Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Gm3558Q5FWC9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gm3558Q5FWC9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Gm3558Q5FWC9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Gm3558Q5FWC9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gm3558Q5FWC9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gm3558Q5FWC9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Gm3558Q5FWC9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Gm3558Q5FWC9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gm3558Q5FWC9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gm3558Q5FWC9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Gm3558Q5FWC9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Gm3558Q5FWC9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gm3558Q5FWC9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gm3558Q5FWC9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm3558Q5FWC9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm3558Q5FWC9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm3558Q5FWC9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm3558Q5FWC9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm3558Q5FWC9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gm3558Q5FWC9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm3558Q5FWC9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm3558Q5FWC9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm3558Q5FWC9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm3558Q5FWC9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm3558Q5FWC9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm3558Q5FWC9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm3558Q5FWC9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm3558Q5FWC9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm3558Q5FWC9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm3558Q5FWC9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm3558Q5FWC9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm3558Q5FWC9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm3558Q5FWC9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm3558Q5FWC9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm3558Q5FWC9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm3558Q5FWC9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm3558Q5FWC9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm3558Q5FWC9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm3558Q5FWC9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm3558Q5FWC9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm3558Q5FWC9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm3558Q5FWC9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm3558Q5FWC9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm3558Q5FWC9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm3558Q5FWC9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm3558Q5FWC9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm3558Q5FWC9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm3558Q5FWC9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm3558Q5FWC9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm3558Q5FWC9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm3558Q5FWC9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm3558Q5FWC9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm3558Q5FWC9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm3558Q5FWC9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm3558Q5FWC9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm3558Q5FWC9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm3558Q5FWC9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm3558Q5FWC9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm3558Q5FWC9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm3558Q5FWC9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm3558Q5FWC9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm3558Q5FWC9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm3558Q5FWC9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm3558Q5FWC9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm3558Q5FWC9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm3558Q5FWC9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm3558Q5FWC9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm3558Q5FWC9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm3558Q5FWC9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm3558Q5FWC9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm3558Q5FWC9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm3558Q5FWC9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm3558Q5FWC9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm3558Q5FWC9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm3558Q5FWC9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm3558Q5FWC9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm3558Q5FWC9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm3558Q5FWC9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm3558Q5FWC9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm3558Q5FWC9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm3558Q5FWC9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm3558Q5FWC9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm3558Q5FWC9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm3558Q5FWC9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm3558Q5FWC9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm3558Q5FWC9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm3558Q5FWC9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm3558Q5FWC9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm3558Q5FWC9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm3558Q5FWC9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm3558Q5FWC9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm3558Q5FWC9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm3558Q5FWC9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm3558Q5FWC9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm3558Q5FWC9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm3558Q5FWC9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm3558Q5FWC9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm3558Q5FWC9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3558Q5FWC9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
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