RNA–Protein interactions for RNA: YHR081W

LRP1, Transcript of Nuclear exosome-associated nucleic acid binding protein, yeast

Gene LRP1, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LRP1	YHR081W	MCD1	Q12158	566 aa		5	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	CYC7	P00045	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	NFS1	P25374	497 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	ASF1	P32447	279 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	OMA1	P36163	345 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	ALT1	P52893	592 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	SDH1	Q00711	640 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	MED7	Q08278	222 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	SEA4	P38164	1038 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	INP52	P50942	1183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	ROD1	Q02805	837 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	GCR1	P07261	785 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	AFG2	P32794	780 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	MAC1	P35192	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	CIT3	P43635	486 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	CTH1	P47976	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	EST2	Q06163	884 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	MRL1	Q06815	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LRP1	YHR081W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	LIP5	P32875	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	ADD66	P36040	267 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	ATG14	P38270	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	GNP1	P48813	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	RCM1	P53972	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	TPP1	Q03796	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	NNK1	P36003	928 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	YVC1	Q12324	675 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	HXT13	P39924	564 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	YJL045W	P47052	634 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	HXT17	P53631	564 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	HXT15	P54854	567 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
LRP1	YHR081W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	GPB2	P39717	880 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	LAP2	Q10740	671 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	MKK2	P32491	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	ALG3	P38179	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	SIW14	P53965	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	RKM2	Q03942	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	PET112	P33893	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	HSE1	P38753	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	PTC5	Q12511	572 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP1	YHR081W	KIP1	P28742	1111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	PRO1	P32264	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	DUT1	P33317	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	PEX7	P39108	375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	SSY1	Q03770	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	TRE1	Q08919	783 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	TAF13	P11747	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	PTC7	P38797	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	GTS1	P40956	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	VPS53	P47061	822 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	RMD1	Q03441	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	NSI1	Q12457	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	SAM35	P14693	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	RER2	P35196	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	YHL012W	P38709	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	CDC34	P14682	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	LRG1	P35688	1017 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	YFL054C	P43549	646 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	EEB1	Q02891	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	AOS1	Q06624	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	MLS1	P30952	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	YSC84	P32793	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	HSP78	P33416	811 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	SPO21	Q12411	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	ADP1	P25371	1049 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	RAD27	P26793	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	CNN1	P43618	361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
LRP1	YHR081W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	YER152C	P10356	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
LRP1	YHR081W	MCM7	P38132	845 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	ENT3	P47160	408 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	ESC2	Q06340	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP1	YHR081W	AIM26	P32858	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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