RNA–Protein interactions for RNA: YMR063W

RIM9, Transcript of Plasma membrane protein of unknown function, yeast

Gene RIM9, Length 720 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM9	YMR063W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	OXR1	Q08952	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	GUP1	P53154	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	YAF9	P53930	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	PRY1	P47032	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	YJR107W	P47145	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	PMT7	Q06644	662 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	ASF1	P32447	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	SAP155	P43612	1002 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	ULP1	Q02724	621 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	SLP1	Q12232	587 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	ERS1	P17261	260 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	YAP3	P38749	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RIM9	YMR063W	GCN2	P15442	1659 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	SAC7	P17121	654 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	PEP7	P32609	515 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	RSM26	P47141	266 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	BUD9	P53226	547 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	YGR122W	P53272	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	PEX13	P80667	386 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	ELG1	Q12050	791 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	PHM7	Q12252	991 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	CYC8	P14922	966 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	SQT1	P35184	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	ICP55	P40051	511 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	LEM3	P42838	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	MCA1	Q08601	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	RAD2	P07276	1031 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	PIC2	P40035	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	PDR11	P40550	1411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	SSM4	P40318	1319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	MSH3	P25336	1018 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	EXO5	P38289	585 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	PEX28	P38848	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	DSE4	P53753	1117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	ADI1	Q03677	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	YIG1	Q08956	461 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	AI3	P03877	415 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	TAT1	P38085	619 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	MRPS18	P42847	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	SLS1	P42900	643 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	YKL077W	P36081	392 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	NEM1	P38757	446 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	XKS1	P42826	600 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	MAK10	Q02197	733 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RIM9	YMR063W	NUP192	P47054	1683 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RIM9	YMR063W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RIM9	YMR063W	SKN7	P38889	622 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RIM9	YMR063W	SHU2	P38957	223 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RIM9	YMR063W	GCV1	P48015	400 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RIM9	YMR063W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RIM9	YMR063W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RIM9	YMR063W	FAR11	P53917	953 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RIM9	YMR063W	MEC3	Q02574	474 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RIM9	YMR063W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RIM9	YMR063W	MCD1	Q12158	566 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RIM9	YMR063W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 63.5 ms