Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT7

Nkapl, NKAP-like protein, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkaplQ5SZT7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NkaplQ5SZT7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NkaplQ5SZT7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NkaplQ5SZT7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NkaplQ5SZT7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NkaplQ5SZT7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NkaplQ5SZT7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NkaplQ5SZT7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NkaplQ5SZT7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NkaplQ5SZT7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NkaplQ5SZT7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NkaplQ5SZT7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NkaplQ5SZT7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NkaplQ5SZT7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NkaplQ5SZT7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NkaplQ5SZT7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NkaplQ5SZT7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NkaplQ5SZT7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
NkaplQ5SZT7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NkaplQ5SZT7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NkaplQ5SZT7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NkaplQ5SZT7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NkaplQ5SZT7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NkaplQ5SZT7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NkaplQ5SZT7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NkaplQ5SZT7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NkaplQ5SZT7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NkaplQ5SZT7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NkaplQ5SZT7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NkaplQ5SZT7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NkaplQ5SZT7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NkaplQ5SZT7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NkaplQ5SZT7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NkaplQ5SZT7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NkaplQ5SZT7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NkaplQ5SZT7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NkaplQ5SZT7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NkaplQ5SZT7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NkaplQ5SZT7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NkaplQ5SZT7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NkaplQ5SZT7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NkaplQ5SZT7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NkaplQ5SZT7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NkaplQ5SZT7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NkaplQ5SZT7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NkaplQ5SZT7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NkaplQ5SZT7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NkaplQ5SZT7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NkaplQ5SZT7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NkaplQ5SZT7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NkaplQ5SZT7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NkaplQ5SZT7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NkaplQ5SZT7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NkaplQ5SZT7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NkaplQ5SZT7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NkaplQ5SZT7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NkaplQ5SZT7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NkaplQ5SZT7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NkaplQ5SZT7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NkaplQ5SZT7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NkaplQ5SZT7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NkaplQ5SZT7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NkaplQ5SZT7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NkaplQ5SZT7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NkaplQ5SZT7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NkaplQ5SZT7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NkaplQ5SZT7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NkaplQ5SZT7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NkaplQ5SZT7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NkaplQ5SZT7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NkaplQ5SZT7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NkaplQ5SZT7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NkaplQ5SZT7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NkaplQ5SZT7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NkaplQ5SZT7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NkaplQ5SZT7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NkaplQ5SZT7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NkaplQ5SZT7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NkaplQ5SZT7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NkaplQ5SZT7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NkaplQ5SZT7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NkaplQ5SZT7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NkaplQ5SZT7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NkaplQ5SZT7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NkaplQ5SZT7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NkaplQ5SZT7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NkaplQ5SZT7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NkaplQ5SZT7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NkaplQ5SZT7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NkaplQ5SZT7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NkaplQ5SZT7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NkaplQ5SZT7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NkaplQ5SZT7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NkaplQ5SZT7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NkaplQ5SZT7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NkaplQ5SZT7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NkaplQ5SZT7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NkaplQ5SZT7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NkaplQ5SZT7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NkaplQ5SZT7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
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