RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089245.6

Shq1-201, Transcript of Protein SHQ1 homolog, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Shq1, Length 1,638 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa25.19■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm7361D3Z6R1 267 aa25.19■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa25.19■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm1979E9QAN3 267 aa25.19■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm5862K7N5V5 267 aa25.19■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm10220K7N660 267 aa25.19■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Arfgef2A2A5R2 1792 aa25.19■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Apaf1O88879 1249 aa25.18■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 NrdcQ8BHG1 1161 aa25.18■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Phkg2Q9DB30 406 aa25.18■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Chmp7Q8R1T1 451 aa25.17■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 ApobrQ8VBT6 942 aa25.17■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Golga2Q921M4 999 aa25.17■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc5a1Q8C3K6 665 aa25.16■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pdzd9Q9D9M4 266 aa25.16■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa25.15■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Esx1O88933 382 aa25.15■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tns2Q8CGB6 1400 aa25.15■■□□□ 1.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Q4VA45 678 aa25.14■■□□□ 1.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Asic4Q7TNS7 539 aa25.12■■□□□ 1.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Aox2Q5SGK3 1345 aa25.12■■□□□ 1.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Nsd3Q6P2L6 1439 aa25.12■■□□□ 1.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Arhgap33Q80YF9 1305 aa25.1■■□□□ 1.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pnpla7A2AJ88 1352 aa25.09■■□□□ 1.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ssfa2Q922B9 1252 aa25.09■■□□□ 1.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Vars2Q3U2A8 1060 aa25.08■■□□□ 1.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa25.07■■□□□ 1.6
Shq1-201ENSMUST00000089245 Snap23O09044 210 aa25.06■■□□□ 1.6
Shq1-201ENSMUST00000089245 Stra8P70278 393 aa25.06■■□□□ 1.6
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cavin4A2AMM0 362 aa25.05■■□□□ 1.6
Shq1-201ENSMUST00000089245 Q8BT18 775 aa25.04■■□□□ 1.6
Shq1-201ENSMUST00000089245 Trpm3Q5F4S9 1721 aa25.04■■□□□ 1.6
Shq1-201ENSMUST00000089245 Klc3Q91W40 508 aa25.04■■□□□ 1.6
Shq1-201ENSMUST00000089245 PappaQ8R4K8 1624 aa25.03■■□□□ 1.6
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ciz1Q8VEH2 845 aa25.03■■□□□ 1.6
Shq1-201ENSMUST00000089245 OscarQ8VBT3 265 aa25.02■■□□□ 1.6
Shq1-201ENSMUST00000089245 Apba2P98084 750 aa25.01■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ccdc155Q80VJ8 648 aa25.01■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Erbb3Q61526 1339 aa25.01■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Snapc4Q8BP86 1333 aa25.01■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ints5Q8CHT3 1018 aa25.01■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Swt1Q9DBQ9 907 aa25.01■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pim2Q62070 370 aa25■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Crb1Q8VHS2 1405 aa24.99■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sos2Q02384 1333 aa24.99■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa24.99■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Nkx2-3P97334 362 aa24.97■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dusp27Q148W8 1138 aa24.97■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Uspl1Q3ULM6 1089 aa24.97■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ankrd13dQ6PD24 605 aa24.97■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Abcc12Q80WJ6 1366 aa24.97■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Znf541Q0GGX2 1363 aa24.96■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sos1Q62245 1319 aa24.96■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa24.96■■□□□ 1.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Abca3Q8R420 1704 aa24.94■■□□□ 1.58
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Shq1-201ENSMUST00000089245 Usp19Q3UJD6 1360 aa24.93■■□□□ 1.58
Shq1-201ENSMUST00000089245 Jmjd4Q8BFT6 427 aa24.93■■□□□ 1.58
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
Shq1-201ENSMUST00000089245 Shank3Q4ACU6 1730 aa24.92■■□□□ 1.58
Shq1-201ENSMUST00000089245 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
Shq1-201ENSMUST00000089245 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa24.92■■□□□ 1.58
Shq1-201ENSMUST00000089245 Atg3Q9CPX6 314 aa24.91■■□□□ 1.58
Shq1-201ENSMUST00000089245 Btbd11Q6GQW0 1109 aa24.9■■□□□ 1.58
Shq1-201ENSMUST00000089245 CrbnQ8C7D2 445 aa24.9■■□□□ 1.58
Shq1-201ENSMUST00000089245 Bicdl1A0JNT9 577 aa24.9■■□□□ 1.58
Shq1-201ENSMUST00000089245 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa24.89■■□□□ 1.57
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ggnbp2Q5SV77 696 aa24.89■■□□□ 1.57
Shq1-201ENSMUST00000089245 Prim1P20664 417 aa24.87■■□□□ 1.57
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cap2Q9CYT6 476 aa24.87■■□□□ 1.57
Shq1-201ENSMUST00000089245 Irx6Q9ER75 438 aa24.87■■□□□ 1.57
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dcaf5Q80T85 946 aa24.86■■□□□ 1.57
Shq1-201ENSMUST00000089245 Efcab2Q9CQ46 164 aa24.86■■□□□ 1.57
Shq1-201ENSMUST00000089245 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa24.86■■□□□ 1.57
Shq1-201ENSMUST00000089245 Neurod2Q62414 383 aa24.86■■□□□ 1.57
Shq1-201ENSMUST00000089245 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa24.86■■□□□ 1.57
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
Shq1-201ENSMUST00000089245 AceP09470 1312 aa24.85■■□□□ 1.57
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
Shq1-201ENSMUST00000089245 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
Shq1-201ENSMUST00000089245 Myo5bP21271 1818 aa24.82■■□□□ 1.56
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ildr2B5TVM2 661 aa24.8■■□□□ 1.56
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
Shq1-201ENSMUST00000089245 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
Shq1-201ENSMUST00000089245 Atxn3Q9CVD2 355 aa24.79■■□□□ 1.56
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pibf1E9Q6K3 756 aa24.78■■□□□ 1.56
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gnai1B2RSH2 354 aa24.77■■□□□ 1.56
Shq1-201ENSMUST00000089245 Smarcc1P97496 1104 aa24.77■■□□□ 1.56
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ralbp1Q62172 648 aa24.77■■□□□ 1.56
Shq1-201ENSMUST00000089245 Klhdc4Q921I2 584 aa24.77■■□□□ 1.56
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gnai3Q9DC51 354 aa24.77■■□□□ 1.56
Shq1-201ENSMUST00000089245 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.4 ms