Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Atg16l2Q6KAU8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Atg16l2Q6KAU8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Atg16l2Q6KAU8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Atg16l2Q6KAU8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Atg16l2Q6KAU8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Atg16l2Q6KAU8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Atg16l2Q6KAU8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Atg16l2Q6KAU8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Atg16l2Q6KAU8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Atg16l2Q6KAU8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Atg16l2Q6KAU8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Atg16l2Q6KAU8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Atg16l2Q6KAU8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Atg16l2Q6KAU8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Atg16l2Q6KAU8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Atg16l2Q6KAU8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Atg16l2Q6KAU8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atg16l2Q6KAU8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
Atg16l2Q6KAU8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Atg16l2Q6KAU8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atg16l2Q6KAU8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Atg16l2Q6KAU8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Atg16l2Q6KAU8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atg16l2Q6KAU8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Atg16l2Q6KAU8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Atg16l2Q6KAU8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Atg16l2Q6KAU8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atg16l2Q6KAU8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atg16l2Q6KAU8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atg16l2Q6KAU8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Atg16l2Q6KAU8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atg16l2Q6KAU8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Atg16l2Q6KAU8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Atg16l2Q6KAU8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atg16l2Q6KAU8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Atg16l2Q6KAU8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Atg16l2Q6KAU8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atg16l2Q6KAU8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atg16l2Q6KAU8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atg16l2Q6KAU8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atg16l2Q6KAU8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atg16l2Q6KAU8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atg16l2Q6KAU8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atg16l2Q6KAU8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Atg16l2Q6KAU8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atg16l2Q6KAU8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atg16l2Q6KAU8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atg16l2Q6KAU8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atg16l2Q6KAU8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atg16l2Q6KAU8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atg16l2Q6KAU8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atg16l2Q6KAU8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atg16l2Q6KAU8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atg16l2Q6KAU8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atg16l2Q6KAU8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atg16l2Q6KAU8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atg16l2Q6KAU8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Atg16l2Q6KAU8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg16l2Q6KAU8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg16l2Q6KAU8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Atg16l2Q6KAU8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atg16l2Q6KAU8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atg16l2Q6KAU8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atg16l2Q6KAU8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atg16l2Q6KAU8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atg16l2Q6KAU8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atg16l2Q6KAU8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atg16l2Q6KAU8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg16l2Q6KAU8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg16l2Q6KAU8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atg16l2Q6KAU8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atg16l2Q6KAU8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg16l2Q6KAU8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atg16l2Q6KAU8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg16l2Q6KAU8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atg16l2Q6KAU8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atg16l2Q6KAU8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Atg16l2Q6KAU8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atg16l2Q6KAU8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atg16l2Q6KAU8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atg16l2Q6KAU8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Atg16l2Q6KAU8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atg16l2Q6KAU8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atg16l2Q6KAU8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atg16l2Q6KAU8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atg16l2Q6KAU8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atg16l2Q6KAU8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atg16l2Q6KAU8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atg16l2Q6KAU8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atg16l2Q6KAU8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Atg16l2Q6KAU8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atg16l2Q6KAU8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms