RNA–Protein interactions for RNA: YHR029C

YHI9, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YHI9, Length 885 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHI9	YHR029C	HXT8	P40886	569 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	YJL181W	P46987	611 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	TYW3	P53177	273 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	PEX8	P53248	589 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	RSC2	Q06488	889 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	SLP1	Q12232	587 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	SFP1	P32432	683 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	RPN12	P32496	274 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	SMC1	P32908	1225 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	FAA3	P39002	694 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	IES1	P43579	692 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	PPT1	P53043	513 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	OPI10	Q08202	246 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	FLC1	Q08967	793 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	SLX4	Q12098	748 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	NYV1	Q12255	253 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	COQ2	P32378	372 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	YKR073C	P36153	106 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	TED1	P40533	473 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	RSC4	Q02206	625 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	ATG16	Q03818	150 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	BSC2	Q05611	235 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	MED7	Q08278	222 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	MSN1	P22148	382 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	SFA1	P32771	386 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	LIP5	P32875	414 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	KAE1	P36132	386 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	PAF1	P38351	445 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	YBR287W	P38355	427 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	RAD55	P38953	406 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	FIR1	P40020	876 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	GIP2	P40036	548 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	MRPS18	P42847	217 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
YHI9	YHR029C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	YIL165C	P40446	119 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	YGR021W	P53212	290 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	DAL4	Q04895	635 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	HIF1	Q12373	385 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	TMA17	Q12513	150 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	CDC34	P14682	295 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	RSC6	P25632	483 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	NIT1	P40447	199 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	RGD2	P43556	714 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	HLJ1	P48353	224 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	SPO75	Q07798	868 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	ERP4	Q12450	207 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	HIR1	P32479	840 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	MTC2	P34246	357 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	YKL069W	P36088	180 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	TOS1	P38288	455 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	NTA1	P40354	457 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	SND1	Q04007	877 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	BAS1	P22035	811 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	CDC11	P32458	415 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	AIM46	P38885	310 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	VID27	P40157	782 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	PSY2	P40164	858 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	YJR120W	P47157	116 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	YGR237C	P50089	785 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	YGR053C	P53234	283 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	DSE4	P53753	1117 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	NTG2	Q08214	380 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	MCD1	Q12158	566 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	UGA4	P32837	571 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YHI9	YHR029C	YBR184W	P38299	523 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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