Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8Y1

Capsl, Calcyphosin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CapslQ6P8Y1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CapslQ6P8Y1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CapslQ6P8Y1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CapslQ6P8Y1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CapslQ6P8Y1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CapslQ6P8Y1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CapslQ6P8Y1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CapslQ6P8Y1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CapslQ6P8Y1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CapslQ6P8Y1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CapslQ6P8Y1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CapslQ6P8Y1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CapslQ6P8Y1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CapslQ6P8Y1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CapslQ6P8Y1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CapslQ6P8Y1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CapslQ6P8Y1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CapslQ6P8Y1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CapslQ6P8Y1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CapslQ6P8Y1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CapslQ6P8Y1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CapslQ6P8Y1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CapslQ6P8Y1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CapslQ6P8Y1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CapslQ6P8Y1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CapslQ6P8Y1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CapslQ6P8Y1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CapslQ6P8Y1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CapslQ6P8Y1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CapslQ6P8Y1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CapslQ6P8Y1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CapslQ6P8Y1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CapslQ6P8Y1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CapslQ6P8Y1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CapslQ6P8Y1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CapslQ6P8Y1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CapslQ6P8Y1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CapslQ6P8Y1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CapslQ6P8Y1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CapslQ6P8Y1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CapslQ6P8Y1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CapslQ6P8Y1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CapslQ6P8Y1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CapslQ6P8Y1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CapslQ6P8Y1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CapslQ6P8Y1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CapslQ6P8Y1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CapslQ6P8Y1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CapslQ6P8Y1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CapslQ6P8Y1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CapslQ6P8Y1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CapslQ6P8Y1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CapslQ6P8Y1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CapslQ6P8Y1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CapslQ6P8Y1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CapslQ6P8Y1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CapslQ6P8Y1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CapslQ6P8Y1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CapslQ6P8Y1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CapslQ6P8Y1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CapslQ6P8Y1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CapslQ6P8Y1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CapslQ6P8Y1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CapslQ6P8Y1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CapslQ6P8Y1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CapslQ6P8Y1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CapslQ6P8Y1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CapslQ6P8Y1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CapslQ6P8Y1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CapslQ6P8Y1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CapslQ6P8Y1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CapslQ6P8Y1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CapslQ6P8Y1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CapslQ6P8Y1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CapslQ6P8Y1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CapslQ6P8Y1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CapslQ6P8Y1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CapslQ6P8Y1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CapslQ6P8Y1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CapslQ6P8Y1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CapslQ6P8Y1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CapslQ6P8Y1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CapslQ6P8Y1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CapslQ6P8Y1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CapslQ6P8Y1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CapslQ6P8Y1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CapslQ6P8Y1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CapslQ6P8Y1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CapslQ6P8Y1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CapslQ6P8Y1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CapslQ6P8Y1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CapslQ6P8Y1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CapslQ6P8Y1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CapslQ6P8Y1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CapslQ6P8Y1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CapslQ6P8Y1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CapslQ6P8Y1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CapslQ6P8Y1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CapslQ6P8Y1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CapslQ6P8Y1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms