Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gata6Q61169 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Gata6Q61169 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gata6Q61169 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Gata6Q61169 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Gata6Q61169 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gata6Q61169 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Gata6Q61169 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gata6Q61169 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Gata6Q61169 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gata6Q61169 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gata6Q61169 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gata6Q61169 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gata6Q61169 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gata6Q61169 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gata6Q61169 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gata6Q61169 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gata6Q61169 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gata6Q61169 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Gata6Q61169 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gata6Q61169 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gata6Q61169 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gata6Q61169 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gata6Q61169 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gata6Q61169 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gata6Q61169 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gata6Q61169 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Gata6Q61169 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gata6Q61169 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gata6Q61169 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gata6Q61169 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gata6Q61169 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gata6Q61169 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Gata6Q61169 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gata6Q61169 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Gata6Q61169 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gata6Q61169 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gata6Q61169 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gata6Q61169 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gata6Q61169 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Gata6Q61169 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gata6Q61169 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gata6Q61169 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gata6Q61169 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gata6Q61169 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gata6Q61169 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gata6Q61169 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gata6Q61169 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gata6Q61169 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gata6Q61169 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gata6Q61169 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gata6Q61169 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gata6Q61169 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gata6Q61169 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gata6Q61169 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gata6Q61169 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gata6Q61169 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gata6Q61169 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gata6Q61169 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gata6Q61169 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gata6Q61169 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gata6Q61169 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gata6Q61169 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gata6Q61169 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gata6Q61169 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gata6Q61169 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gata6Q61169 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gata6Q61169 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gata6Q61169 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Gata6Q61169 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gata6Q61169 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gata6Q61169 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gata6Q61169 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gata6Q61169 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gata6Q61169 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gata6Q61169 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gata6Q61169 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gata6Q61169 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gata6Q61169 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gata6Q61169 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gata6Q61169 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gata6Q61169 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gata6Q61169 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gata6Q61169 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gata6Q61169 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gata6Q61169 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gata6Q61169 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gata6Q61169 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gata6Q61169 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gata6Q61169 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gata6Q61169 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gata6Q61169 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gata6Q61169 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gata6Q61169 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gata6Q61169 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gata6Q61169 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gata6Q61169 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gata6Q61169 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gata6Q61169 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gata6Q61169 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms