RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018755.9

Pdlim4-201, Transcript of PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdlim4, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm7361D3Z6R1 267 aa30.13■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa30.13■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm1979E9QAN3 267 aa30.13■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm5862K7N5V5 267 aa30.13■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm10220K7N660 267 aa30.13■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 PsdQ5DTT2 1024 aa30.13■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 HypkQ9CR41 129 aa30.13■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 PappaQ8R4K8 1624 aa30.13■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Slc5a1Q8C3K6 665 aa30.12■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Magea1O89006 320 aa30.1■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Magea5O89009 320 aa30.1■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Phkg2Q9DB30 406 aa30.1■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Magea2Q9R2A2 320 aa30.1■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fam198bQ3UPI1 517 aa30.09■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa30.08■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ssfa2Q922B9 1252 aa30.08■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Amotl1Q9D4H4 968 aa30.08■■■□□ 2.41
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Shank3Q4ACU6 1730 aa30.06■■■□□ 2.4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Trpc5Q9QX29 975 aa30.06■■■□□ 2.4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 P2rx7Q9Z1M0 595 aa30.06■■■□□ 2.4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa30.05■■■□□ 2.4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Asic4Q7TNS7 539 aa30.05■■■□□ 2.4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Plin1Q8CGN5 517 aa30.04■■■□□ 2.4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Chmp7Q8R1T1 451 aa30.04■■■□□ 2.4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pdzd9Q9D9M4 266 aa30.04■■■□□ 2.4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Crb1Q8VHS2 1405 aa30.04■■■□□ 2.4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa30.03■■■□□ 2.4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Igsf1Q7TQA1 1317 aa30.01■■■□□ 2.4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 PalmQ9Z0P4 383 aa30.01■■■□□ 2.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 TnikP83510 1323 aa30■■■□□ 2.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nlrp6Q91WS2 869 aa30■■■□□ 2.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 AtrnQ9WU60 1428 aa29.98■■■□□ 2.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kcnq2Q9Z351 759 aa29.97■■■□□ 2.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ints5Q8CHT3 1018 aa29.96■■■□□ 2.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Aox2Q5SGK3 1345 aa29.96■■■□□ 2.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 MeiocA2AG06 965 aa29.95■■■□□ 2.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tsen2Q6P7W5 460 aa29.95■■■□□ 2.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 IncenpQ9WU62 880 aa29.95■■■□□ 2.39
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Bicdl1A0JNT9 577 aa29.94■■■□□ 2.38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mcm10Q0VBD2 885 aa29.94■■■□□ 2.38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Jmjd4Q8BFT6 427 aa29.94■■■□□ 2.38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 NppbP40753 121 aa29.93■■■□□ 2.38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Stk31Q99MW1 1018 aa29.92■■■□□ 2.38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Jdp2P97875 163 aa29.91■■■□□ 2.38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Atg3Q9CPX6 314 aa29.9■■■□□ 2.38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Spef2Q8C9J3 1734 aa29.9■■■□□ 2.38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 ErfeQ6PGN1 340 aa29.89■■■□□ 2.38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 GsdmaQ9EST1 446 aa29.89■■■□□ 2.38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fchsd2Q3USJ8 740 aa29.88■■■□□ 2.37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Iqcf3Q9D498 203 aa29.86■■■□□ 2.37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ubxn2bQ0KL01 331 aa29.85■■■□□ 2.37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa29.85■■■□□ 2.37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dcaf5Q80T85 946 aa29.84■■■□□ 2.37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kcna3P16390 528 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Emilin1Q99K41 1017 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Smarcc1P97496 1104 aa29.81■■■□□ 2.36
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm13023A2A8N2 498 aa29.79■■■□□ 2.36
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa29.79■■■□□ 2.36
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cap2Q9CYT6 476 aa29.78■■■□□ 2.36
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ric1Q69ZJ7 1422 aa29.77■■■□□ 2.36
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Spata31d1bE9QA57 1361 aa29.77■■■□□ 2.36
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Trpm3Q5F4S9 1721 aa29.75■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccdc155Q80VJ8 648 aa29.75■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Chrna2Q91X60 512 aa29.75■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Egfem1Q8C088 590 aa29.74■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sos1Q62245 1319 aa29.73■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa29.73■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nkx2-3P97334 362 aa29.73■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Miga2Q8BK03 593 aa29.73■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cabp2Q9JLK4 216 aa29.73■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Abcc12Q80WJ6 1366 aa29.73■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Msl1Q6PDM1 616 aa29.71■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Col23a1Q8K4G2 532 aa29.71■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sumf1Q8R0F3 372 aa29.71■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 AceP09470 1312 aa29.71■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pde4dQ01063 747 aa29.7■■■□□ 2.35
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa29.68■■■□□ 2.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Snap23O09044 210 aa29.68■■■□□ 2.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Hirip3Q8BLH7 601 aa29.68■■■□□ 2.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Wdr66E9Q743 1299 aa29.66■■■□□ 2.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Efcab2Q9CQ46 164 aa29.66■■■□□ 2.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zfyve9A2A8R0 1397 aa29.65■■■□□ 2.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Prom2Q3UUY6 835 aa29.65■■■□□ 2.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Q4VA45 678 aa29.65■■■□□ 2.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Adcy9P51830 1353 aa29.64■■■□□ 2.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sned1Q70E20 1403 aa29.64■■■□□ 2.34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ppm1fQ8CGA0 452 aa29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 59.6 ms