Protein–RNA interactions for Protein: Q02013

Aqp1, Aquaporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp1Q02013 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
Aqp1Q02013 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Aqp1Q02013 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,81■■■□□ 2,68
Aqp1Q02013 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Aqp1Q02013 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,9■■■□□ 2,54
Aqp1Q02013 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Aqp1Q02013 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Aqp1Q02013 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Aqp1Q02013 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Aqp1Q02013 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Aqp1Q02013 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Aqp1Q02013 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Aqp1Q02013 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Aqp1Q02013 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Aqp1Q02013 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Aqp1Q02013 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Aqp1Q02013 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
Aqp1Q02013 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Aqp1Q02013 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Aqp1Q02013 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Aqp1Q02013 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Aqp1Q02013 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Aqp1Q02013 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Aqp1Q02013 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Aqp1Q02013 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Aqp1Q02013 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Aqp1Q02013 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Aqp1Q02013 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Aqp1Q02013 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Aqp1Q02013 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Aqp1Q02013 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Aqp1Q02013 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Aqp1Q02013 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Aqp1Q02013 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Aqp1Q02013 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Aqp1Q02013 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Aqp1Q02013 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Aqp1Q02013 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Aqp1Q02013 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Aqp1Q02013 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Aqp1Q02013 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Aqp1Q02013 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Aqp1Q02013 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Aqp1Q02013 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Aqp1Q02013 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Aqp1Q02013 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Aqp1Q02013 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,55■■■□□ 2
Aqp1Q02013 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Aqp1Q02013 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Aqp1Q02013 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Aqp1Q02013 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Aqp1Q02013 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Aqp1Q02013 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Aqp1Q02013 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Aqp1Q02013 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Aqp1Q02013 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Aqp1Q02013 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Aqp1Q02013 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Aqp1Q02013 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Aqp1Q02013 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Aqp1Q02013 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Aqp1Q02013 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
Aqp1Q02013 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Aqp1Q02013 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Aqp1Q02013 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Aqp1Q02013 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Aqp1Q02013 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Aqp1Q02013 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Aqp1Q02013 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Aqp1Q02013 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Aqp1Q02013 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Aqp1Q02013 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Aqp1Q02013 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Aqp1Q02013 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Aqp1Q02013 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Aqp1Q02013 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Aqp1Q02013 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Aqp1Q02013 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Aqp1Q02013 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Aqp1Q02013 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Aqp1Q02013 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Aqp1Q02013 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Aqp1Q02013 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Aqp1Q02013 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Aqp1Q02013 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Aqp1Q02013 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Aqp1Q02013 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Aqp1Q02013 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Aqp1Q02013 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Aqp1Q02013 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Aqp1Q02013 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Aqp1Q02013 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Aqp1Q02013 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Aqp1Q02013 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Aqp1Q02013 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Aqp1Q02013 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Aqp1Q02013 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Aqp1Q02013 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Aqp1Q02013 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Aqp1Q02013 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53,3 ms