Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT7

Nkapl, NKAP-like protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkaplQ5SZT7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,33■■■□□ 2,93
NkaplQ5SZT7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
NkaplQ5SZT7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,51■■■□□ 2,63
NkaplQ5SZT7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
NkaplQ5SZT7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,66■■■□□ 2,5
NkaplQ5SZT7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
NkaplQ5SZT7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
NkaplQ5SZT7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
NkaplQ5SZT7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
NkaplQ5SZT7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
NkaplQ5SZT7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
NkaplQ5SZT7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
NkaplQ5SZT7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
NkaplQ5SZT7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
NkaplQ5SZT7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
NkaplQ5SZT7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
NkaplQ5SZT7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
NkaplQ5SZT7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,89■■■□□ 2,21
NkaplQ5SZT7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
NkaplQ5SZT7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
NkaplQ5SZT7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
NkaplQ5SZT7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
NkaplQ5SZT7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
NkaplQ5SZT7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
NkaplQ5SZT7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
NkaplQ5SZT7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,4■■■□□ 2,14
NkaplQ5SZT7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
NkaplQ5SZT7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
NkaplQ5SZT7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
NkaplQ5SZT7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
NkaplQ5SZT7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
NkaplQ5SZT7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
NkaplQ5SZT7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
NkaplQ5SZT7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
NkaplQ5SZT7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
NkaplQ5SZT7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
NkaplQ5SZT7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
NkaplQ5SZT7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,88■■■□□ 2,05
NkaplQ5SZT7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
NkaplQ5SZT7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
NkaplQ5SZT7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
NkaplQ5SZT7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,64■■■□□ 2,02
NkaplQ5SZT7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
NkaplQ5SZT7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
NkaplQ5SZT7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
NkaplQ5SZT7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
NkaplQ5SZT7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
NkaplQ5SZT7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
NkaplQ5SZT7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
NkaplQ5SZT7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
NkaplQ5SZT7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,97
NkaplQ5SZT7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
NkaplQ5SZT7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
NkaplQ5SZT7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
NkaplQ5SZT7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,24■■□□□ 1,95
NkaplQ5SZT7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
NkaplQ5SZT7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
NkaplQ5SZT7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
NkaplQ5SZT7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
NkaplQ5SZT7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
NkaplQ5SZT7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
NkaplQ5SZT7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
NkaplQ5SZT7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
NkaplQ5SZT7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
NkaplQ5SZT7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
NkaplQ5SZT7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
NkaplQ5SZT7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
NkaplQ5SZT7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
NkaplQ5SZT7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
NkaplQ5SZT7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
NkaplQ5SZT7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
NkaplQ5SZT7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
NkaplQ5SZT7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
NkaplQ5SZT7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
NkaplQ5SZT7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
NkaplQ5SZT7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,45■■□□□ 1,82
NkaplQ5SZT7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
NkaplQ5SZT7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
NkaplQ5SZT7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
NkaplQ5SZT7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
NkaplQ5SZT7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
NkaplQ5SZT7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
NkaplQ5SZT7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
NkaplQ5SZT7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
NkaplQ5SZT7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,27■■□□□ 1,8
NkaplQ5SZT7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
NkaplQ5SZT7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
NkaplQ5SZT7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,18■■□□□ 1,78
NkaplQ5SZT7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,17■■□□□ 1,78
NkaplQ5SZT7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,16■■□□□ 1,78
NkaplQ5SZT7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
NkaplQ5SZT7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,77
NkaplQ5SZT7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,12■■□□□ 1,77
NkaplQ5SZT7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
NkaplQ5SZT7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
NkaplQ5SZT7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
NkaplQ5SZT7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,03■■□□□ 1,76
NkaplQ5SZT7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
NkaplQ5SZT7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
NkaplQ5SZT7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
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