RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W FPR3P38911 411 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data5.32□□□□□ -1.56not detected
PIR3YKL163W NTA1P40354 457 aa5.32□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W DSE4P53753 1117 aa5.32□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W YBL113CQ7M4S9 792 aa5.32□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W PPG1P32838 368 aa5.31□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W YBR287WP38355 427 aa5.31□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W RAD55P38953 406 aa5.31□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W POL32P47110 350 aa5.31□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W YGR130CP53278 816 aa5.31□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W RNH70P53331 553 aa5.31□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W MED7Q08278 222 aa5.31□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W REC8Q12188 680 aa5.31□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W SRB8P25648 1427 aa5.31□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W FUS1P11710 512 aa5.3□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W SAF1P38352 637 aa5.3□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W YMR074CQ04773 145 aa5.3□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W SOG2Q08817 791 aa5.3□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W YOL098CQ12496 1037 aa5.3□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W POL5P39985 1022 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W PSY2P40164 858 aa5.29□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W GUP1P53154 560 aa5.29□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data5.29□□□□□ -1.56not detected
PIR3YKL163W CHS2P14180 963 aa5.28□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W IRS4P36115 615 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W TOS1P38288 455 aa5.28□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W CTH1P47976 325 aa5.28□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W UBX5Q06682 500 aa5.28□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W GIN4Q12263 1142 aa5.28□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W LIP5P32875 414 aa5.27□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W SMC1P32908 1225 aa5.27□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W MGE1P38523 228 aa5.27□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W ERP5P38819 212 aa5.27□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W NEO1P40527 1151 aa5.27□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W YJR124CP47159 448 aa5.27□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W YNR065CP53751 1116 aa5.27□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W ERS1P17261 260 aa5.26□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W PYC2P32327 1180 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W MAE1P36013 669 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W YHL050CP38721 697 aa5.26□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W YHR219WP38900 624 aa5.26□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W NOP2P40991 618 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W PDR11P40550 1411 aa5.25□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W TSR4P25040 408 aa5.25□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W GLO3P38682 493 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W PPX1P38698 397 aa5.25□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W AVT1P47082 602 aa5.25□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W NCE103P53615 221 aa5.25□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W HAS1Q03532 505 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W SPO71Q03868 1245 aa5.25□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W KAR5Q04746 504 aa5.25□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W ELG1Q12050 791 aa5.25□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W GLO4Q12320 285 aa5.25□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W BCK1Q01389 1478 aa5.25□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W ATE1P16639 503 aa5.24□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W SEC8P32855 1065 aa5.24□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W QDR1P40475 563 aa5.24□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W LEM3P42838 414 aa5.24□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W CTR9P89105 1077 aa5.24□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W ENT1Q12518 454 aa5.24□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W CYC7P00045 113 aa5.23□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W HVG1P0CE11 249 aa5.23□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data5.23□□□□□ -1.57not detected
PIR3YKL163W KIP3P53086 805 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W RIA1P53893 1110 aa5.23□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W BRE4Q07660 1125 aa5.23□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W KRE5P22023 1365 aa5.23□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W SPO74P45819 413 aa5.22□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W POB3Q04636 552 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PIR3YKL163W GRS1P38088 690 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W IRC24P40580 263 aa5.21□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W TPO2P53283 614 aa5.21□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W COBP00163 385 aa5.2□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W TRL1P09880 827 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W SSB1P11484 613 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W SEA4P38164 1038 aa5.2□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W SSB2P40150 613 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W IMH1Q06704 911 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W DUR3P33413 735 aa5.19□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W FET4P40988 552 aa5.19□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W MDJ2P42834 146 aa5.19□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W YJL049WP47048 450 aa5.19□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W YGL081WP53156 320 aa5.19□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W ALG12P53730 551 aa5.19□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W RSC4Q02206 625 aa5.19□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W MNN4P36044 1178 aa5.18□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W VAC8P39968 578 aa5.18□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W TPM2P40414 161 aa5.18□□□□□ -1.58
PIR3YKL163W MAD1P40957 749 aa5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.2 ms