Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Hoxd13P70217 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Hoxd13P70217 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Hoxd13P70217 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Hoxd13P70217 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Hoxd13P70217 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Hoxd13P70217 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Hoxd13P70217 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Hoxd13P70217 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Hoxd13P70217 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Hoxd13P70217 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Hoxd13P70217 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Hoxd13P70217 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Hoxd13P70217 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Hoxd13P70217 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hoxd13P70217 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Hoxd13P70217 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Hoxd13P70217 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Hoxd13P70217 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Hoxd13P70217 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hoxd13P70217 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Hoxd13P70217 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hoxd13P70217 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Hoxd13P70217 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hoxd13P70217 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hoxd13P70217 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hoxd13P70217 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Hoxd13P70217 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Hoxd13P70217 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Hoxd13P70217 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hoxd13P70217 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hoxd13P70217 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Hoxd13P70217 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Hoxd13P70217 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Hoxd13P70217 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Hoxd13P70217 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Hoxd13P70217 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Hoxd13P70217 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Hoxd13P70217 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Hoxd13P70217 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Hoxd13P70217 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Hoxd13P70217 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Hoxd13P70217 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Hoxd13P70217 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hoxd13P70217 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Hoxd13P70217 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Hoxd13P70217 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Hoxd13P70217 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Hoxd13P70217 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Hoxd13P70217 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hoxd13P70217 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Hoxd13P70217 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Hoxd13P70217 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hoxd13P70217 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Hoxd13P70217 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Hoxd13P70217 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Hoxd13P70217 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Hoxd13P70217 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Hoxd13P70217 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Hoxd13P70217 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Hoxd13P70217 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Hoxd13P70217 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hoxd13P70217 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Hoxd13P70217 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hoxd13P70217 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hoxd13P70217 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Hoxd13P70217 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Hoxd13P70217 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hoxd13P70217 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Hoxd13P70217 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hoxd13P70217 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Hoxd13P70217 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Hoxd13P70217 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Hoxd13P70217 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Hoxd13P70217 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Hoxd13P70217 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hoxd13P70217 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hoxd13P70217 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hoxd13P70217 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hoxd13P70217 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hoxd13P70217 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hoxd13P70217 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hoxd13P70217 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hoxd13P70217 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hoxd13P70217 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hoxd13P70217 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Hoxd13P70217 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hoxd13P70217 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hoxd13P70217 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hoxd13P70217 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hoxd13P70217 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hoxd13P70217 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hoxd13P70217 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hoxd13P70217 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hoxd13P70217 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Hoxd13P70217 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hoxd13P70217 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hoxd13P70217 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hoxd13P70217 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Hoxd13P70217 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms