Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2E2

Zmym5, Zinc finger MYM-type protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmym5Q3U2E2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
Zmym5Q3U2E2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Zmym5Q3U2E2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Zmym5Q3U2E2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Zmym5Q3U2E2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Zmym5Q3U2E2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Zmym5Q3U2E2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Zmym5Q3U2E2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Zmym5Q3U2E2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Zmym5Q3U2E2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Zmym5Q3U2E2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Zmym5Q3U2E2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Zmym5Q3U2E2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Zmym5Q3U2E2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Zmym5Q3U2E2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Zmym5Q3U2E2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Zmym5Q3U2E2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Zmym5Q3U2E2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Zmym5Q3U2E2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Zmym5Q3U2E2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Zmym5Q3U2E2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Zmym5Q3U2E2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Zmym5Q3U2E2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Zmym5Q3U2E2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Zmym5Q3U2E2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Zmym5Q3U2E2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Zmym5Q3U2E2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Zmym5Q3U2E2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Zmym5Q3U2E2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Zmym5Q3U2E2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Zmym5Q3U2E2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Zmym5Q3U2E2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Zmym5Q3U2E2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Zmym5Q3U2E2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Zmym5Q3U2E2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Zmym5Q3U2E2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Zmym5Q3U2E2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Zmym5Q3U2E2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Zmym5Q3U2E2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Zmym5Q3U2E2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Zmym5Q3U2E2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Zmym5Q3U2E2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Zmym5Q3U2E2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Zmym5Q3U2E2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Zmym5Q3U2E2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Zmym5Q3U2E2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Zmym5Q3U2E2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Zmym5Q3U2E2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Zmym5Q3U2E2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Zmym5Q3U2E2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Zmym5Q3U2E2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Zmym5Q3U2E2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Zmym5Q3U2E2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zmym5Q3U2E2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Zmym5Q3U2E2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zmym5Q3U2E2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zmym5Q3U2E2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zmym5Q3U2E2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zmym5Q3U2E2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zmym5Q3U2E2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zmym5Q3U2E2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Zmym5Q3U2E2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zmym5Q3U2E2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zmym5Q3U2E2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zmym5Q3U2E2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zmym5Q3U2E2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Zmym5Q3U2E2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Zmym5Q3U2E2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Zmym5Q3U2E2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zmym5Q3U2E2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zmym5Q3U2E2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zmym5Q3U2E2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zmym5Q3U2E2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zmym5Q3U2E2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zmym5Q3U2E2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zmym5Q3U2E2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zmym5Q3U2E2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zmym5Q3U2E2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zmym5Q3U2E2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Zmym5Q3U2E2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zmym5Q3U2E2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Zmym5Q3U2E2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zmym5Q3U2E2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zmym5Q3U2E2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zmym5Q3U2E2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Zmym5Q3U2E2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Zmym5Q3U2E2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zmym5Q3U2E2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zmym5Q3U2E2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zmym5Q3U2E2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zmym5Q3U2E2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zmym5Q3U2E2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zmym5Q3U2E2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zmym5Q3U2E2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zmym5Q3U2E2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zmym5Q3U2E2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zmym5Q3U2E2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zmym5Q3U2E2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zmym5Q3U2E2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Zmym5Q3U2E2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 250.9 ms