Protein–RNA interactions for Protein: B1ATX6

Fam46d, Family with sequence similarity 46, member D, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46dB1ATX6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Fam46dB1ATX6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fam46dB1ATX6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Fam46dB1ATX6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fam46dB1ATX6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Fam46dB1ATX6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fam46dB1ATX6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fam46dB1ATX6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Fam46dB1ATX6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Fam46dB1ATX6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fam46dB1ATX6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Fam46dB1ATX6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Fam46dB1ATX6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Fam46dB1ATX6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Fam46dB1ATX6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Fam46dB1ATX6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Fam46dB1ATX6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Fam46dB1ATX6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fam46dB1ATX6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fam46dB1ATX6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fam46dB1ATX6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fam46dB1ATX6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fam46dB1ATX6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fam46dB1ATX6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fam46dB1ATX6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fam46dB1ATX6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fam46dB1ATX6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Fam46dB1ATX6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fam46dB1ATX6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Fam46dB1ATX6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fam46dB1ATX6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Fam46dB1ATX6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Fam46dB1ATX6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fam46dB1ATX6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fam46dB1ATX6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fam46dB1ATX6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fam46dB1ATX6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fam46dB1ATX6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fam46dB1ATX6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fam46dB1ATX6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Fam46dB1ATX6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fam46dB1ATX6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fam46dB1ATX6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fam46dB1ATX6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fam46dB1ATX6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fam46dB1ATX6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fam46dB1ATX6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fam46dB1ATX6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fam46dB1ATX6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fam46dB1ATX6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fam46dB1ATX6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fam46dB1ATX6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Fam46dB1ATX6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fam46dB1ATX6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fam46dB1ATX6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fam46dB1ATX6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fam46dB1ATX6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fam46dB1ATX6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fam46dB1ATX6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Fam46dB1ATX6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fam46dB1ATX6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fam46dB1ATX6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fam46dB1ATX6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fam46dB1ATX6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fam46dB1ATX6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fam46dB1ATX6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fam46dB1ATX6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fam46dB1ATX6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fam46dB1ATX6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fam46dB1ATX6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fam46dB1ATX6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fam46dB1ATX6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fam46dB1ATX6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fam46dB1ATX6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Fam46dB1ATX6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fam46dB1ATX6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fam46dB1ATX6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Fam46dB1ATX6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Fam46dB1ATX6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fam46dB1ATX6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fam46dB1ATX6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fam46dB1ATX6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fam46dB1ATX6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fam46dB1ATX6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam46dB1ATX6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fam46dB1ATX6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam46dB1ATX6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam46dB1ATX6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam46dB1ATX6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam46dB1ATX6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam46dB1ATX6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam46dB1ATX6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fam46dB1ATX6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fam46dB1ATX6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fam46dB1ATX6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam46dB1ATX6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam46dB1ATX6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam46dB1ATX6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam46dB1ATX6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam46dB1ATX6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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