Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU2

Klhl23, Kelch-like protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl23Q6GQU2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
Klhl23Q6GQU2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Klhl23Q6GQU2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Klhl23Q6GQU2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Klhl23Q6GQU2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Klhl23Q6GQU2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Klhl23Q6GQU2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Klhl23Q6GQU2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Klhl23Q6GQU2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Klhl23Q6GQU2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Klhl23Q6GQU2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Klhl23Q6GQU2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Klhl23Q6GQU2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Klhl23Q6GQU2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Klhl23Q6GQU2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Klhl23Q6GQU2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Klhl23Q6GQU2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Klhl23Q6GQU2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Klhl23Q6GQU2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Klhl23Q6GQU2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Klhl23Q6GQU2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Klhl23Q6GQU2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Klhl23Q6GQU2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Klhl23Q6GQU2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Klhl23Q6GQU2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Klhl23Q6GQU2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Klhl23Q6GQU2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Klhl23Q6GQU2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Klhl23Q6GQU2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Klhl23Q6GQU2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Klhl23Q6GQU2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Klhl23Q6GQU2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Klhl23Q6GQU2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Klhl23Q6GQU2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Klhl23Q6GQU2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Klhl23Q6GQU2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Klhl23Q6GQU2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Klhl23Q6GQU2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Klhl23Q6GQU2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Klhl23Q6GQU2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Klhl23Q6GQU2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Klhl23Q6GQU2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Klhl23Q6GQU2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Klhl23Q6GQU2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Klhl23Q6GQU2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Klhl23Q6GQU2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Klhl23Q6GQU2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Klhl23Q6GQU2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Klhl23Q6GQU2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Klhl23Q6GQU2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Klhl23Q6GQU2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Klhl23Q6GQU2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Klhl23Q6GQU2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Klhl23Q6GQU2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Klhl23Q6GQU2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Klhl23Q6GQU2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Klhl23Q6GQU2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Klhl23Q6GQU2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Klhl23Q6GQU2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Klhl23Q6GQU2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Klhl23Q6GQU2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Klhl23Q6GQU2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Klhl23Q6GQU2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Klhl23Q6GQU2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Klhl23Q6GQU2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Klhl23Q6GQU2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Klhl23Q6GQU2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Klhl23Q6GQU2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Klhl23Q6GQU2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Klhl23Q6GQU2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Klhl23Q6GQU2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Klhl23Q6GQU2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Klhl23Q6GQU2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Klhl23Q6GQU2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Klhl23Q6GQU2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Klhl23Q6GQU2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Klhl23Q6GQU2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Klhl23Q6GQU2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Klhl23Q6GQU2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Klhl23Q6GQU2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Klhl23Q6GQU2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Klhl23Q6GQU2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Klhl23Q6GQU2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Klhl23Q6GQU2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Klhl23Q6GQU2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klhl23Q6GQU2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Klhl23Q6GQU2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Klhl23Q6GQU2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Klhl23Q6GQU2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Klhl23Q6GQU2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Klhl23Q6GQU2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Klhl23Q6GQU2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Klhl23Q6GQU2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Klhl23Q6GQU2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Klhl23Q6GQU2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Klhl23Q6GQU2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Klhl23Q6GQU2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Klhl23Q6GQU2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Klhl23Q6GQU2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Klhl23Q6GQU2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms