Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW42

Marc1, Mitochondrial amidoxime-reducing component 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marc1Q9CW42 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Marc1Q9CW42 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Marc1Q9CW42 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Marc1Q9CW42 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Marc1Q9CW42 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Marc1Q9CW42 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Marc1Q9CW42 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Marc1Q9CW42 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Marc1Q9CW42 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Marc1Q9CW42 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Marc1Q9CW42 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Marc1Q9CW42 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Marc1Q9CW42 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Marc1Q9CW42 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Marc1Q9CW42 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Marc1Q9CW42 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Marc1Q9CW42 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Marc1Q9CW42 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Marc1Q9CW42 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Marc1Q9CW42 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Marc1Q9CW42 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Marc1Q9CW42 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Marc1Q9CW42 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Marc1Q9CW42 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Marc1Q9CW42 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Marc1Q9CW42 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Marc1Q9CW42 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Marc1Q9CW42 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Marc1Q9CW42 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Marc1Q9CW42 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Marc1Q9CW42 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Marc1Q9CW42 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Marc1Q9CW42 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Marc1Q9CW42 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Marc1Q9CW42 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Marc1Q9CW42 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Marc1Q9CW42 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Marc1Q9CW42 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Marc1Q9CW42 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Marc1Q9CW42 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Marc1Q9CW42 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Marc1Q9CW42 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Marc1Q9CW42 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Marc1Q9CW42 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Marc1Q9CW42 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Marc1Q9CW42 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Marc1Q9CW42 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Marc1Q9CW42 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Marc1Q9CW42 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Marc1Q9CW42 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Marc1Q9CW42 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Marc1Q9CW42 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Marc1Q9CW42 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Marc1Q9CW42 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Marc1Q9CW42 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Marc1Q9CW42 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Marc1Q9CW42 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Marc1Q9CW42 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Marc1Q9CW42 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Marc1Q9CW42 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Marc1Q9CW42 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Marc1Q9CW42 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Marc1Q9CW42 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Marc1Q9CW42 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Marc1Q9CW42 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Marc1Q9CW42 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Marc1Q9CW42 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Marc1Q9CW42 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Marc1Q9CW42 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Marc1Q9CW42 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Marc1Q9CW42 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Marc1Q9CW42 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Marc1Q9CW42 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Marc1Q9CW42 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Marc1Q9CW42 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Marc1Q9CW42 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Marc1Q9CW42 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Marc1Q9CW42 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Marc1Q9CW42 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Marc1Q9CW42 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Marc1Q9CW42 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Marc1Q9CW42 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Marc1Q9CW42 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Marc1Q9CW42 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Marc1Q9CW42 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Marc1Q9CW42 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Marc1Q9CW42 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Marc1Q9CW42 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Marc1Q9CW42 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Marc1Q9CW42 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Marc1Q9CW42 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Marc1Q9CW42 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Marc1Q9CW42 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Marc1Q9CW42 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Marc1Q9CW42 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Marc1Q9CW42 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Marc1Q9CW42 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Marc1Q9CW42 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Marc1Q9CW42 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Marc1Q9CW42 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms