Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Hoxa9P09631 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Hoxa9P09631 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Hoxa9P09631 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Hoxa9P09631 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Hoxa9P09631 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Hoxa9P09631 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hoxa9P09631 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hoxa9P09631 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Hoxa9P09631 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Hoxa9P09631 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Hoxa9P09631 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Hoxa9P09631 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Hoxa9P09631 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Hoxa9P09631 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Hoxa9P09631 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Hoxa9P09631 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Hoxa9P09631 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Hoxa9P09631 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Hoxa9P09631 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Hoxa9P09631 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Hoxa9P09631 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Hoxa9P09631 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Hoxa9P09631 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Hoxa9P09631 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Hoxa9P09631 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Hoxa9P09631 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Hoxa9P09631 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Hoxa9P09631 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Hoxa9P09631 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hoxa9P09631 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Hoxa9P09631 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hoxa9P09631 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Hoxa9P09631 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Hoxa9P09631 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Hoxa9P09631 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Hoxa9P09631 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Hoxa9P09631 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Hoxa9P09631 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hoxa9P09631 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hoxa9P09631 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hoxa9P09631 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hoxa9P09631 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hoxa9P09631 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hoxa9P09631 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hoxa9P09631 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hoxa9P09631 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Hoxa9P09631 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hoxa9P09631 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Hoxa9P09631 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hoxa9P09631 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hoxa9P09631 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hoxa9P09631 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxa9P09631 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxa9P09631 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxa9P09631 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxa9P09631 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxa9P09631 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hoxa9P09631 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxa9P09631 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxa9P09631 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxa9P09631 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hoxa9P09631 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxa9P09631 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hoxa9P09631 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxa9P09631 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxa9P09631 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxa9P09631 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Hoxa9P09631 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hoxa9P09631 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxa9P09631 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hoxa9P09631 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxa9P09631 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hoxa9P09631 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxa9P09631 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxa9P09631 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxa9P09631 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxa9P09631 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxa9P09631 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hoxa9P09631 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hoxa9P09631 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxa9P09631 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Hoxa9P09631 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxa9P09631 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hoxa9P09631 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hoxa9P09631 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hoxa9P09631 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxa9P09631 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxa9P09631 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hoxa9P09631 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hoxa9P09631 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hoxa9P09631 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxa9P09631 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxa9P09631 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hoxa9P09631 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hoxa9P09631 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hoxa9P09631 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hoxa9P09631 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hoxa9P09631 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxa9P09631 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms