RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccne1Q61457 408 aa26.75■■□□□ 1.87
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hoxd11P23813 323 aa26.74■■□□□ 1.87
Ltb-201ENSMUST00000025262 Socs7Q8VHQ2 579 aa26.74■■□□□ 1.87
Ltb-201ENSMUST00000025262 Adgre1Q61549 931 aa26.73■■□□□ 1.87
Ltb-201ENSMUST00000025262 Birc3O08863 600 aa26.72■■□□□ 1.87
Ltb-201ENSMUST00000025262 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
Ltb-201ENSMUST00000025262 ApobrQ8VBT6 942 aa26.69■■□□□ 1.86
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa26.69■■□□□ 1.86
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sned1Q70E20 1403 aa26.68■■□□□ 1.86
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bicdl1A0JNT9 577 aa26.65■■□□□ 1.86
Ltb-201ENSMUST00000025262 Aplp2Q06335 707 aa26.65■■□□□ 1.86
Ltb-201ENSMUST00000025262 Simc1E9Q6E9 1354 aa26.65■■□□□ 1.86
Ltb-201ENSMUST00000025262 NppbP40753 121 aa26.64■■□□□ 1.86
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa26.63■■□□□ 1.85
Ltb-201ENSMUST00000025262 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa26.63■■□□□ 1.85
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sumf1Q8R0F3 372 aa26.63■■□□□ 1.85
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
Ltb-201ENSMUST00000025262 ThemisQ8BGW0 636 aa26.61■■□□□ 1.85
Ltb-201ENSMUST00000025262 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
Ltb-201ENSMUST00000025262 Camkk2Q8C078 588 aa26.6■■□□□ 1.85
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa26.58■■□□□ 1.85
Ltb-201ENSMUST00000025262 Spon1Q8VCC9 807 aa26.57■■□□□ 1.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Casz1Q9CWL2 1761 aa26.56■■□□□ 1.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp2c69E9PXC3 491 aa26.54■■□□□ 1.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp2c40P56657 491 aa26.54■■□□□ 1.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kdm6aO70546 1401 aa26.52■■□□□ 1.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 PappaQ8R4K8 1624 aa26.52■■□□□ 1.84
Ltb-201ENSMUST00000025262 Spata31d1bE9QA57 1361 aa26.51■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm13023A2A8N2 498 aa26.51■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hoxb7P09024 217 aa26.51■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rad17Q6NXW6 688 aa26.51■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc4a1apE9PX68 744 aa26.5■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Taf1dQ9D4V4 322 aa26.49■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmf1B9EKI3 1091 aa26.48■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Crb1Q8VHS2 1405 aa26.47■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa26.46■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm7361D3Z6R1 267 aa26.46■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa26.46■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm1979E9QAN3 267 aa26.46■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm5862K7N5V5 267 aa26.46■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm10220K7N660 267 aa26.46■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tgfb2P27090 414 aa26.46■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 FktnQ8R507 461 aa26.46■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa26.46■■□□□ 1.83
Ltb-201ENSMUST00000025262 Plch1Q4KWH5 1682 aa26.45■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 CpzQ8R4V4 654 aa26.45■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 SnrkQ8VDU5 748 aa26.45■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eya1P97767 591 aa26.44■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp2c67Q569X9 491 aa26.44■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa26.44■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tns2Q8CGB6 1400 aa26.43■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 ArsiQ32KI9 573 aa26.42■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Smarcc1P97496 1104 aa26.41■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Akap2O54931 893 aa26.4■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc5a1Q8C3K6 665 aa26.4■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Parp14Q2EMV9 1817 aa26.39■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ints5Q8CHT3 1018 aa26.39■■□□□ 1.82
Ltb-201ENSMUST00000025262 Megf6Q80V70 1572 aa26.38■■□□□ 1.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col11a2Q64739 1736 aa26.38■■□□□ 1.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ubr3Q5U430 1889 aa26.38■■□□□ 1.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atg3Q9CPX6 314 aa26.37■■□□□ 1.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Asic4Q7TNS7 539 aa26.35■■□□□ 1.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc24a1Q91WD8 1130 aa26.35■■□□□ 1.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tlr8P58682 1032 aa26.34■■□□□ 1.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp2c68K7N6C2 491 aa26.33■■□□□ 1.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eif4a2P10630 407 aa26.33■■□□□ 1.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 1810065E05RikQ5NC41 235 aa26.33■■□□□ 1.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Miga2Q8BK03 593 aa26.33■■□□□ 1.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trpm3Q5F4S9 1721 aa26.31■■□□□ 1.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 TrhQ62361 256 aa26.3■■□□□ 1.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 VwdeQ6DFV8 926 aa26.3■■□□□ 1.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Podxl2Q8CAE9 603 aa26.3■■□□□ 1.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Phkg2Q9DB30 406 aa26.29■■□□□ 1.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 NogP97466 232 aa26.28■■□□□ 1.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Jmjd4Q8BFT6 427 aa26.28■■□□□ 1.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa26.27■■□□□ 1.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dcaf5Q80T85 946 aa26.27■■□□□ 1.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sos1Q62245 1319 aa26.26■■□□□ 1.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 UtrnE9Q6R7 3430 aa26.25■■□□□ 1.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 B4galnt4Q766D5 1034 aa26.25■■□□□ 1.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cap2Q9CYT6 476 aa26.25■■□□□ 1.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ssfa2Q922B9 1252 aa26.24■■□□□ 1.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pdzd9Q9D9M4 266 aa26.24■■□□□ 1.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa26.23■■□□□ 1.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cfap70D3YVL2 1141 aa26.22■■□□□ 1.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 MpripP97434 1024 aa26.21■■□□□ 1.79
Ltb-201ENSMUST00000025262 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dcaf11Q91VU6 549 aa26.2■■□□□ 1.78
Ltb-201ENSMUST00000025262 Itgb4A2A863 1818 aa26.2■■□□□ 1.78
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa26.19■■□□□ 1.78
Ltb-201ENSMUST00000025262 Klrk1O54709 232 aa26.18■■□□□ 1.78
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