RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047993.9

Hoxa13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Hoxa13, Length 1,309 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa34.26■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa34.23■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm7361D3Z6R1 267 aa34.23■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa34.23■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm1979E9QAN3 267 aa34.23■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm5862K7N5V5 267 aa34.23■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm10220K7N660 267 aa34.23■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 AtrnQ9WU60 1428 aa34.22■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa34.21■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Klc3Q91W40 508 aa34.21■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Shank3Q4ACU6 1730 aa34.2■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Zcwpw1Q6IR42 630 aa34.2■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Trpc5Q9QX29 975 aa34.2■■■■□ 3.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa34.19■■■■□ 3.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Nlrp6Q91WS2 869 aa34.19■■■■□ 3.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tns2Q8CGB6 1400 aa34.18■■■■□ 3.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa34.18■■■■□ 3.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mcm10Q0VBD2 885 aa34.17■■■■□ 3.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 PappaQ8R4K8 1624 aa34.16■■■■□ 3.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 PalmQ9Z0P4 383 aa34.16■■■■□ 3.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Zfp777B9EKF4 885 aa34.15■■■■□ 3.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Slc5a1Q8C3K6 665 aa34.15■■■■□ 3.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 HypkQ9CR41 129 aa34.14■■■■□ 3.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 TnikP83510 1323 aa34.14■■■■□ 3.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fam198bQ3UPI1 517 aa34.13■■■■□ 3.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Phkg2Q9DB30 406 aa34.13■■■■□ 3.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Akt1s1Q9D1F4 257 aa34.12■■■■□ 3.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Asic4Q7TNS7 539 aa34.11■■■■□ 3.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lrp5Q91VN0 1614 aa34.11■■■■□ 3.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fchsd2Q3USJ8 740 aa34.1■■■■□ 3.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ppef1O35655 650 aa34.09■■■■□ 3.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pdzd9Q9D9M4 266 aa34.09■■■■□ 3.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Wdr66E9Q743 1299 aa34.08■■■■□ 3.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Amotl1Q9D4H4 968 aa34.06■■■■□ 3.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tsen2Q6P7W5 460 aa34.05■■■■□ 3.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Chmp7Q8R1T1 451 aa34.05■■■■□ 3.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 IncenpQ9WU62 880 aa34.05■■■■□ 3.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Crb1Q8VHS2 1405 aa34.05■■■■□ 3.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Hirip3Q8BLH7 601 aa34.04■■■■□ 3.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Bicdl1A0JNT9 577 aa34.04■■■■□ 3.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Emilin1Q99K41 1017 aa34.04■■■■□ 3.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Egfem1Q8C088 590 aa34.02■■■■□ 3.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ints5Q8CHT3 1018 aa34.02■■■■□ 3.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ssfa2Q922B9 1252 aa34.02■■■■□ 3.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa34.02■■■■□ 3.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Aox2Q5SGK3 1345 aa33.99■■■■□ 3.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Yy1Q00899 414 aa33.99■■■■□ 3.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rapgefl1Q68EF8 662 aa33.99■■■■□ 3.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Stk31Q99MW1 1018 aa33.99■■■■□ 3.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Spef2Q8C9J3 1734 aa33.98■■■■□ 3.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ppm1fQ8CGA0 452 aa33.97■■■■□ 3.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 GsdmaQ9EST1 446 aa33.97■■■■□ 3.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Igsf1Q7TQA1 1317 aa33.95■■■■□ 3.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rad23bP54728 416 aa33.95■■■■□ 3.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa33.94■■■■□ 3.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Chrna2Q91X60 512 aa33.93■■■■□ 3.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Atg3Q9CPX6 314 aa33.91■■■■□ 3.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rnf180Q3U827 592 aa33.9■■■■□ 3.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ccdc155Q80VJ8 648 aa33.89■■■■□ 3.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 MeiocA2AG06 965 aa33.88■■■■□ 3.01
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Nkx2-3P97334 362 aa33.88■■■■□ 3.01
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cabp2Q9JLK4 216 aa33.88■■■■□ 3.01
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Snap23O09044 210 aa33.87■■■■□ 3.01
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Jmjd4Q8BFT6 427 aa33.87■■■■□ 3.01
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa33.86■■■■□ 3.01
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cap2Q9CYT6 476 aa33.84■■■■□ 3.01
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Jdp2P97875 163 aa33.83■■■■□ 3.01
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Msl1Q6PDM1 616 aa33.83■■■■□ 3.01
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Q7TT23 1179 aa33.83■■■■□ 3.01
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Dcaf5Q80T85 946 aa33.82■■■■□ 3.01
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 ErfeQ6PGN1 340 aa33.81■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Magea6O89010 325 aa33.8■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Smarcc1P97496 1104 aa33.8■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Magea3Q6T340 320 aa33.8■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa33.8■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Iqcf3Q9D498 203 aa33.79■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sgip1Q8VD37 806 aa33.79■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Usp21Q9QZL6 566 aa33.79■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Igf2rQ07113 2483 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Trpm3Q5F4S9 1721 aa33.78■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm13023A2A8N2 498 aa33.78■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa33.78■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa33.77■■■■□ 3
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Miga2Q8BK03 593 aa33.76■■■□□ 2.99
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 NppbP40753 121 aa33.75■■■□□ 2.99
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 AceP09470 1312 aa33.7■■■□□ 2.99
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sos1Q62245 1319 aa33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.8 ms