Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR6

Ppp6c, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6cQ9CQR6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Ppp6cQ9CQR6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ppp6cQ9CQR6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ppp6cQ9CQR6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ppp6cQ9CQR6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ppp6cQ9CQR6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ppp6cQ9CQR6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Ppp6cQ9CQR6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ppp6cQ9CQR6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Ppp6cQ9CQR6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ppp6cQ9CQR6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ppp6cQ9CQR6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ppp6cQ9CQR6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppp6cQ9CQR6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Ppp6cQ9CQR6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ppp6cQ9CQR6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ppp6cQ9CQR6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ppp6cQ9CQR6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ppp6cQ9CQR6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppp6cQ9CQR6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppp6cQ9CQR6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppp6cQ9CQR6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ppp6cQ9CQR6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ppp6cQ9CQR6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppp6cQ9CQR6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppp6cQ9CQR6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ppp6cQ9CQR6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppp6cQ9CQR6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppp6cQ9CQR6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppp6cQ9CQR6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ppp6cQ9CQR6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppp6cQ9CQR6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ppp6cQ9CQR6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppp6cQ9CQR6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppp6cQ9CQR6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp6cQ9CQR6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppp6cQ9CQR6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppp6cQ9CQR6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppp6cQ9CQR6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp6cQ9CQR6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppp6cQ9CQR6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppp6cQ9CQR6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp6cQ9CQR6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp6cQ9CQR6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp6cQ9CQR6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp6cQ9CQR6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppp6cQ9CQR6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppp6cQ9CQR6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp6cQ9CQR6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp6cQ9CQR6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp6cQ9CQR6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp6cQ9CQR6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppp6cQ9CQR6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp6cQ9CQR6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp6cQ9CQR6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp6cQ9CQR6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp6cQ9CQR6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp6cQ9CQR6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp6cQ9CQR6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp6cQ9CQR6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp6cQ9CQR6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp6cQ9CQR6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp6cQ9CQR6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp6cQ9CQR6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp6cQ9CQR6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppp6cQ9CQR6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp6cQ9CQR6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp6cQ9CQR6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppp6cQ9CQR6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppp6cQ9CQR6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp6cQ9CQR6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp6cQ9CQR6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppp6cQ9CQR6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppp6cQ9CQR6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp6cQ9CQR6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp6cQ9CQR6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppp6cQ9CQR6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppp6cQ9CQR6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp6cQ9CQR6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp6cQ9CQR6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppp6cQ9CQR6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp6cQ9CQR6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppp6cQ9CQR6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppp6cQ9CQR6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppp6cQ9CQR6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppp6cQ9CQR6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp6cQ9CQR6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppp6cQ9CQR6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppp6cQ9CQR6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppp6cQ9CQR6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppp6cQ9CQR6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppp6cQ9CQR6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppp6cQ9CQR6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppp6cQ9CQR6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppp6cQ9CQR6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppp6cQ9CQR6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppp6cQ9CQR6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppp6cQ9CQR6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppp6cQ9CQR6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppp6cQ9CQR6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms