RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089245.6

Shq1-201, Transcript of Protein SHQ1 homolog, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Shq1, Length 1,638 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa42.27■■■■■ 4.36
Shq1-201ENSMUST00000089245 NischQ80TM9 1593 aa41.95■■■■■ 4.31
Shq1-201ENSMUST00000089245 Abcc9P70170 1546 aa40.56■■■■■ 4.08
Shq1-201ENSMUST00000089245 Abcc8B2RUS7 1588 aa40.43■■■■■ 4.06
Shq1-201ENSMUST00000089245 ScribQ80U72 1612 aa38.78■■■■□ 3.8
Shq1-201ENSMUST00000089245 NacadQ5SWP3 1504 aa37.67■■■■□ 3.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Kdm5dQ62240 1548 aa37.61■■■■□ 3.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dcaf1Q80TR8 1506 aa37.26■■■■□ 3.56
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sycp2Q9CUU3 1500 aa36.89■■■■□ 3.5
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rhox8Q6VSS7 320 aa36.75■■■■□ 3.47
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa36.59■■■■□ 3.45
Shq1-201ENSMUST00000089245 BicraF8VPZ9 1578 aa36.31■■■■□ 3.4
Shq1-201ENSMUST00000089245 Baz1aO88379 1555 aa36.08■■■■□ 3.37
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ccdc180J3QNE4 1664 aa36.07■■■■□ 3.36
Shq1-201ENSMUST00000089245 Crybg2B7ZCC2 1516 aa35.88■■■■□ 3.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
Shq1-201ENSMUST00000089245 Smarca2Q6DIC0 1577 aa35.02■■■■□ 3.2
Shq1-201ENSMUST00000089245 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa34.96■■■■□ 3.19
Shq1-201ENSMUST00000089245 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa34.83■■■■□ 3.17
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rtl1Q7M732 1744 aa34.83■■■■□ 3.17
Shq1-201ENSMUST00000089245 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
Shq1-201ENSMUST00000089245 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa34.62■■■■□ 3.13
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ercc6F8VPZ5 1481 aa34.6■■■■□ 3.13
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa34.35■■■■□ 3.09
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa34.33■■■■□ 3.09
Shq1-201ENSMUST00000089245 Wdr62Q3U3T8 1523 aa34.24■■■■□ 3.07
Shq1-201ENSMUST00000089245 Frmpd1A2AKB4 1549 aa34.22■■■■□ 3.07
Shq1-201ENSMUST00000089245 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
Shq1-201ENSMUST00000089245 Fam135aQ6NS59 1506 aa34.1■■■■□ 3.05
Shq1-201ENSMUST00000089245 CftrP26361 1476 aa34.09■■■■□ 3.05
Shq1-201ENSMUST00000089245 Synj1Q8CHC4 1574 aa34.06■■■■□ 3.04
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34.06■■■■□ 3.04
Shq1-201ENSMUST00000089245 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.04
Shq1-201ENSMUST00000089245 Trim41Q5NCC3 630 aa33.8■■■■□ 3
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ubl4bQ9CQ84 188 aa33.79■■■■□ 3
Shq1-201ENSMUST00000089245 Unc13aQ4KUS2 1712 aa33.76■■■■□ 3
Shq1-201ENSMUST00000089245 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
Shq1-201ENSMUST00000089245 Baz1bQ9Z277 1479 aa33.69■■■□□ 2.98
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mrc2Q64449 1479 aa33.37■■■□□ 2.93
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
Shq1-201ENSMUST00000089245 Kif15Q6P9L6 1387 aa33.18■■■□□ 2.9
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cux2P70298 1426 aa33.07■■■□□ 2.88
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cngb1E1AZ71 1325 aa33.05■■■□□ 2.88
Shq1-201ENSMUST00000089245 Golga3P55937 1487 aa33.03■■■□□ 2.88
