Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS7

Gm3373, Alpha10-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3373A6NAS7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,68■■■■□ 3,62
Gm3373A6NAS7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Gm3373A6NAS7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Gm3373A6NAS7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,75■■■□□ 2,83
Gm3373A6NAS7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,71■■■□□ 2,83
Gm3373A6NAS7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,95■■■□□ 2,71
Gm3373A6NAS7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Gm3373A6NAS7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Gm3373A6NAS7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Gm3373A6NAS7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Gm3373A6NAS7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,41■■■□□ 2,62
Gm3373A6NAS7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Gm3373A6NAS7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,53
Gm3373A6NAS7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Gm3373A6NAS7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Gm3373A6NAS7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Gm3373A6NAS7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gm3373A6NAS7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Gm3373A6NAS7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Gm3373A6NAS7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Gm3373A6NAS7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Gm3373A6NAS7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Gm3373A6NAS7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Gm3373A6NAS7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Gm3373A6NAS7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Gm3373A6NAS7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
Gm3373A6NAS7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Gm3373A6NAS7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Gm3373A6NAS7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Gm3373A6NAS7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Gm3373A6NAS7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Gm3373A6NAS7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Gm3373A6NAS7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Gm3373A6NAS7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Gm3373A6NAS7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Gm3373A6NAS7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Gm3373A6NAS7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Gm3373A6NAS7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Gm3373A6NAS7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Gm3373A6NAS7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Gm3373A6NAS7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Gm3373A6NAS7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Gm3373A6NAS7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Gm3373A6NAS7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Gm3373A6NAS7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Gm3373A6NAS7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Gm3373A6NAS7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
Gm3373A6NAS7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Gm3373A6NAS7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Gm3373A6NAS7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gm3373A6NAS7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Gm3373A6NAS7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Gm3373A6NAS7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Gm3373A6NAS7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Gm3373A6NAS7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Gm3373A6NAS7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gm3373A6NAS7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gm3373A6NAS7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Gm3373A6NAS7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Gm3373A6NAS7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Gm3373A6NAS7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Gm3373A6NAS7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Gm3373A6NAS7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Gm3373A6NAS7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Gm3373A6NAS7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Gm3373A6NAS7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Gm3373A6NAS7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Gm3373A6NAS7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Gm3373A6NAS7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Gm3373A6NAS7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Gm3373A6NAS7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Gm3373A6NAS7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Gm3373A6NAS7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Gm3373A6NAS7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Gm3373A6NAS7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Gm3373A6NAS7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Gm3373A6NAS7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Gm3373A6NAS7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,04
Gm3373A6NAS7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Gm3373A6NAS7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Gm3373A6NAS7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,03
Gm3373A6NAS7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Gm3373A6NAS7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Gm3373A6NAS7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Gm3373A6NAS7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Gm3373A6NAS7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Gm3373A6NAS7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Gm3373A6NAS7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Gm3373A6NAS7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Gm3373A6NAS7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Gm3373A6NAS7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Gm3373A6NAS7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Gm3373A6NAS7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Gm3373A6NAS7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Gm3373A6NAS7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Gm3373A6NAS7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Gm3373A6NAS7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Gm3373A6NAS7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Gm3373A6NAS7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Gm3373A6NAS7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41,9 ms