.15
Rrn3-201ENSMUST00000023363 TnnQ80Z71 1560 aa14.11□□□□□ -0.15
Rrn3-201ENSMUST00000023363 BlmO88700 1416 aa14.11□□□□□ -0.15
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Frmpd1A2AKB4 1549 aa14.11□□□□□ -0.15
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa14.1□□□□□ -0.15
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
Rrn3-201ENSMUST00000023363 NrkQ9R0G8 1455 aa14.06□□□□□ -0.16
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Arap1Q4LDD4 1452 aa14.05□□□□□ -0.16
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Wdr62Q3U3T8 1523 aa14.05□□□□□ -0.16
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cux2P70298 1426 aa14.04□□□□□ -0.16
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