Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF5

Emid1, EMI domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emid1Q91VF5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,92■■■■□ 3,82
Emid1Q91VF5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Emid1Q91VF5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Emid1Q91VF5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Emid1Q91VF5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,25■■■■□ 3,07
Emid1Q91VF5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Emid1Q91VF5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,66■■■□□ 2,98
Emid1Q91VF5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,56■■■□□ 2,96
Emid1Q91VF5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Emid1Q91VF5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Emid1Q91VF5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Emid1Q91VF5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,55■■■□□ 2,8
Emid1Q91VF5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Emid1Q91VF5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Emid1Q91VF5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Emid1Q91VF5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,14■■■□□ 2,74
Emid1Q91VF5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Emid1Q91VF5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Emid1Q91VF5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Emid1Q91VF5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,8■■■□□ 2,68
Emid1Q91VF5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Emid1Q91VF5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Emid1Q91VF5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Emid1Q91VF5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Emid1Q91VF5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Emid1Q91VF5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,48■■■□□ 2,63
Emid1Q91VF5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Emid1Q91VF5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,36■■■□□ 2,61
Emid1Q91VF5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Emid1Q91VF5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Emid1Q91VF5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Emid1Q91VF5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Emid1Q91VF5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Emid1Q91VF5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Emid1Q91VF5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Emid1Q91VF5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Emid1Q91VF5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Emid1Q91VF5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Emid1Q91VF5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Emid1Q91VF5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Emid1Q91VF5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Emid1Q91VF5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Emid1Q91VF5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Emid1Q91VF5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Emid1Q91VF5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Emid1Q91VF5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Emid1Q91VF5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Emid1Q91VF5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Emid1Q91VF5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,09■■■□□ 2,41
Emid1Q91VF5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Emid1Q91VF5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Emid1Q91VF5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Emid1Q91VF5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Emid1Q91VF5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Emid1Q91VF5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Emid1Q91VF5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Emid1Q91VF5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Emid1Q91VF5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Emid1Q91VF5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Emid1Q91VF5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Emid1Q91VF5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Emid1Q91VF5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Emid1Q91VF5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Emid1Q91VF5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Emid1Q91VF5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Emid1Q91VF5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Emid1Q91VF5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Emid1Q91VF5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Emid1Q91VF5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Emid1Q91VF5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Emid1Q91VF5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Emid1Q91VF5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Emid1Q91VF5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Emid1Q91VF5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Emid1Q91VF5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Emid1Q91VF5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Emid1Q91VF5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Emid1Q91VF5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Emid1Q91VF5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Emid1Q91VF5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Emid1Q91VF5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Emid1Q91VF5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,21■■■□□ 2,27
Emid1Q91VF5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Emid1Q91VF5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Emid1Q91VF5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Emid1Q91VF5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Emid1Q91VF5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Emid1Q91VF5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Emid1Q91VF5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Emid1Q91VF5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Emid1Q91VF5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Emid1Q91VF5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Emid1Q91VF5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Emid1Q91VF5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Emid1Q91VF5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Emid1Q91VF5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Emid1Q91VF5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Emid1Q91VF5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Emid1Q91VF5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Emid1Q91VF5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms