RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000068056.11

Ddx39b-201, Transcript of Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ddx39b, Length 1,739 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mcm10Q0VBD2 885 aa24.38■■□□□ 1.49
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 HypkQ9CR41 129 aa24.37■■□□□ 1.49
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ankrd13dQ6PD24 605 aa24.36■■□□□ 1.49
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa24.36■■□□□ 1.49
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sos2Q02384 1333 aa24.36■■□□□ 1.49
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Abca3Q8R420 1704 aa24.35■■□□□ 1.49
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 TnikP83510 1323 aa24.35■■□□□ 1.49
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tns2Q8CGB6 1400 aa24.35■■□□□ 1.49
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tsen2Q6P7W5 460 aa24.35■■□□□ 1.49
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc5a1Q8C3K6 665 aa24.34■■□□□ 1.49
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Klc3Q91W40 508 aa24.34■■□□□ 1.49
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 PappaQ8R4K8 1624 aa24.33■■□□□ 1.49
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Shank3Q4ACU6 1730 aa24.32■■□□□ 1.48
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Phkg2Q9DB30 406 aa24.32■■□□□ 1.48
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa24.3■■□□□ 1.48
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Asic4Q7TNS7 539 aa24.3■■□□□ 1.48
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa24.3■■□□□ 1.48
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Amotl1Q9D4H4 968 aa24.3■■□□□ 1.48
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pdzd9Q9D9M4 266 aa24.3■■□□□ 1.48
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 GsdmaQ9EST1 446 aa24.3■■□□□ 1.48
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Spef2Q8C9J3 1734 aa24.29■■□□□ 1.48
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Chmp7Q8R1T1 451 aa24.29■■□□□ 1.48
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Stk31Q99MW1 1018 aa24.27■■□□□ 1.48
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa24.25■■□□□ 1.47
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Crb1Q8VHS2 1405 aa24.24■■□□□ 1.47
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ssfa2Q922B9 1252 aa24.24■■□□□ 1.47
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Aox2Q5SGK3 1345 aa24.22■■□□□ 1.47
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 PsdQ5DTT2 1024 aa24.22■■□□□ 1.47
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa24.22■■□□□ 1.47
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Q7TT23 1179 aa24.21■■□□□ 1.47
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ints5Q8CHT3 1018 aa24.21■■□□□ 1.47
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kif23E9Q5G3 953 aa24.21■■□□□ 1.47
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Bicdl1A0JNT9 577 aa24.2■■□□□ 1.46
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fam198bQ3UPI1 517 aa24.19■■□□□ 1.46
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa24.18■■□□□ 1.46
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cabp2Q9JLK4 216 aa24.18■■□□□ 1.46
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa24.17■■□□□ 1.46
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Iqcf3Q9D498 203 aa24.16■■□□□ 1.46
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ccdc155Q80VJ8 648 aa24.15■■□□□ 1.46
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Snap23O09044 210 aa24.15■■□□□ 1.46
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Jmjd4Q8BFT6 427 aa24.13■■□□□ 1.45
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Atg3Q9CPX6 314 aa24.13■■□□□ 1.45
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Igsf1Q7TQA1 1317 aa24.13■■□□□ 1.45
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nkx2-3P97334 362 aa24.13■■□□□ 1.45
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fchsd2Q3USJ8 740 aa24.13■■□□□ 1.45
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa24.13■■□□□ 1.45
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gpr150Q8BL07 427 aa24.12■■□□□ 1.45
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Akt1s1Q9D1F4 257 aa24.12■■□□□ 1.45
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Trpm3Q5F4S9 1721 aa24.11■■□□□ 1.45
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 En2P09066 324 aa24.1■■□□□ 1.45
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cap2Q9CYT6 476 aa24.1■■□□□ 1.45
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa24.08■■□□□ 1.45
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dcaf5Q80T85 946 aa24.08■■□□□ 1.45
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Exoc6Q8R313 802 aa24.08■■□□□ 1.45
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa24.08■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 MeiocA2AG06 965 aa24.07■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Magea1O89006 320 aa24.07■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Magea5O89009 320 aa24.07■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Q4VA45 678 aa24.07■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Magea2Q9R2A2 320 aa24.07■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Apaf1O88879 1249 aa24.06■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Trpc5Q9QX29 975 aa24.06■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Smarcc1P97496 1104 aa24.05■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 AtrnQ9WU60 1428 aa24.05■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Jdp2P97875 163 aa24.04■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Chrna2Q91X60 512 aa24.04■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 IncenpQ9WU62 880 aa24.04■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm13023A2A8N2 498 aa24.02■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Miga2Q8BK03 593 aa24.02■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 AceP09470 1312 aa24.02■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Abcc12Q80WJ6 1366 aa24.02■■□□□ 1.44
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Efcab2Q9CQ46 164 aa24.01■■□□□ 1.43
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Atf7ipQ7TT18 1306 aa24.01■■□□□ 1.43
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Msl1Q6PDM1 616 aa24.01■■□□□ 1.43
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 NppbP40753 121 aa24■■□□□ 1.43
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Emilin1Q99K41 1017 aa23.99■■□□□ 1.43
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sos1Q62245 1319 aa23.99■■□□□ 1.43
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kcnq2Q9Z351 759 aa23.97■■□□□ 1.43
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa23.97■■□□□ 1.43
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ubxn2bQ0KL01 331 aa23.95■■□□□ 1.42
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Btbd11Q6GQW0 1109 aa23.95■■□□□ 1.42
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Golga2Q921M4 999 aa23.95■■□□□ 1.42
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Irx6Q9ER75 438 aa23.95■■□□□ 1.42
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sumf1Q8R0F3 372 aa23.94■■□□□ 1.42
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ric1Q69ZJ7 1422 aa23.92■■□□□ 1.42
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kcna3P16390 528 aa23.92■■□□□ 1.42
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pde4dQ01063 747 aa23.92■■□□□ 1.42
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zscan21Q07231 555 aa23.92■■□□□ 1.42
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 ErfeQ6PGN1 340 aa23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54.5 ms