RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101398.9

Ttc6-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat domain 6, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc6, Length 1,484 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc6-201ENSMUST00000101398 PappaQ8R4K8 1624 aa28.82■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Aox2Q5SGK3 1345 aa28.82■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Golga2Q921M4 999 aa28.82■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Phkg2Q9DB30 406 aa28.82■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa28.81■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Ccdc6D3YZP9 469 aa28.81■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Lrit1Q8K099 624 aa28.8■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Ssfa2Q922B9 1252 aa28.8■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Apaf1O88879 1249 aa28.79■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Esx1O88933 382 aa28.79■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Cabp2Q9JLK4 216 aa28.79■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Pdzd9Q9D9M4 266 aa28.78■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Ppfibp2O35711 882 aa28.77■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Nsd3Q6P2L6 1439 aa28.76■■■□□ 2.2
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa28.75■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Pcgf6Q99NA9 353 aa28.75■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Asic4Q7TNS7 539 aa28.74■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Slc5a1Q8C3K6 665 aa28.74■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Ubap1lG3UW59 384 aa28.73■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Chmp7Q8R1T1 451 aa28.73■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Pnpla7A2AJ88 1352 aa28.73■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa28.72■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Cavin4A2AMM0 362 aa28.72■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Gm7361D3Z6R1 267 aa28.72■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa28.72■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Gm1979E9QAN3 267 aa28.72■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Gm5862K7N5V5 267 aa28.72■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Gm10220K7N660 267 aa28.72■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 GalcP54818 684 aa28.72■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Usp19Q3UJD6 1360 aa28.72■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Bsdc1Q80Y55 427 aa28.72■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Ciz1Q8VEH2 845 aa28.71■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Abcc12Q80WJ6 1366 aa28.7■■■□□ 2.19
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Uspl1Q3ULM6 1089 aa28.7■■■□□ 2.18
Ttc6-201ENSMUST00000101398 ApobrQ8VBT6 942 aa28.69■■■□□ 2.18
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa28.69■■■□□ 2.18
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa28.68■■■□□ 2.18
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Arhgap33Q80YF9 1305 aa28.67■■■□□ 2.18
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Crb1Q8VHS2 1405 aa28.67■■■□□ 2.18
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Sos2Q02384 1333 aa28.66■■■□□ 2.18
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Abca3Q8R420 1704 aa28.65■■■□□ 2.18
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Snap23O09044 210 aa28.65■■■□□ 2.18
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa28.64■■■□□ 2.18
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Vars2Q3U2A8 1060 aa28.64■■■□□ 2.17
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Sos1Q62245 1319 aa28.63■■■□□ 2.17
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Swt1Q9DBQ9 907 aa28.63■■■□□ 2.17
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Shank3Q4ACU6 1730 aa28.62■■■□□ 2.17
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Myo5bP21271 1818 aa28.61■■■□□ 2.17
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Ints5Q8CHT3 1018 aa28.61■■■□□ 2.17
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Nkx2-3P97334 362 aa28.6■■■□□ 2.17
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Dusp27Q148W8 1138 aa28.6■■■□□ 2.17
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Erbb3Q61526 1339 aa28.59■■■□□ 2.17
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Apba2P98084 750 aa28.58■■■□□ 2.17
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa28.57■■■□□ 2.16
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Stra8P70278 393 aa28.55■■■□□ 2.16
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Klc3Q91W40 508 aa28.54■■■□□ 2.16
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Snapc4Q8BP86 1333 aa28.54■■■□□ 2.16
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Cypt1Q8CH20 168 aa28.53■■■□□ 2.16
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa28.53■■■□□ 2.16
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Ccdc155Q80VJ8 648 aa28.53■■■□□ 2.16
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
Ttc6-201ENSMUST00000101398 CrbnQ8C7D2 445 aa28.51■■■□□ 2.15
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Pim2Q62070 370 aa28.49■■■□□ 2.15
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Atg3Q9CPX6 314 aa28.48■■■□□ 2.15
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Jmjd4Q8BFT6 427 aa28.46■■■□□ 2.15
Ttc6-201ENSMUST00000101398 OscarQ8VBT3 265 aa28.46■■■□□ 2.15
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Prim1P20664 417 aa28.45■■■□□ 2.14
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Ralbp1Q62172 648 aa28.45■■■□□ 2.14
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Btbd11Q6GQW0 1109 aa28.45■■■□□ 2.14
Ttc6-201ENSMUST00000101398 AceP09470 1312 aa28.45■■■□□ 2.14
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Ggnbp2Q5SV77 696 aa28.43■■■□□ 2.14
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa28.43■■■□□ 2.14
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa28.43■■■□□ 2.14
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Ankrd13dQ6PD24 605 aa28.42■■■□□ 2.14
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Dcaf5Q80T85 946 aa28.41■■■□□ 2.14
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Efcab2Q9CQ46 164 aa28.4■■■□□ 2.14
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Cap2Q9CYT6 476 aa28.4■■■□□ 2.14
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Ric1Q69ZJ7 1422 aa28.39■■■□□ 2.14
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Q8BT18 775 aa28.39■■■□□ 2.13
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Neurod2Q62414 383 aa28.38■■■□□ 2.13
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Atxn3Q9CVD2 355 aa28.38■■■□□ 2.13
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Adcy9P51830 1353 aa28.37■■■□□ 2.13
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Gnai1B2RSH2 354 aa28.37■■■□□ 2.13
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Gnai3Q9DC51 354 aa28.37■■■□□ 2.13
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Anks4bQ8K3X6 423 aa28.35■■■□□ 2.13
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Kndc1Q0KK55 1742 aa28.34■■■□□ 2.13
Ttc6-201ENSMUST00000101398 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Col1a2Q01149 1372 aa28.33■■■□□ 2.13
Ttc6-201ENSMUST00000101398 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.8 ms