Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Tcam1Q99NB3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Tcam1Q99NB3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Tcam1Q99NB3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tcam1Q99NB3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tcam1Q99NB3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Tcam1Q99NB3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Tcam1Q99NB3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Tcam1Q99NB3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Tcam1Q99NB3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tcam1Q99NB3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Tcam1Q99NB3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tcam1Q99NB3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Tcam1Q99NB3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tcam1Q99NB3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tcam1Q99NB3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tcam1Q99NB3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tcam1Q99NB3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tcam1Q99NB3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tcam1Q99NB3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Tcam1Q99NB3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tcam1Q99NB3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tcam1Q99NB3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tcam1Q99NB3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tcam1Q99NB3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tcam1Q99NB3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tcam1Q99NB3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tcam1Q99NB3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Tcam1Q99NB3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tcam1Q99NB3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tcam1Q99NB3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tcam1Q99NB3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tcam1Q99NB3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tcam1Q99NB3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tcam1Q99NB3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tcam1Q99NB3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tcam1Q99NB3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Tcam1Q99NB3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tcam1Q99NB3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tcam1Q99NB3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tcam1Q99NB3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tcam1Q99NB3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tcam1Q99NB3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tcam1Q99NB3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tcam1Q99NB3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tcam1Q99NB3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tcam1Q99NB3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tcam1Q99NB3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tcam1Q99NB3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tcam1Q99NB3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tcam1Q99NB3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tcam1Q99NB3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tcam1Q99NB3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Tcam1Q99NB3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tcam1Q99NB3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tcam1Q99NB3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Tcam1Q99NB3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tcam1Q99NB3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tcam1Q99NB3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tcam1Q99NB3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tcam1Q99NB3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tcam1Q99NB3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tcam1Q99NB3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tcam1Q99NB3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tcam1Q99NB3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tcam1Q99NB3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tcam1Q99NB3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tcam1Q99NB3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tcam1Q99NB3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tcam1Q99NB3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcam1Q99NB3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcam1Q99NB3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcam1Q99NB3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcam1Q99NB3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tcam1Q99NB3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tcam1Q99NB3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tcam1Q99NB3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tcam1Q99NB3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tcam1Q99NB3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tcam1Q99NB3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tcam1Q99NB3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tcam1Q99NB3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tcam1Q99NB3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tcam1Q99NB3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tcam1Q99NB3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tcam1Q99NB3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tcam1Q99NB3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcam1Q99NB3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcam1Q99NB3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcam1Q99NB3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tcam1Q99NB3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tcam1Q99NB3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tcam1Q99NB3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tcam1Q99NB3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tcam1Q99NB3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tcam1Q99NB3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcam1Q99NB3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcam1Q99NB3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tcam1Q99NB3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tcam1Q99NB3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms