RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000052708.6

Ckap2l-201, Transcript of Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ckap2l, Length 3,137 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Galntl6E5D8G1 601 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 PtgdsO09114 189 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 P01636 108 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 LynP25911 512 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Hnf1bP27889 558 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Klf1P46099 358 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pdcd2P46718 343 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tnfrsf4P47741 272 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Defa-rs12P50716 91 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ctps1P70698 591 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Sox9Q04887 507 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Prss57Q14B24 284 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gata6Q61169 589 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Il10raQ61727 575 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Atg16l2Q6KAU8 623 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Sort1Q6PHU5 825 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ssxb5Q6XAS2 159 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Olfr299Q7TS05 330 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Hsfy2Q80Y37 392 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Stk32aQ8BGW6 398 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Abi3Q8BYZ1 367 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Vmn1r206Q8R277 312 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Slc30a5Q8R4H9 761 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Mccc1Q99MR8 717 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tcam1Q99NB3 548 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 AenQ9CZI9 336 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Vsig1Q9D2J4 407 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 SrpraQ9DBG7 636 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Atp5hQ9DCX2 161 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Piezo2Q8CD54 2822 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Mgat4eA6H684 439 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Fam46dB1ATX6 390 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ankrd34aB2RW11 495 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Akap5D3YVF0 745 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gm8444F6XS56 118 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 DldO08749 509 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cyp8b1O88962 500 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Npr1P18293 1057 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 FasP25446 327 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Myl2P51667 166 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pex2P55098 305 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ldb1P70662 411 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cyb5r2Q3KNK3 276 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Zmym5Q3U2E2 627 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cog7Q3UM29 770 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gm8773Q3UQ24 132 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pabpc2Q62029 628 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 GkQ64516 559 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Arhgap20Q6IFT4 1182 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Prr18Q6PAN7 307 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Dclk2Q6PGN3 756 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Adamtsl4Q80T21 1036 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Atp2c1Q80XR2 918 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Rspo2Q8BFU0 243 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Zfp398Q8BV16 643 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tmem72Q8C3K5 275 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Vps37bQ8R0J7 285 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Dync1li1Q8R1Q8 523 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Foxe1Q8R2I0 371 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ankrd49Q8VE42 238 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Olfr1325Q8VF43 315 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pdzd3Q99MJ6 498 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 ClpsQ9CQC2 113 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pus10Q9D3U0 527 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Hao2Q9NYQ2 353 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Grm3Q9QYS2 879 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cyp2g1Q9WV19 494 aa8.99□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ddx43D3Z6P9 646 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Vmn2r104E9Q2J5 860 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Glyatl3E9Q5L8 290 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Klc2O88448 599 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Hsd17b4P51660 735 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 PtpaP58389 323 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Usp30Q3UN04 517 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 StyxQ60969 223 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tas2r109Q7M707 316 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Mfn1Q811U4 741 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Dyrk4Q8BI55 632 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tgm6Q8BM11 706 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Sfr1Q8BP27 319 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Clic5Q8BXK9 251 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 TwnkQ8CIW5 685 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cyp2c70Q91W64 489 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 HnrnpllQ921F4 591 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tceal1Q921P9 165 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Atad3Q925I1 591 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Dhrs7bQ99J47 323 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cdc26Q99JP4 85 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 StambpQ9CQ26 424 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Med21Q9CQ39 144 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pebp4Q9D9G2 242 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Rps6kb2Q9Z1M4 485 aa8.98□□□□□ -0.97
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Art2bO35975 289 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.1 ms