Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
LynP25911 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
LynP25911 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LynP25911 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LynP25911 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LynP25911 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
LynP25911 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
LynP25911 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LynP25911 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LynP25911 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LynP25911 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LynP25911 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LynP25911 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LynP25911 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LynP25911 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LynP25911 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
LynP25911 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LynP25911 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LynP25911 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LynP25911 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LynP25911 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LynP25911 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LynP25911 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LynP25911 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LynP25911 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LynP25911 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LynP25911 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LynP25911 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LynP25911 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LynP25911 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LynP25911 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LynP25911 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LynP25911 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LynP25911 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LynP25911 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LynP25911 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LynP25911 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LynP25911 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LynP25911 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LynP25911 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LynP25911 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LynP25911 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LynP25911 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LynP25911 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LynP25911 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LynP25911 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LynP25911 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LynP25911 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LynP25911 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LynP25911 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LynP25911 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LynP25911 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LynP25911 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LynP25911 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LynP25911 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LynP25911 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LynP25911 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LynP25911 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LynP25911 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LynP25911 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LynP25911 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LynP25911 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LynP25911 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LynP25911 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LynP25911 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LynP25911 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LynP25911 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LynP25911 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LynP25911 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LynP25911 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LynP25911 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LynP25911 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LynP25911 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LynP25911 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LynP25911 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LynP25911 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LynP25911 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LynP25911 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LynP25911 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LynP25911 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LynP25911 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LynP25911 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LynP25911 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LynP25911 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LynP25911 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LynP25911 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LynP25911 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LynP25911 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LynP25911 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LynP25911 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LynP25911 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LynP25911 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LynP25911 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LynP25911 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LynP25911 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LynP25911 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LynP25911 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LynP25911 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LynP25911 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LynP25911 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.3 ms