RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sp1O89090 784 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 E2f2P56931 443 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Naa50Q6PGB6 169 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prap1Q80XD8 149 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp418Q8BFS8 652 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Svs2Q8BS30 375 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ago1Q8CJG1 857 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sirt3Q8R104 334 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp940Q8R2Q3 566 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AjubaQ91XC0 547 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Metap1dQ9CPW9 335 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp6cQ9CQR6 305 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Marc1Q9CW42 340 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Yif1bQ9CX30 311 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem53Q9D0Z3 276 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc28a3Q9ERH8 703 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AnkhQ9JHZ2 492 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CpqQ9WVJ3 470 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rad9aQ9Z0F6 389 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Man1b1A2AJ15 658 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Il13ra1O09030 424 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NapsaO09043 419 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc16a8O35308 492 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cd160O88875 185 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fgf18O89101 207 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hoxa9P09631 271 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc153P0C7Q1 202 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gria1P23818 907 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpr3P35413 330 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Polr2iP60898 125 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Galnt3P70419 633 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lpcat1Q3TFD2 534 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Jak3Q62137 1100 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zzz3Q6KAQ7 910 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CapslQ6P8Y1 208 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ces2bQ6PDB7 556 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1252Q7TQZ2 314 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nrde2Q80XC6 1172 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 FicdQ8BIX9 458 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dennd1cQ8CFK6 786 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Emid1Q91VF5 444 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hdac11Q91WA3 347 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcdha8Q91Y12 946 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pole4Q9CQ36 118 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Duoxa2Q9D311 320 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ddi1Q9DAF3 408 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ing1Q9QXV3 279 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Akap8lQ9R0L7 642 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HephQ9Z0Z4 1157 aa20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighg3A0A1Y7VJN6 399 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Itga8A2ARA8 1062 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hk2O08528 917 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wnt6P22727 364 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Etv4P28322 485 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Etv2P41163 335 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AhcyP50247 432 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rps3P62908 243 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hoxd13P70217 339 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aqp1Q02013 269 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zdhhc11Q14AK4 347 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smu1Q3UKJ7 513 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eif2b4Q61749 524 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm7247Q6UY52 187 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp438Q8BFX2 798 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 D3Ertd751eQ8BGN2 192 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Morc4Q8BMD7 928 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr330Q8VGD9 315 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 KmoQ91WN4 479 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt6bQ9Z331 562 aa20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plxna4Q80UG2 1893 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rp1l1Q8CGM2 1859 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10406A6NAS4 205 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3373A6NAS7 205 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam124aD3Z5V4 536 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3298E9PW80 205 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3667K7N757 205 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gsta1P13745 223 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BdnfP21237 249 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gli1P47806 1111 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ufm1P61961 85 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ldb1P70662 411 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm7030Q0WXH6 285 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3558Q5FWC9 205 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SctrQ5FWI2 447 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znrf3Q5SSZ7 913 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NkaplQ5SZT7 395 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CcnhQ61458 323 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klhl23Q6GQU2 558 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ManealQ6P1J0 452 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gsta1Q6P8Q0 223 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PdgfrlQ6PE55 375 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ubr7Q8BU04 425 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gucy1b2Q8BXH3 824 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sec22cQ8BXT9 303 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp4r4Q8C0Y0 875 aa20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.4 ms