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lamc3Q9R0B6 1581 aa33.02■■■□□ 2.88
Shq1-201ENSMUST00000089245 Top2bQ64511 1612 aa32.91■■■□□ 2.86
Shq1-201ENSMUST00000089245 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
Shq1-201ENSMUST00000089245 Kif21aQ9QXL2 1672 aa32.71■■■□□ 2.83
Shq1-201ENSMUST00000089245 TnnQ80Z71 1560 aa32.7■■■□□ 2.83
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cep164Q5DU05 1446 aa32.68■■■□□ 2.82
Shq1-201ENSMUST00000089245 Il27Q8K3I6 234 aa32.66■■■□□ 2.82
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ccdc18Q640L5 1455 aa32.62■■■□□ 2.81
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa32.62■■■□□ 2.81
Shq1-201ENSMUST00000089245 Fmn1Q05860 1466 aa32.59■■■□□ 2.81
Shq1-201ENSMUST00000089245 Camsap1A2AHC3 1581 aa32.48■■■□□ 2.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
Shq1-201ENSMUST00000089245 Crocc2F6XLV1 1638 aa32.22■■■□□ 2.75
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa32.22■■■□□ 2.75
Shq1-201ENSMUST00000089245 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
Shq1-201ENSMUST00000089245 Plb1Q3TTY0 1478 aa32.21■■■□□ 2.75
Shq1-201ENSMUST00000089245 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
Shq1-201ENSMUST00000089245 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
Shq1-201ENSMUST00000089245 Chic1Q8CBW7 227 aa32.09■■■□□ 2.73
Shq1-201ENSMUST00000089245 Grin2bQ01097 1482 aa32.07■■■□□ 2.72
Shq1-201ENSMUST00000089245 Duox2A2AQ99 1517 aa32.06■■■□□ 2.72
Shq1-201ENSMUST00000089245 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ift140E9PY46 1464 aa31.94■■■□□ 2.7
Shq1-201ENSMUST00000089245 Efcab5A0JP43 1406 aa31.88■■■□□ 2.69
Shq1-201ENSMUST00000089245 NrkQ9R0G8 1455 aa31.8■■■□□ 2.68
Shq1-201ENSMUST00000089245 Samd9lQ69Z37 1561 aa31.76■■■□□ 2.68
Shq1-201ENSMUST00000089245 Disp1Q3TDN0 1521 aa31.74■■■□□ 2.67
Shq1-201ENSMUST00000089245 HrcG5E8J6 738 aa31.74■■■□□ 2.67
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rusc2Q80U22 1514 aa31.72■■■□□ 2.67
Shq1-201ENSMUST00000089245 Shroom4Q1W617 1475 aa31.67■■■□□ 2.66
Shq1-201ENSMUST00000089245 PtprkP35822 1457 aa31.65■■■□□ 2.66
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rad54l2Q99NG0 1466 aa31.61■■■□□ 2.65
Shq1-201ENSMUST00000089245 Setd1bQ8CFT2 1985 aa31.6■■■□□ 2.65
Shq1-201ENSMUST00000089245 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zeb1Q64318 1117 aa31.55■■■□□ 2.64
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa31.55■■■□□ 2.64
Shq1-201ENSMUST00000089245 Shroom2A2ALU4 1481 aa31.54■■■□□ 2.64
Shq1-201ENSMUST00000089245 Npm2Q80W85 207 aa31.53■■■□□ 2.64
Shq1-201ENSMUST00000089245 Grin2aP35436 1464 aa31.48■■■□□ 2.63
Shq1-201ENSMUST00000089245 Magi3Q9EQJ9 1476 aa31.46■■■□□ 2.63
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gab3Q8BSM5 595 aa31.46■■■□□ 2.63
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 SynmQ70IV5 1561 aa31.42■■■□□ 2.62
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dnajc5P60904 198 aa31.36■■■□□ 2.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pla2r1Q62028 1487 aa31.31■■■□□ 2.6
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa31.27■■■□□ 2.6
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa31.21■■■□□ 2.59
Shq1-201ENSMUST00000089245 Fgd6Q69ZL1 1399 aa31.19■■■□□ 2.58
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gpatch8A2A6A1 1505 aa31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.8 ms