RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000180802.1

Gm20109-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20109, Length 671 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP29,89■■■□□ 2,38
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Akt1s1Q9D1F4 257 aa29,89■■■□□ 2,38
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa29,88■■■□□ 2,37
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Gm7361D3Z6R1 267 aa29,88■■■□□ 2,37
Gm20109-201ENSMUST00000180802 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa29,88■■■□□ 2,37
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Gm1979E9QAN3 267 aa29,88■■■□□ 2,37
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Gm5862K7N5V5 267 aa29,88■■■□□ 2,37
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Gm10220K7N660 267 aa29,88■■■□□ 2,37
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP29,88■■■□□ 2,37
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Magea1O89006 320 aa29,87■■■□□ 2,37
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Magea5O89009 320 aa29,87■■■□□ 2,37
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Magea2Q9R2A2 320 aa29,87■■■□□ 2,37
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Slc5a1Q8C3K6 665 aa29,83■■■□□ 2,37
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Phkg2Q9DB30 406 aa29,83■■■□□ 2,37
Gm20109-201ENSMUST00000180802 AtrnQ9WU60 1428 aa29,82■■■□□ 2,36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Asic4Q7TNS7 539 aa29,82■■■□□ 2,36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Crb1Q8VHS2 1405 aa29,81■■■□□ 2,36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Mcm10Q0VBD2 885 aa29,81■■■□□ 2,36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa29,8■■■□□ 2,36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Pdzd9Q9D9M4 266 aa29,8■■■□□ 2,36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ints5Q8CHT3 1018 aa29,79■■■□□ 2,36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa29,79■■■□□ 2,36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP29,79■■■□□ 2,36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa29,78■■■□□ 2,36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Trpc5Q9QX29 975 aa29,78■■■□□ 2,36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 PalmQ9Z0P4 383 aa29,78■■■□□ 2,36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 TnikP83510 1323 aa29,77■■■□□ 2,36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 HypkQ9CR41 129 aa29,77■■■□□ 2,36
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP29,76■■■□□ 2,35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ssfa2Q922B9 1252 aa29,76■■■□□ 2,35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa29,76■■■□□ 2,35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Igsf1Q7TQA1 1317 aa29,75■■■□□ 2,35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Amotl1Q9D4H4 968 aa29,75■■■□□ 2,35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Bicdl1A0JNT9 577 aa29,74■■■□□ 2,35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Kcnq2Q9Z351 759 aa29,74■■■□□ 2,35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Zfp777B9EKF4 885 aa29,73■■■□□ 2,35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ubxn2bQ0KL01 331 aa29,73■■■□□ 2,35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Aox2Q5SGK3 1345 aa29,72■■■□□ 2,35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Emilin1Q99K41 1017 aa29,71■■■□□ 2,35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Chmp7Q8R1T1 451 aa29,7■■■□□ 2,35
Gm20109-201ENSMUST00000180802 IncenpQ9WU62 880 aa29,69■■■□□ 2,34
Gm20109-201ENSMUST00000180802 MeiocA2AG06 965 aa29,68■■■□□ 2,34
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Atg3Q9CPX6 314 aa29,68■■■□□ 2,34
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Kcna3P16390 528 aa29,67■■■□□ 2,34
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Nkx2-3P97334 362 aa29,66■■■□□ 2,34
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Nlrp6Q91WS2 869 aa29,66■■■□□ 2,34
Gm20109-201ENSMUST00000180802 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP29,66■■■□□ 2,34
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Fchsd2Q3USJ8 740 aa29,65■■■□□ 2,34
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Spef2Q8C9J3 1734 aa29,65■■■□□ 2,34
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Tsen2Q6P7W5 460 aa29,64■■■□□ 2,34
Gm20109-201ENSMUST00000180802 ErfeQ6PGN1 340 aa29,62■■■□□ 2,33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Jdp2P97875 163 aa29,61■■■□□ 2,33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP29,61■■■□□ 2,33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Msl1Q6PDM1 616 aa29,6■■■□□ 2,33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Stk31Q99MW1 1018 aa29,6■■■□□ 2,33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Cap2Q9CYT6 476 aa29,6■■■□□ 2,33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Dcaf5Q80T85 946 aa29,59■■■□□ 2,33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ccdc155Q80VJ8 648 aa29,59■■■□□ 2,33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Jmjd4Q8BFT6 427 aa29,59■■■□□ 2,33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Chrna2Q91X60 512 aa29,59■■■□□ 2,33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Gm13023A2A8N2 498 aa29,58■■■□□ 2,33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Snap23O09044 210 aa29,58■■■□□ 2,33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa29,58■■■□□ 2,33
Gm20109-201ENSMUST00000180802 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP29,56■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa29,55■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 NppbP40753 121 aa29,55■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Smarcc1P97496 1104 aa29,55■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP29,55■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Col23a1Q8K4G2 532 aa29,55■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 GsdmaQ9EST1 446 aa29,55■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP29,55■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP29,54■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Rad23bP54728 416 aa29,54■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP29,54■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Sumf1Q8R0F3 372 aa29,54■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Miga2Q8BK03 593 aa29,53■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa29,52■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Cabp2Q9JLK4 216 aa29,52■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Sos1Q62245 1319 aa29,51■■■□□ 2,32
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Prom2Q3UUY6 835 aa29,51■■■□□ 2,31
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Hirip3Q8BLH7 601 aa29,51■■■□□ 2,31
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Trpm3Q5F4S9 1721 aa29,51■■■□□ 2,31
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP29,48■■■□□ 2,31
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa29,48■■■□□ 2,31
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Lrp5Q91VN0 1614 aa29,48■■■□□ 2,31
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Sned1Q70E20 1403 aa29,47■■■□□ 2,31
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ubr3Q5U430 1889 aa29,45■■■□□ 2,31
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Spata31d1bE9QA57 1361 aa29,45■■■□□ 2,31
Gm20109-201ENSMUST00000180802 AceP09470 1312 aa29,45■■■□□ 2,3
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Q7TT23 1179 aa29,44■■■□□ 2,3
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ppm1fQ8CGA0 452 aa29,44■■■□□ 2,3
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Ric1Q69ZJ7 1422 aa29,44■■■□□ 2,3
Gm20109-201ENSMUST00000180802 C4bP01029 1738 aa29,43■■■□□ 2,3
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Efcab2Q9CQ46 164 aa29,42■■■□□ 2,3
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Kndc1Q0KK55 1742 aa29,41■■■□□ 2,3
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Q4VA45 678 aa29,41■■■□□ 2,3
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Col11a2Q64739 1736 aa29,4■■■□□ 2,3
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Iqcf3Q9D498 203 aa29,4■■■□□ 2,3
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Abcc12Q80WJ6 1366 aa29,39■■■□□ 2,3
Gm20109-201ENSMUST00000180802 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa29,38■■■□□ 2,29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24,6 ms