Protein–RNA interactions for Protein: O09043

Napsa, Napsin-A, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapsaO09043 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NapsaO09043 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NapsaO09043 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NapsaO09043 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NapsaO09043 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NapsaO09043 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NapsaO09043 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NapsaO09043 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NapsaO09043 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NapsaO09043 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NapsaO09043 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NapsaO09043 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NapsaO09043 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NapsaO09043 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NapsaO09043 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NapsaO09043 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NapsaO09043 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NapsaO09043 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NapsaO09043 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NapsaO09043 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NapsaO09043 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NapsaO09043 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NapsaO09043 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NapsaO09043 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NapsaO09043 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NapsaO09043 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NapsaO09043 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NapsaO09043 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NapsaO09043 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NapsaO09043 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NapsaO09043 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NapsaO09043 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NapsaO09043 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NapsaO09043 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NapsaO09043 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NapsaO09043 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NapsaO09043 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NapsaO09043 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NapsaO09043 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NapsaO09043 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NapsaO09043 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NapsaO09043 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NapsaO09043 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NapsaO09043 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NapsaO09043 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NapsaO09043 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NapsaO09043 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NapsaO09043 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NapsaO09043 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NapsaO09043 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NapsaO09043 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NapsaO09043 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NapsaO09043 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NapsaO09043 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NapsaO09043 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NapsaO09043 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NapsaO09043 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NapsaO09043 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NapsaO09043 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NapsaO09043 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NapsaO09043 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NapsaO09043 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NapsaO09043 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NapsaO09043 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NapsaO09043 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NapsaO09043 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NapsaO09043 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NapsaO09043 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NapsaO09043 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NapsaO09043 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NapsaO09043 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NapsaO09043 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NapsaO09043 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NapsaO09043 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NapsaO09043 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NapsaO09043 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NapsaO09043 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NapsaO09043 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NapsaO09043 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NapsaO09043 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NapsaO09043 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NapsaO09043 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NapsaO09043 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NapsaO09043 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NapsaO09043 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NapsaO09043 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NapsaO09043 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NapsaO09043 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NapsaO09043 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NapsaO09043 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NapsaO09043 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NapsaO09043 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NapsaO09043 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NapsaO09043 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NapsaO09043 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NapsaO09043 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NapsaO09043 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NapsaO09043 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NapsaO09043 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NapsaO09043 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms