Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS7

Gm3373, Alpha10-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3373A6NAS7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Gm3373A6NAS7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Gm3373A6NAS7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Gm3373A6NAS7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Gm3373A6NAS7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Gm3373A6NAS7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Gm3373A6NAS7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Gm3373A6NAS7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Gm3373A6NAS7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Gm3373A6NAS7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Gm3373A6NAS7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Gm3373A6NAS7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Gm3373A6NAS7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Gm3373A6NAS7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Gm3373A6NAS7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gm3373A6NAS7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gm3373A6NAS7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gm3373A6NAS7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gm3373A6NAS7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gm3373A6NAS7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gm3373A6NAS7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gm3373A6NAS7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gm3373A6NAS7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gm3373A6NAS7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gm3373A6NAS7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gm3373A6NAS7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Gm3373A6NAS7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gm3373A6NAS7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Gm3373A6NAS7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gm3373A6NAS7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Gm3373A6NAS7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gm3373A6NAS7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gm3373A6NAS7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm3373A6NAS7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gm3373A6NAS7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gm3373A6NAS7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm3373A6NAS7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm3373A6NAS7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm3373A6NAS7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm3373A6NAS7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm3373A6NAS7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm3373A6NAS7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm3373A6NAS7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm3373A6NAS7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm3373A6NAS7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm3373A6NAS7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm3373A6NAS7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm3373A6NAS7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm3373A6NAS7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gm3373A6NAS7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm3373A6NAS7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gm3373A6NAS7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm3373A6NAS7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm3373A6NAS7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm3373A6NAS7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm3373A6NAS7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm3373A6NAS7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm3373A6NAS7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm3373A6NAS7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm3373A6NAS7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm3373A6NAS7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm3373A6NAS7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm3373A6NAS7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm3373A6NAS7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm3373A6NAS7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm3373A6NAS7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm3373A6NAS7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm3373A6NAS7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm3373A6NAS7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Gm3373A6NAS7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm3373A6NAS7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gm3373A6NAS7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gm3373A6NAS7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm3373A6NAS7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm3373A6NAS7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm3373A6NAS7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm3373A6NAS7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm3373A6NAS7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Gm3373A6NAS7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm3373A6NAS7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm3373A6NAS7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gm3373A6NAS7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm3373A6NAS7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm3373A6NAS7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm3373A6NAS7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm3373A6NAS7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm3373A6NAS7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm3373A6NAS7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm3373A6NAS7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm3373A6NAS7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm3373A6NAS7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm3373A6NAS7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm3373A6NAS7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm3373A6NAS7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm3373A6NAS7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm3373A6NAS7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm3373A6NAS7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm3373A6NAS7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm3373A6NAS7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm3373A6NAS7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms