Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS2

Ssxb5, MCG68109, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb5Q6XAS2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Ssxb5Q6XAS2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,92■■■■□ 3,02
Ssxb5Q6XAS2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Ssxb5Q6XAS2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Ssxb5Q6XAS2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,54■■■□□ 2,8
Ssxb5Q6XAS2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Ssxb5Q6XAS2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Ssxb5Q6XAS2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Ssxb5Q6XAS2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Ssxb5Q6XAS2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Ssxb5Q6XAS2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Ssxb5Q6XAS2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Ssxb5Q6XAS2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Ssxb5Q6XAS2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Ssxb5Q6XAS2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,67■■■□□ 2,5
Ssxb5Q6XAS2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,62■■■□□ 2,49
Ssxb5Q6XAS2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Ssxb5Q6XAS2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Ssxb5Q6XAS2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Ssxb5Q6XAS2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Ssxb5Q6XAS2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Ssxb5Q6XAS2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ssxb5Q6XAS2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ssxb5Q6XAS2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,13■■■□□ 2,41
Ssxb5Q6XAS2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ssxb5Q6XAS2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ssxb5Q6XAS2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ssxb5Q6XAS2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ssxb5Q6XAS2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Ssxb5Q6XAS2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
Ssxb5Q6XAS2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Ssxb5Q6XAS2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ssxb5Q6XAS2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Ssxb5Q6XAS2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ssxb5Q6XAS2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Ssxb5Q6XAS2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ssxb5Q6XAS2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ssxb5Q6XAS2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Ssxb5Q6XAS2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Ssxb5Q6XAS2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ssxb5Q6XAS2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ssxb5Q6XAS2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ssxb5Q6XAS2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Ssxb5Q6XAS2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Ssxb5Q6XAS2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Ssxb5Q6XAS2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Ssxb5Q6XAS2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ssxb5Q6XAS2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ssxb5Q6XAS2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Ssxb5Q6XAS2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Ssxb5Q6XAS2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ssxb5Q6XAS2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Ssxb5Q6XAS2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Ssxb5Q6XAS2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Ssxb5Q6XAS2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ssxb5Q6XAS2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ssxb5Q6XAS2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ssxb5Q6XAS2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ssxb5Q6XAS2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Ssxb5Q6XAS2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ssxb5Q6XAS2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Ssxb5Q6XAS2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Ssxb5Q6XAS2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Ssxb5Q6XAS2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Ssxb5Q6XAS2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ssxb5Q6XAS2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ssxb5Q6XAS2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ssxb5Q6XAS2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ssxb5Q6XAS2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Ssxb5Q6XAS2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ssxb5Q6XAS2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,16■■■□□ 2,1
Ssxb5Q6XAS2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ssxb5Q6XAS2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Ssxb5Q6XAS2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ssxb5Q6XAS2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ssxb5Q6XAS2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ssxb5Q6XAS2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Ssxb5Q6XAS2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ssxb5Q6XAS2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ssxb5Q6XAS2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Ssxb5Q6XAS2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,89■■■□□ 2,05
Ssxb5Q6XAS2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ssxb5Q6XAS2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ssxb5Q6XAS2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ssxb5Q6XAS2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ssxb5Q6XAS2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ssxb5Q6XAS2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ssxb5Q6XAS2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ssxb5Q6XAS2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ssxb5Q6XAS2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Ssxb5Q6XAS2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ssxb5Q6XAS2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ssxb5Q6XAS2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ssxb5Q6XAS2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ssxb5Q6XAS2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ssxb5Q6XAS2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Ssxb5Q6XAS2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ssxb5Q6XAS2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ssxb5Q6XAS2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ssxb5Q6XAS2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
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