RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A XKS1P42826 600 aa5.03□□□□□ -1.6
YMR001C-AYMR001C-A RSM26P47141 266 aa5.03□□□□□ -1.6
YMR001C-AYMR001C-A MET4P32389 672 aa5.02□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A ULP1Q02724 621 aa5.02□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A DAK2P43550 591 aa5.01□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A YDL177CQ12257 170 aa5.01□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A SAM35P14693 329 aa5□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A VPS35P34110 944 aa5□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A YHL012WP38709 493 aa5□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A ETP1P38748 585 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A PEX28P38848 579 aa5□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A GIS1Q03833 894 aa5□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A RSA3Q05942 220 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A WHI5Q12416 295 aa5□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A HEM13P11353 328 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A GCD6P32501 712 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A SQT1P35184 431 aa4.99□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A AIM3P38266 947 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A SSF1P38789 453 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A VMA4P22203 233 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A ATG14P38270 344 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A THI12P42883 340 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A THI5P43534 340 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A YJL045WP47052 634 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A THI11P47183 340 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A MRPL22P53881 309 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A THI13Q07748 340 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A LAP2Q10740 671 aa4.98□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A KAR2P16474 682 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A HSE1P38753 452 aa4.97□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A YGL140CP53120 1219 aa4.97□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A MSC6Q08818 692 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
YMR001C-AYMR001C-A SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data4.96□□□□□ -1.62not detected
YMR001C-AYMR001C-A RDH54P38086 958 aa4.96□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A PPX1P38698 397 aa4.96□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A QNS1P38795 714 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A FAA3P39002 694 aa4.96□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A OXR1Q08952 273 aa4.96□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A PRP6P19735 899 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A AIM26P32858 118 aa4.95□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A ADD66P36040 267 aa4.95□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A FLR1P38124 548 aa4.95□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A ADI1Q03677 179 aa4.95□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A HRK1Q08732 759 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A MDL2P33311 773 aa4.94□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A STM1P39015 273 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A YPL109CQ02981 657 aa4.94□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A AFG2P32794 780 aa4.93□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A RPT1P33299 467 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A PIC2P40035 300 aa4.93□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data4.93□□□□□ -1.62not detected
YMR001C-AYMR001C-A RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A DED1P06634 604 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A YSC84P32793 468 aa4.92□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A IPL1P38991 367 aa4.92□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A GPB2P39717 880 aa4.92□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A FOL2P51601 243 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A EST2Q06163 884 aa4.92□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A HXK1P04806 485 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A KIP1P28742 1111 aa4.91□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A TOD6P34219 525 aa4.91□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A RKM2Q03942 479 aa4.91□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A HDA2Q06629 674 aa4.91□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A YPL277CQ08989 487 aa4.91□□□□□ -1.62
YMR001C-AYMR001C-A SRO9P25567 434 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A VPS53P47061 822 aa4.9□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A RSC58Q07979 502 aa4.9□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A RPS13P05756 151 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A SEC23P15303 768 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A RIM8P53179 542 aa4.89□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A PTC5Q12511 572 aa4.89□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A SPS1P08458 490 aa4.88□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A SNO2P53823 222 aa4.88□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A SPO21Q12411 609 aa4.88□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A SOD2P00447 233 aa4.87□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A ALG3P38179 458 aa4.87□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A ROD1Q02805 837 aa4.86□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A NBA1Q08229 501 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A COQ4O13525 335 aa4.85□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A YFL054CP43549 646 aa4.85□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A HOS3Q02959 697 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A SEC20P28791 383 aa4.84□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A MRPS18P42847 217 aa4.84□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
YMR001C-AYMR001C-A PRE9P23638 258 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A BAP2P38084 609 aa4.83□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A CCZ1P38273 704 aa4.83□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A RPS26AP39938 119 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A RPS26BP39939 119 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A YGR122WP53272 402 aa4.83□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A TNA1P53322 534 aa4.83□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A RSB1Q08417 382 aa4.83□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A CYC1P00044 109 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A SNF5P18480 905 aa4.82□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A MCM2P29469 868 aa4.82□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A ROT1Q03691 256 aa4.82□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A SGD1Q06132 899 aa4.82□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A RAD2P07276 1031 aa4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12 ms