Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,07■■■■■ 4,33
Sox9Q04887 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Sox9Q04887 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,63■■■■□ 3,77
Sox9Q04887 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,83■■■■□ 3,49
Sox9Q04887 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,11■■■■□ 3,37
Sox9Q04887 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Sox9Q04887 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Sox9Q04887 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Sox9Q04887 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,15■■■■□ 3,22
Sox9Q04887 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Sox9Q04887 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,08■■■■□ 3,21
Sox9Q04887 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,58■■■■□ 3,13
Sox9Q04887 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Sox9Q04887 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Sox9Q04887 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Sox9Q04887 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Sox9Q04887 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Sox9Q04887 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Sox9Q04887 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Sox9Q04887 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Sox9Q04887 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Sox9Q04887 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,41■■■□□ 2,94
Sox9Q04887 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Sox9Q04887 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,76■■■□□ 2,83
Sox9Q04887 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Sox9Q04887 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Sox9Q04887 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Sox9Q04887 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
Sox9Q04887 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Sox9Q04887 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,28■■■□□ 2,76
Sox9Q04887 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,16■■■□□ 2,74
Sox9Q04887 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Sox9Q04887 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Sox9Q04887 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Sox9Q04887 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,98■■■□□ 2,71
Sox9Q04887 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,96■■■□□ 2,71
Sox9Q04887 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Sox9Q04887 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31,89■■■□□ 2,7
Sox9Q04887 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,87■■■□□ 2,69
Sox9Q04887 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Sox9Q04887 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,76■■■□□ 2,67
Sox9Q04887 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Sox9Q04887 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Sox9Q04887 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Sox9Q04887 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Sox9Q04887 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Sox9Q04887 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Sox9Q04887 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Sox9Q04887 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,5■■■□□ 2,63
Sox9Q04887 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Sox9Q04887 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,42■■■□□ 2,62
Sox9Q04887 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,41■■■□□ 2,62
Sox9Q04887 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,32■■■□□ 2,6
Sox9Q04887 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Sox9Q04887 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Sox9Q04887 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Sox9Q04887 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Sox9Q04887 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Sox9Q04887 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Sox9Q04887 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Sox9Q04887 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Sox9Q04887 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Sox9Q04887 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Sox9Q04887 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Sox9Q04887 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Sox9Q04887 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Sox9Q04887 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Sox9Q04887 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Sox9Q04887 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Sox9Q04887 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,49■■■□□ 2,47
Sox9Q04887 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Sox9Q04887 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Sox9Q04887 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,44■■■□□ 2,46
Sox9Q04887 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Sox9Q04887 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Sox9Q04887 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Sox9Q04887 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
Sox9Q04887 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Sox9Q04887 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Sox9Q04887 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Sox9Q04887 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,13■■■□□ 2,41
Sox9Q04887 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Sox9Q04887 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Sox9Q04887 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Sox9Q04887 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Sox9Q04887 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Sox9Q04887 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Sox9Q04887 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Sox9Q04887 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Sox9Q04887 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Sox9Q04887 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Sox9Q04887 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Sox9Q04887 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Sox9Q04887 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Sox9Q04887 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Sox9Q04887 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Sox9Q04887 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Sox9Q04887 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Sox9Q04887 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Sox9Q04887 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms